MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei BL23 chromosome

Total Repeats: 9401

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010999	TCG	2	6	279063	279068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_010999	ACG	2	6	279094	279099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_010999	A	6	6	279100	279105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_010999	TC	3	6	279148	279153	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1005	NC_010999	T	6	6	279186	279191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_010999	CAT	2	6	279279	279284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_010999	TCC	2	6	279485	279490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1008	NC_010999	AAT	2	6	279610	279615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_010999	T	6	6	279629	279634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_010999	CAC	2	6	279670	279675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_010999	T	6	6	279887	279892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_010999	TAC	2	6	279906	279911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_010999	CAG	2	6	279937	279942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_010999	ATA	2	6	280143	280148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_010999	GCA	2	6	280172	280177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_010999	CGA	2	6	280240	280245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_010999	A	6	6	280245	280250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_010999	T	6	6	280270	280275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_010999	AAC	2	6	280340	280345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_010999	A	7	7	280373	280379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_010999	TTG	2	6	280419	280424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_010999	GCT	2	6	280453	280458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_010999	CCT	2	6	280580	280585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_010999	T	6	6	280668	280673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_010999	AAG	2	6	280725	280730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_010999	TAG	2	6	280734	280739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_010999	GAT	2	6	280746	280751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_010999	AAAG	2	8	282174	282181	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_010999	TTA	2	6	282238	282243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_010999	A	6	6	282279	282284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_010999	CTTG	2	8	286217	286224	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1032	NC_010999	GTTA	2	8	286230	286237	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_010999	ACAT	2	8	286248	286255	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1034	NC_010999	CCGG	2	8	286326	286333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1035	NC_010999	ATA	2	6	286423	286428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_010999	CGG	2	6	286452	286457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_010999	TTTA	2	8	287801	287808	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_010999	AAG	2	6	287809	287814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_010999	TTGC	2	8	287831	287838	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1040	NC_010999	T	6	6	287849	287854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_010999	TGCT	2	8	287865	287872	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1042	NC_010999	GTG	2	6	287873	287878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_010999	ATG	2	6	287883	287888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_010999	GCT	2	6	288592	288597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_010999	CAA	2	6	288649	288654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_010999	AAT	2	6	288711	288716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_010999	TTGAA	2	10	288760	288769	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_010999	TTG	2	6	288793	288798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_010999	TTG	2	6	288815	288820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_010999	AGG	2	6	288838	288843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_010999	AAT	2	6	290570	290575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_010999	TGA	2	6	290664	290669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_010999	GAT	2	6	290687	290692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_010999	AAT	2	6	290735	290740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_010999	ACG	2	6	290841	290846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_010999	AGC	2	6	290851	290856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_010999	ATGA	2	8	290896	290903	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_010999	GAT	2	6	290904	290909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_010999	TCA	2	6	290917	290922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_010999	TCTGA	2	10	290951	290960	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1061	NC_010999	A	6	6	290972	290977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_010999	ATC	2	6	291970	291975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_010999	T	7	7	292040	292046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_010999	A	6	6	292077	292082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_010999	ATT	2	6	292118	292123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_010999	T	7	7	292184	292190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_010999	TGT	2	6	292207	292212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_010999	TAAAAA	2	12	292236	292247	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_010999	TGGT	2	8	292296	292303	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_010999	ATA	2	6	293040	293045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_010999	AGG	2	6	293092	293097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_010999	GAA	2	6	293100	293105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_010999	AGC	2	6	294307	294312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_010999	AGG	2	6	294331	294336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_010999	GT	3	6	295548	295553	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_010999	GCA	2	6	295568	295573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_010999	ATGA	2	8	295583	295590	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_010999	AGG	2	6	295592	295597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_010999	AAT	2	6	300167	300172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_010999	CTTA	2	8	300175	300182	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1081	NC_010999	TTGA	2	8	300221	300228	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_010999	AATC	2	8	300280	300287	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1083	NC_010999	TCG	2	6	301606	301611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_010999	T	7	7	301626	301632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_010999	AGA	2	6	301633	301638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_010999	A	6	6	303434	303439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_010999	AGC	2	6	303459	303464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_010999	TAT	2	6	303480	303485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_010999	AAT	2	6	303491	303496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_010999	AT	3	6	303499	303504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_010999	CCT	2	6	305513	305518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_010999	GC	3	6	305539	305544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1093	NC_010999	ACCAG	2	10	305569	305578	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1094	NC_010999	GC	3	6	305681	305686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1095	NC_010999	TCC	2	6	307407	307412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1096	NC_010999	CTGCGA	2	12	307898	307909	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_010999	AGCC	2	8	307933	307940	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_010999	AACC	2	8	310938	310945	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1099	NC_010999	TGT	2	6	310966	310971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_010999	AAC	2	6	311062	311067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_010999	TAA	2	6	311126	311131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_010999	AAT	2	6	311136	311141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_010999	GTT	2	6	311151	311156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_010999	TGT	2	6	311181	311186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_010999	GCA	2	6	311198	311203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_010999	CAAA	2	8	311225	311232	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1107	NC_010999	A	6	6	311230	311235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_010999	GAT	2	6	311246	311251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_010999	TGAT	2	8	311278	311285	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_010999	ATTGC	2	10	312590	312599	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1111	NC_010999	AAC	2	6	314319	314324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_010999	CAT	2	6	314344	314349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_010999	T	6	6	314387	314392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_010999	CG	3	6	314404	314409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_010999	GCG	2	6	314506	314511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_010999	CCT	2	6	315204	315209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_010999	ATG	2	6	315219	315224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_010999	TAA	2	6	315227	315232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_010999	ATA	2	6	315258	315263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_010999	AT	3	6	315292	315297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_010999	T	6	6	315344	315349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_010999	GGT	2	6	315433	315438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_010999	AG	3	6	315447	315452	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_010999	GTG	3	9	315453	315461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_010999	GAA	2	6	315491	315496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_010999	ACG	2	6	315532	315537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_010999	TG	3	6	315547	315552	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_010999	CGTG	2	8	315557	315564	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1129	NC_010999	TGG	2	6	315569	315574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_010999	CTA	2	6	315613	315618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_010999	CGG	2	6	315788	315793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_010999	T	6	6	315831	315836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_010999	TAG	2	6	316031	316036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_010999	GAT	2	6	316304	316309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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