MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei BL23 chromosome

Total Repeats: 149

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010999	CTATTA	2	12	1543	1554	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_010999	AAAAGT	2	12	3350	3361	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010999	TTCTTT	2	12	52203	52214	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_010999	CAATAA	2	12	66541	66552	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_010999	AACTGA	2	12	67130	67141	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_010999	GCAACC	2	12	71111	71122	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_010999	TGATCT	2	12	76422	76433	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_010999	TGATCT	2	12	79123	79134	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_010999	GGAGAA	2	12	80301	80312	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010999	AAAAAT	2	12	81486	81497	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010999	AATATA	2	12	88748	88759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010999	TAGGGG	2	12	90272	90283	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010999	GGCAAT	2	12	91034	91045	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_010999	TCCCCA	2	12	91138	91149	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_010999	GTTTTT	2	12	91197	91208	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010999	GCTAAG	2	12	94011	94022	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_010999	TAGTTA	2	12	94201	94212	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010999	TCGCAG	2	12	136494	136505	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010999	GTGAGC	2	12	141595	141606	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_010999	TGGGTA	2	12	146277	146288	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010999	TATTTT	2	12	147371	147382	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010999	GTGATG	2	12	149796	149807	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010999	GAATAA	2	12	155441	155452	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010999	TGACAA	2	12	169212	169223	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_010999	ATCAAA	2	12	173904	173915	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_010999	TAAAAA	2	12	174157	174168	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010999	GGGCAA	2	12	223788	223799	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_010999	TGGAAG	2	12	263497	263508	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010999	CTGCGA	2	12	263586	263597	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010999	TAAAAA	2	12	292236	292247	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010999	CTGCGA	2	12	307898	307909	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010999	TTGTAA	2	12	352707	352718	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010999	ATATTG	2	12	368436	368447	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010999	TCTTTT	2	12	369350	369361	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_010999	CCGGTT	2	12	375729	375740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010999	AAAATA	2	12	399027	399038	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010999	AATTTT	2	12	410393	410404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010999	CTCTAT	2	12	466481	466492	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010999	TGAAGA	2	12	479950	479961	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010999	ATTTGT	2	12	483565	483576	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010999	ACCTGA	2	12	501837	501848	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010999	CAACAT	2	12	562680	562691	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010999	TCTAAA	2	12	627207	627218	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_010999	GAAACG	2	12	656942	656953	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_010999	GAAAAA	2	12	723703	723714	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010999	AAAACA	2	12	728783	728794	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_010999	GAGGAT	2	12	736921	736932	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010999	TCGCAG	2	12	760589	760600	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010999	CTGCGA	2	12	763578	763589	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010999	TCGCAG	2	12	798935	798946	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010999	TCGCAG	2	12	827330	827341	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010999	AAAATA	2	12	830252	830263	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010999	TGGAAG	2	12	891016	891027	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010999	CTGCGA	2	12	891105	891116	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010999	TGTTAT	2	12	892123	892134	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010999	TATACT	2	12	899166	899177	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_010999	TGGAAG	2	12	912694	912705	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010999	CTGCGA	2	12	912783	912794	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010999	TCGCAG	2	12	921097	921108	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010999	TCGCAG	2	12	921221	921232	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010999	TATTTT	2	12	969518	969529	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010999	CTGCGA	2	12	995147	995158	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010999	AAAAAT	2	12	1055871	1055882	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010999	TTTAGT	2	12	1164731	1164742	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010999	TGAATT	2	12	1198315	1198326	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010999	CTGCGA	2	12	1203627	1203638	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010999	CCGACA	2	12	1207203	1207214	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
