MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes HCC23 chromosome

Total Repeats: 8769

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011660	T	6	6	293059	293064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_011660	TTA	2	6	295343	295348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_011660	TAT	2	6	295357	295362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_011660	AAT	2	6	295401	295406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_011660	TATAT	2	10	295414	295423	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_011660	TTA	2	6	295424	295429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_011660	A	7	7	295439	295445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_011660	TAA	2	6	297151	297156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_011660	T	6	6	297186	297191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_011660	A	6	6	297219	297224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_011660	AATA	2	8	297268	297275	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_011660	T	8	8	297282	297289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_011660	A	7	7	297359	297365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_011660	TTA	2	6	297385	297390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_011660	GAG	2	6	297491	297496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_011660	TGT	2	6	299438	299443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_011660	ATC	2	6	300326	300331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_011660	CTT	2	6	300916	300921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_011660	ATCC	2	8	301000	301007	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1020	NC_011660	TAAT	2	8	301019	301026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_011660	ATTT	2	8	301541	301548	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_011660	T	7	7	301546	301552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_011660	TTA	2	6	305214	305219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_011660	AATG	2	8	305310	305317	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_011660	AAT	2	6	305326	305331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_011660	CTC	2	6	306550	306555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1027	NC_011660	TGA	2	6	306565	306570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_011660	TCC	2	6	307453	307458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_011660	GAAT	2	8	307459	307466	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_011660	CTTTC	2	10	309438	309447	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1031	NC_011660	AGT	2	6	309489	309494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_011660	TCTCC	2	10	310361	310370	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1033	NC_011660	ATA	2	6	310371	310376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_011660	A	7	7	310419	310425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_011660	TAT	2	6	310563	310568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_011660	TAT	2	6	310593	310598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_011660	GATA	2	8	310609	310616	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_011660	GA	3	6	310643	310648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_011660	CCT	2	6	312916	312921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_011660	ATAA	2	8	312930	312937	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_011660	A	6	6	312945	312950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_011660	CTAT	2	8	312951	312958	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1043	NC_011660	AGA	2	6	312961	312966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_011660	TCC	2	6	312988	312993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_011660	TGC	2	6	313001	313006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_011660	TCCC	2	8	313066	313073	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1047	NC_011660	ATT	2	6	313114	313119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_011660	TATG	2	8	314001	314008	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_011660	TGC	2	6	314534	314539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_011660	TTG	2	6	314546	314551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_011660	TA	3	6	314559	314564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_011660	ATT	2	6	314572	314577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_011660	GAA	2	6	314642	314647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_011660	A	6	6	314653	314658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_011660	TAA	2	6	314664	314669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_011660	ATT	2	6	314687	314692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_011660	ATT	2	6	314698	314703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_011660	TGG	2	6	314723	314728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_011660	TG	3	6	314766	314771	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_011660	TTTA	2	8	314777	314784	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_011660	AGA	2	6	314794	314799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_011660	T	6	6	316998	317003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_011660	TTG	2	6	320430	320435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_011660	GGA	2	6	321701	321706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_011660	TAT	2	6	322091	322096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_011660	TTAT	2	8	322100	322107	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_011660	ATA	2	6	322115	322120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_011660	T	7	7	322127	322133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_011660	TAA	2	6	322170	322175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_011660	AGG	2	6	322197	322202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_011660	A	7	7	327155	327161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_011660	T	7	7	327186	327192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_011660	TAAA	2	8	328080	328087	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_011660	AC	3	6	328088	328093	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_011660	GTT	2	6	328100	328105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_011660	AAT	2	6	328108	328113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_011660	CATAA	2	10	328136	328145	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1078	NC_011660	GAAA	2	8	328168	328175	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_011660	TCC	2	6	328745	328750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1080	NC_011660	T	7	7	328826	328832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_011660	ATT	2	6	328839	328844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_011660	T	6	6	328860	328865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_011660	A	7	7	328886	328892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_011660	ACTCC	2	10	329285	329294	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1085	NC_011660	ACC	2	6	329741	329746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1086	NC_011660	TAC	2	6	329767	329772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_011660	TTTAA	2	10	329773	329782	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_011660	TAG	2	6	329813	329818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_011660	ATT	2	6	329826	329831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_011660	TAT	2	6	329857	329862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_011660	AGG	2	6	329880	329885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_011660	CTT	2	6	332405	332410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_011660	T	6	6	332458	332463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_011660	TTTG	2	8	332488	332495	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_011660	TTAT	2	8	332536	332543	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_011660	TG	3	6	332559	332564	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_011660	AAG	2	6	332575	332580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_011660	T	6	6	334615	334620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_011660	AGG	2	6	334720	334725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_011660	T	6	6	335105	335110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_011660	TGC	2	6	335114	335119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_011660	CTTTA	2	10	335987	335996	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1103	NC_011660	ATG	2	6	336013	336018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_011660	AT	3	6	336020	336025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_011660	AAT	2	6	336043	336048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_011660	CTT	2	6	336836	336841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_011660	T	6	6	336840	336845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_011660	TAA	2	6	336877	336882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_011660	ATA	2	6	336893	336898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_011660	AGA	2	6	337615	337620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_011660	A	6	6	337656	337661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_011660	A	6	6	337690	337695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_011660	TAA	2	6	337699	337704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_011660	A	6	6	337715	337720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_011660	AGG	2	6	337741	337746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_011660	TTGG	2	8	340395	340402	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_011660	CTT	2	6	341168	341173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_011660	T	7	7	341172	341178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_011660	AT	3	6	341477	341482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_011660	A	7	7	341503	341509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_011660	GGAA	2	8	341510	341517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_011660	GAA	2	6	341531	341536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_011660	ATA	2	6	341568	341573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_011660	TG	3	6	341594	341599	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_011660	A	6	6	341648	341653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_011660	TAG	2	6	341655	341660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_011660	GAA	2	6	341686	341691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_011660	ACAGAG	2	12	341697	341708	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1129	NC_011660	AACT	2	8	341725	341732	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1130	NC_011660	GGA	2	6	342971	342976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_011660	GCA	2	6	343922	343927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_011660	ATT	2	6	343955	343960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_011660	TTTA	2	8	343980	343987	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_011660	TTTG	2	8	344016	344023	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_011660	TAT	2	6	344029	344034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_011660	TAAA	2	8	344041	344048	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_011660	GCT	2	6	344066	344071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1139	NC_011660	T	6	6	344090	344095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1420	NC_011660	T	7	7	425347	425353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_011660	A	6	6	425365	425370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1455	NC_011660	T	7	7	431231	431237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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