MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei BL23 chromosome

Total Repeats: 9401

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010999	CAT	2	6	437633	437638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_010999	ATT	2	6	437656	437661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_010999	TAT	2	6	437709	437714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_010999	AT	3	6	438124	438129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_010999	GCT	2	6	438133	438138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_010999	ATG	2	6	438140	438145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_010999	GTT	2	6	438152	438157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_010999	CTT	2	6	438259	438264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_010999	ATT	2	6	438269	438274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_010999	ACC	2	6	440882	440887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1511	NC_010999	TTA	2	6	440934	440939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_010999	TTG	2	6	440976	440981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_010999	AG	3	6	440994	440999	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_010999	AGGG	2	8	441026	441033	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_010999	AAT	2	6	441070	441075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_010999	GAT	2	6	441151	441156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_010999	TCA	2	6	442180	442185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_010999	A	7	7	442236	442242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_010999	GAA	2	6	443985	443990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_010999	T	6	6	444322	444327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_010999	CAT	2	6	444328	444333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_010999	CAA	2	6	444334	444339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_010999	CAAA	2	8	444459	444466	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1524	NC_010999	GAAG	2	8	444512	444519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_010999	AGC	2	6	444587	444592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_010999	AGA	2	6	444671	444676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_010999	CAAA	2	8	444752	444759	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1528	NC_010999	CA	3	6	444766	444771	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1529	NC_010999	CTTT	2	8	444997	445004	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1530	NC_010999	CAC	2	6	445039	445044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1531	NC_010999	CAC	2	6	445062	445067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1532	NC_010999	CTG	2	6	445084	445089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_010999	GAC	2	6	445120	445125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_010999	TTTA	2	8	445165	445172	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_010999	ATT	2	6	445226	445231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_010999	AGC	2	6	445264	445269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_010999	AAAT	2	8	445272	445279	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_010999	ACG	2	6	445294	445299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_010999	TCG	2	6	445311	445316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_010999	GGC	2	6	445349	445354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_010999	CCT	2	6	446069	446074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1542	NC_010999	CAA	2	6	446899	446904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_010999	ATT	2	6	446920	446925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_010999	GAG	3	9	447015	447023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_010999	TCA	2	6	448265	448270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_010999	TGA	2	6	448271	448276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_010999	AAGA	2	8	448298	448305	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_010999	CAA	2	6	451666	451671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_010999	ACA	2	6	451680	451685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_010999	T	6	6	451703	451708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_010999	A	7	7	455806	455812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_010999	ACC	2	6	455860	455865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1553	NC_010999	CAA	2	6	455898	455903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_010999	CTCTT	2	10	456048	456057	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1555	NC_010999	ATG	2	6	456074	456079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_010999	GT	3	6	456107	456112	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_010999	ATTT	2	8	456146	456153	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_010999	GTC	2	6	456187	456192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_010999	T	6	6	456194	456199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_010999	ATG	2	6	457487	457492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_010999	A	6	6	457526	457531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_010999	T	6	6	457539	457544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_010999	TATC	2	8	457553	457560	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1564	NC_010999	ATTA	2	8	457572	457579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_010999	TGG	2	6	457632	457637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_010999	T	6	6	457669	457674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_010999	T	7	7	457679	457685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_010999	CG	3	6	457704	457709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1569	NC_010999	AACT	2	8	457803	457810	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1570	NC_010999	TAAAC	2	10	457822	457831	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1571	NC_010999	ATG	2	6	458499	458504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_010999	CTA	2	6	458527	458532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_010999	GC	3	6	458534	458539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1574	NC_010999	AGG	2	6	458558	458563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_010999	A	6	6	459651	459656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_010999	TTA	2	6	459686	459691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_010999	TCAG	2	8	459698	459705	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1578	NC_010999	T	6	6	459791	459796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_010999	TAAA	2	8	459838	459845	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_010999	ATA	2	6	459928	459933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_010999	GTT	2	6	459939	459944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_010999	TAG	2	6	459992	459997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_010999	CAG	2	6	460827	460832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_010999	CTTG	2	8	460845	460852	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1585	NC_010999	AG	3	6	461519	461524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_010999	AGCA	2	8	461529	461536	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1587	NC_010999	T	7	7	461617	461623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_010999	CAC	2	6	461752	461757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1589	NC_010999	A	6	6	464035	464040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_010999	GAT	2	6	464057	464062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_010999	T	7	7	464121	464127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_010999	CTTG	2	8	464792	464799	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1593	NC_010999	ATTA	2	8	464804	464811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_010999	TG	3	6	464844	464849	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_010999	A	6	6	464859	464864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_010999	CAA	2	6	464878	464883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_010999	TTGT	2	8	464907	464914	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_010999	CAT	2	6	465033	465038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_010999	TCC	2	6	466441	466446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1600	NC_010999	GTA	2	6	466454	466459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_010999	CTCTAT	2	12	466481	466492	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_010999	GAC	2	6	466525	466530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_010999	AATT	2	8	466531	466538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_010999	ATTT	2	8	466547	466554	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_010999	ACG	2	6	466592	466597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_010999	T	7	7	466653	466659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_010999	A	6	6	466715	466720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_010999	CATT	2	8	466759	466766	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1609	NC_010999	GCT	2	6	467707	467712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_010999	ATC	2	6	467805	467810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_010999	GTC	2	6	467859	467864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_010999	TTG	3	9	467872	467880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_010999	AAG	2	6	467889	467894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_010999	AAC	2	6	468243	468248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_010999	GTG	2	6	468276	468281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_010999	A	6	6	468367	468372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_010999	TAT	2	6	468400	468405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_010999	GGA	2	6	468426	468431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_010999	T	6	6	469452	469457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_010999	GGA	2	6	469488	469493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_010999	GAA	2	6	470010	470015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_010999	CG	3	6	470016	470021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1623	NC_010999	AGG	2	6	470022	470027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_010999	ATG	2	6	471691	471696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_010999	TCTGG	2	10	474015	474024	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1626	NC_010999	AGG	2	6	474038	474043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_010999	GAGT	2	8	476152	476159	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_010999	TCT	2	6	476182	476187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1630	NC_010999	AGC	2	6	476297	476302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_010999	TTG	2	6	479912	479917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_010999	TGAAGA	2	12	479950	479961	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_010999	GTAG	2	8	479988	479995	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_010999	ATAA	2	8	480002	480009	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_010999	GCC	2	6	480010	480015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1637	NC_010999	GCTCG	2	10	480070	480079	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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