68	NC_010999	GAAAAG	2	12	1301180	1301191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010999	AACGAA	2	12	1357901	1357912	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_010999	TCCACC	2	12	1377062	1377073	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_010999	AGCGCA	2	12	1442445	1442456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010999	TGAAAA	2	12	1509623	1509634	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010999	GATAGT	2	12	1527990	1528001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010999	TCGCAG	2	12	1561865	1561876	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010999	AGGATG	2	12	1563999	1564010	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010999	TCGCAG	2	12	1594572	1594583	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010999	CGAAAA	2	12	1594625	1594636	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_010999	GATCAG	2	12	1594859	1594870	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_010999	TCGCAG	2	12	1621106	1621117	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_010999	TTAGTT	2	12	1640878	1640889	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010999	TTTGTC	2	12	1677814	1677825	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_010999	TTTTGA	2	12	1685354	1685365	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010999	GCACGC	2	12	1701432	1701443	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
84	NC_010999	AATGCT	2	12	1705971	1705982	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_010999	ACAGGT	2	12	1710921	1710932	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_010999	CTGCGA	2	12	1780276	1780287	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010999	CCTGCC	2	12	1805348	1805359	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_010999	TCTTTG	2	12	1827553	1827564	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_010999	TCGCCA	2	12	1913633	1913644	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_010999	ATCAAA	2	12	1916189	1916200	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_010999	TTGTTT	2	12	1926457	1926468	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010999	TTACGA	2	12	1939902	1939913	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_010999	TCGCAG	2	12	1986457	1986468	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_010999	CACTTC	2	12	1986620	1986631	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_010999	ATTGTT	2	12	1995218	1995229	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010999	CATGGT	2	12	2004720	2004731	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_010999	GACATG	2	12	2042488	2042499	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_010999	TAACCT	2	12	2052691	2052702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010999	CTTTCA	2	12	2055753	2055764	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010999	ACCGCT	2	12	2066130	2066141	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
101	NC_010999	GATAGC	2	12	2127129	2127140	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_010999	ATAACA	2	12	2129083	2129094	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_010999	AAATAA	2	12	2151683	2151694	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010999	TGAATC	2	12	2189075	2189086	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_010999	TCGCAG	2	12	2197745	2197756	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010999	CTGCGA	2	12	2246631	2246642	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_010999	ATTTTA	2	12	2266618	2266629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010999	TCATTT	2	12	2273613	2273624	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_010999	GATATG	2	12	2279075	2279086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010999	ATTTAA	2	12	2288238	2288249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010999	AAATTG	2	12	2298894	2298905	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010999	CTGCGA	2	12	2315674	2315685	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_010999	GAGACC	2	12	2327739	2327750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010999	CATCAA	2	12	2343938	2343949	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_010999	TATTTT	2	12	2355055	2355066	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010999	GTGAGC	2	12	2374801	2374812	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_010999	TTCGCA	2	12	2389744	2389755	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_010999	TAACAA	2	12	2429895	2429906	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_010999	CATGAA	2	12	2438920	2438931	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_010999	AATTTA	2	12	2441251	2441262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010999	AAATTA	2	12	2461822	2461833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010999	GTCTTC	2	12	2472032	2472043	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_010999	TTTAGA	2	12	2509254	2509265	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010999	CTTGTT	2	12	2522834	2522845	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_010999	TACAGT	2	12	2532685	2532696	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_010999	ACATAT	2	12	2549039	2549050	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_010999	AACGGC	2	12	2617984	2617995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_010999	TCGCAG	2	12	2627688	2627699	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_010999	TTTGAC	2	12	2638506	2638517	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_010999	TCGCAG	2	12	2639601	2639612	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_010999	CACTTC	2	12	2639764	2639775	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_010999	TTTCAT	2	12	2685948	2685959	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_010999	TTAAGA	2	12	2688263	2688274	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010999	AAAAAC	2	12	2694317	2694328	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_010999	ATGACC	2	12	2733196	2733207	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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137	NC_010999	AAATTT	2	12	2786679	2786690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_010999	CGCAGG	2	12	2817598	2817609	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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141	NC_010999	TCGCAG	2	12	2875179	2875190	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_010999	TTTTCG	2	12	2893853	2893864	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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144	NC_010999	ATTTCC	2	12	2955391	2955402	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_010999	TCGCAG	2	12	2962530	2962541	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_010999	TCGCAG	2	12	2980862	2980873	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_010999	GTGAGC	2	12	2981864	2981875	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_010999	TTTCTA	2	12	3061068	3061079	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_010999	TACTGC	2	12	3061150	3061161	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.