MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei BL23 chromosome

Total Repeats: 9401

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010999	GAT	2	6	889989	889994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_010999	CGG	2	6	890080	890085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_010999	GA	3	6	890178	890183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_010999	TAGG	2	8	890296	890303	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_010999	TGG	2	6	890342	890347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_010999	TAC	2	6	890350	890355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_010999	CCT	2	6	890438	890443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3008	NC_010999	GGT	2	6	890574	890579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_010999	CGT	2	6	890769	890774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_010999	GAG	2	6	890818	890823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_010999	GCC	2	6	890877	890882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3012	NC_010999	C	6	6	890945	890950	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3013	NC_010999	GAGAT	2	10	890953	890962	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_010999	GA	3	6	890993	890998	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_010999	TGGAAG	2	12	891016	891027	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_010999	CTGCGA	2	12	891105	891116	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_010999	GCA	2	6	891150	891155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_010999	GTG	2	6	891202	891207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_010999	AAG	2	6	891216	891221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_010999	CTT	2	6	891258	891263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_010999	AGT	2	6	891273	891278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_010999	TGG	2	6	891279	891284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_010999	CTGC	2	8	891289	891296	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3024	NC_010999	GGA	2	6	891326	891331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_010999	TCC	2	6	891392	891397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3026	NC_010999	ATT	2	6	891478	891483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_010999	GGC	2	6	891494	891499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_010999	AAT	2	6	891595	891600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_010999	AGT	2	6	891626	891631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_010999	TGG	2	6	891657	891662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_010999	C	7	7	891991	891997	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3032	NC_010999	GGT	2	6	892096	892101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_010999	TGTTAT	2	12	892123	892134	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_010999	TCG	2	6	892159	892164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_010999	GCCT	2	8	892242	892249	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3036	NC_010999	TGT	2	6	892426	892431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_010999	GGT	2	6	892521	892526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_010999	CCT	2	6	892651	892656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3039	NC_010999	CGG	2	6	892704	892709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_010999	TCG	2	6	892874	892879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_010999	GCCT	2	8	892957	892964	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3042	NC_010999	TC	4	8	893005	893012	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3043	NC_010999	GA	3	6	893017	893022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_010999	CGG	2	6	893095	893100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_010999	GGA	2	6	893125	893130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_010999	CGG	2	6	893150	893155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_010999	TCC	2	6	893199	893204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3048	NC_010999	CTA	2	6	893271	893276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_010999	AC	3	6	893315	893320	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3050	NC_010999	TCG	2	6	893533	893538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_010999	AG	3	6	893579	893584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_010999	TAT	2	6	893587	893592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_010999	CG	3	6	893629	893634	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3054	NC_010999	T	9	9	893711	893719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_010999	CAAA	2	8	893739	893746	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3056	NC_010999	TCC	2	6	893803	893808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3057	NC_010999	AAG	2	6	893827	893832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_010999	GGA	2	6	893836	893841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_010999	GAAA	2	8	894381	894388	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_010999	CTTT	2	8	894415	894422	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3061	NC_010999	T	6	6	894444	894449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_010999	TACA	2	8	896064	896071	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3063	NC_010999	A	6	6	896092	896097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_010999	AC	3	6	896159	896164	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3065	NC_010999	A	7	7	896166	896172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_010999	CTT	2	6	896182	896187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_010999	T	6	6	896220	896225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_010999	TGC	2	6	896255	896260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_010999	TCC	3	9	896824	896832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3070	NC_010999	T	6	6	896904	896909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_010999	ACA	2	6	896958	896963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_010999	T	7	7	896975	896981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_010999	T	9	9	896987	896995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_010999	GGT	2	6	897064	897069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_010999	TTA	2	6	897081	897086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_010999	A	6	6	897114	897119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_010999	A	6	6	897176	897181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_010999	AAT	2	6	897236	897241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_010999	T	6	6	897286	897291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_010999	TTC	2	6	897310	897315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_010999	ATA	2	6	897327	897332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_010999	AGTT	2	8	897348	897355	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_010999	A	6	6	898932	898937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_010999	ATC	2	6	898960	898965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3085	NC_010999	T	6	6	898972	898977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_010999	ATG	2	6	898981	898986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_010999	GCC	2	6	899028	899033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3088	NC_010999	GGT	2	6	899034	899039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_010999	TGA	2	6	899089	899094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_010999	TATACT	2	12	899166	899177	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3091	NC_010999	GAG	2	6	901447	901452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_010999	AGGG	2	8	902494	902501	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_010999	ATAA	2	8	902871	902878	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_010999	TGCAA	2	10	904177	904186	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3095	NC_010999	AG	3	6	904203	904208	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_010999	GGT	2	6	904335	904340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_010999	AGG	2	6	904353	904358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_010999	CTT	2	6	904752	904757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_010999	AGC	2	6	906986	906991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_010999	GCG	2	6	906997	907002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_010999	GCT	2	6	907006	907011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_010999	GCT	2	6	907062	907067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_010999	GTAA	2	8	907082	907089	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_010999	GAT	2	6	907130	907135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_010999	AGG	2	6	907149	907154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_010999	TTG	2	6	907654	907659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_010999	CAA	2	6	907681	907686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_010999	A	7	7	907736	907742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_010999	ATT	2	6	907775	907780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_010999	TAA	2	6	907854	907859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_010999	GTT	2	6	907871	907876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_010999	GTC	2	6	907916	907921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_010999	AAC	2	6	908017	908022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_010999	GGC	2	6	908087	908092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_010999	TGA	2	6	908127	908132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_010999	TGGA	2	8	908299	908306	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_010999	GAT	2	6	908352	908357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3119	NC_010999	CGC	2	6	908472	908477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3120	NC_010999	GTGA	2	8	908478	908485	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_010999	TGT	2	6	908511	908516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_010999	GAA	2	6	908521	908526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_010999	TGT	2	6	908543	908548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_010999	CAG	2	6	908593	908598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_010999	AGCG	2	8	908648	908655	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3126	NC_010999	T	6	6	908663	908668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_010999	AGA	2	6	908734	908739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_010999	AT	3	6	908778	908783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_010999	GAA	2	6	908785	908790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_010999	GGC	2	6	908804	908809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_010999	GTCTG	2	10	908811	908820	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3132	NC_010999	GAA	2	6	909048	909053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_010999	GA	3	6	909086	909091	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_010999	GGT	2	6	909122	909127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3136	NC_010999	TCGTG	2	10	909145	909154	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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