MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes HCC23 chromosome

Total Repeats: 8769

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011660	GAG	2	6	1373986	1373991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_011660	TTCT	2	8	1374436	1374443	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4003	NC_011660	TAG	2	6	1374457	1374462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_011660	TCC	2	6	1376545	1376550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4005	NC_011660	T	7	7	1376561	1376567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_011660	TAAAA	2	10	1376609	1376618	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_011660	A	6	6	1376615	1376620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_011660	ATT	2	6	1380370	1380375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_011660	ATGT	2	8	1380406	1380413	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_011660	CAT	2	6	1380416	1380421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_011660	GTA	2	6	1380472	1380477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_011660	T	6	6	1380484	1380489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_011660	ATC	2	6	1380501	1380506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_011660	CT	3	6	1380554	1380559	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4015	NC_011660	AT	3	6	1380561	1380566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_011660	A	7	7	1380591	1380597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_011660	TAA	2	6	1380626	1380631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_011660	ATT	3	9	1380651	1380659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_011660	ATCA	2	8	1380670	1380677	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4020	NC_011660	AAT	2	6	1380682	1380687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_011660	AGT	2	6	1380719	1380724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_011660	TAA	2	6	1380766	1380771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_011660	AAC	2	6	1380785	1380790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_011660	A	7	7	1380816	1380822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_011660	T	6	6	1380874	1380879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_011660	ATTAT	2	10	1380943	1380952	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_011660	TTC	2	6	1380958	1380963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_011660	ACAA	2	8	1380982	1380989	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4029	NC_011660	T	7	7	1381001	1381007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_011660	GTT	2	6	1381409	1381414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_011660	A	6	6	1381452	1381457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_011660	ATG	2	6	1381543	1381548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_011660	ATA	2	6	1381933	1381938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_011660	TTA	2	6	1381967	1381972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_011660	GTA	2	6	1382010	1382015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_011660	TCA	2	6	1382030	1382035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_011660	TCAT	2	8	1382089	1382096	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4038	NC_011660	TCC	2	6	1382104	1382109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4039	NC_011660	TTA	2	6	1382551	1382556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_011660	GTT	2	6	1382586	1382591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_011660	GCA	2	6	1382668	1382673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_011660	A	7	7	1382688	1382694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_011660	ACT	2	6	1382697	1382702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_011660	T	6	6	1382713	1382718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_011660	TTA	2	6	1382735	1382740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_011660	AT	3	6	1382798	1382803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_011660	TTG	2	6	1382808	1382813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_011660	CAT	2	6	1382839	1382844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_011660	CAATA	2	10	1382877	1382886	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4050	NC_011660	A	6	6	1382888	1382893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_011660	TTCA	2	8	1382917	1382924	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4052	NC_011660	ATA	2	6	1382927	1382932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_011660	ATT	2	6	1382940	1382945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_011660	CATTA	2	10	1382971	1382980	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4055	NC_011660	CCT	2	6	1383665	1383670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4056	NC_011660	AAT	2	6	1383748	1383753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_011660	A	6	6	1383758	1383763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_011660	A	7	7	1383768	1383774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_011660	T	7	7	1383788	1383794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_011660	CTC	2	6	1383837	1383842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4061	NC_011660	A	7	7	1383914	1383920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_011660	GA	3	6	1383921	1383926	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_011660	TC	3	6	1383945	1383950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4064	NC_011660	TTTC	2	8	1383952	1383959	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4065	NC_011660	ATG	2	6	1385616	1385621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_011660	GTC	2	6	1385656	1385661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_011660	T	6	6	1386175	1386180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_011660	TCT	2	6	1386214	1386219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_011660	T	6	6	1386248	1386253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_011660	ACT	2	6	1386266	1386271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_011660	ATAAAA	2	12	1386296	1386307	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_011660	A	7	7	1386304	1386310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_011660	TAT	2	6	1386353	1386358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_011660	GAA	2	6	1386360	1386365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_011660	CTA	2	6	1386411	1386416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_011660	GTATA	2	10	1386434	1386443	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_011660	GA	3	6	1386462	1386467	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_011660	A	6	6	1386522	1386527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_011660	ATAAAC	2	12	1387000	1387011	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4080	NC_011660	TAA	2	6	1387050	1387055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_011660	A	7	7	1387054	1387060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_011660	AATT	2	8	1387063	1387070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_011660	TTG	2	6	1387117	1387122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_011660	TAA	2	6	1387152	1387157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_011660	TAT	2	6	1387167	1387172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_011660	TAT	2	6	1387326	1387331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_011660	A	7	7	1387337	1387343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_011660	ATTT	2	8	1387397	1387404	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_011660	AT	3	6	1387446	1387451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_011660	TA	3	6	1387510	1387515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_011660	CTCCC	2	10	1387673	1387682	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
4092	NC_011660	AATA	2	8	1387719	1387726	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_011660	CAT	2	6	1387796	1387801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_011660	TAA	2	6	1387837	1387842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_011660	TTTTA	2	10	1388086	1388095	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_011660	TAA	2	6	1388105	1388110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_011660	ACT	2	6	1388119	1388124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_011660	ATT	2	6	1388128	1388133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_011660	GTA	2	6	1388135	1388140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_011660	AT	5	10	1388143	1388152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_011660	GGA	2	6	1388165	1388170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_011660	ATTAT	2	10	1388557	1388566	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_011660	T	7	7	1389420	1389426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_011660	A	7	7	1389431	1389437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_011660	TCAT	2	8	1390208	1390215	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4106	NC_011660	T	8	8	1390255	1390262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_011660	A	6	6	1390315	1390320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_011660	TAA	2	6	1390624	1390629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_011660	ATT	2	6	1390637	1390642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_011660	TTTAA	2	10	1390653	1390662	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_011660	ATC	2	6	1390697	1390702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_011660	ACA	2	6	1390718	1390723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_011660	TCC	2	6	1390755	1390760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4114	NC_011660	TA	3	6	1390785	1390790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_011660	T	6	6	1390814	1390819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_011660	ATG	2	6	1390890	1390895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_011660	TTAT	2	8	1390912	1390919	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_011660	A	6	6	1390957	1390962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_011660	TAT	2	6	1392072	1392077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_011660	ATC	2	6	1392904	1392909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_011660	CCT	2	6	1393402	1393407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4122	NC_011660	TCC	2	6	1394687	1394692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4123	NC_011660	A	6	6	1398429	1398434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_011660	T	6	6	1404747	1404752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_011660	CAA	2	6	1404764	1404769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_011660	A	6	6	1404768	1404773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_011660	TAT	2	6	1405404	1405409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_011660	ATTT	2	8	1408179	1408186	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_011660	CCT	2	6	1408187	1408192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4130	NC_011660	CCT	2	6	1412007	1412012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4131	NC_011660	TA	3	6	1412427	1412432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_011660	GTA	2	6	1412506	1412511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_011660	GAAT	2	8	1412548	1412555	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_011660	GTTT	3	12	1412660	1412671	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_011660	AAG	2	6	1412767	1412772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4141	NC_011660	AT	3	6	1413724	1413729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4142	NC_011660	TCC	2	6	1414698	1414703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4149	NC_011660	GCG	2	6	1414987	1414992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4152	NC_011660	TAA	2	6	1415052	1415057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4153	NC_011660	A	7	7	1415056	1415062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4154	NC_011660	T	6	6	1415143	1415148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4155	NC_011660	TAA	2	6	1415172	1415177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4157	NC_011660	TCA	2	6	1415248	1415253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4263	NC_011660	CCT	2	6	1445418	1445423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4265	NC_011660	CTAT	2	8	1445432	1445439	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4266	NC_011660	T	6	6	1445486	1445491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4403	NC_011660	CAT	2	6	1525272	1525277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4404	NC_011660	TAC	2	6	1525381	1525386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4405	NC_011660	CA	3	6	1525415	1525420	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4406	NC_011660	TCT	2	6	1525421	1525426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4407	NC_011660	A	6	6	1525440	1525445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4408	NC_011660	A	6	6	1525457	1525462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4409	NC_011660	TAC	2	6	1525474	1525479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4410	NC_011660	A	6	6	1525481	1525486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4411	NC_011660	TGA	2	6	1526994	1526999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4413	NC_011660	T	6	6	1527056	1527061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4414	NC_011660	TAT	2	6	1527078	1527083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4421	NC_011660	CTTT	2	8	1532427	1532434	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4422	NC_011660	T	7	7	1532436	1532442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4426	NC_011660	TAT	2	6	1532559	1532564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4435	NC_011660	TCC	2	6	1536001	1536006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4442	NC_011660	A	7	7	1536528	1536534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4446	NC_011660	TAT	2	6	1537758	1537763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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