MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei BL23 chromosome

Total Repeats: 9401

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_010999	TTTG	2	8	1836516	1836523	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_010999	TCT	2	6	1836546	1836551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_010999	TGT	2	6	1836577	1836582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_010999	CTA	2	6	1836588	1836593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_010999	TGC	2	6	1836646	1836651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_010999	TG	3	6	1838077	1838082	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_010999	TGTT	2	8	1838122	1838129	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_010999	TGA	2	6	1838153	1838158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_010999	A	6	6	1838193	1838198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_010999	T	6	6	1840563	1840568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_010999	AATA	2	8	1840727	1840734	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_010999	CCT	2	6	1842204	1842209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5513	NC_010999	CATT	2	8	1842210	1842217	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5514	NC_010999	TTC	2	6	1842294	1842299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_010999	A	7	7	1842314	1842320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_010999	CGC	2	6	1842326	1842331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5517	NC_010999	ACAG	2	8	1842341	1842348	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5518	NC_010999	TCA	2	6	1842672	1842677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_010999	CAA	2	6	1842699	1842704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_010999	CTA	2	6	1842730	1842735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_010999	TTACC	2	10	1842796	1842805	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5522	NC_010999	CCT	2	6	1843385	1843390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5523	NC_010999	TCA	2	6	1843456	1843461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_010999	GC	3	6	1843493	1843498	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5525	NC_010999	GCC	2	6	1844651	1844656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5526	NC_010999	ATC	2	6	1844671	1844676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_010999	CTC	2	6	1847355	1847360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5528	NC_010999	GGCA	2	8	1847371	1847378	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5529	NC_010999	CCG	2	6	1847431	1847436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5530	NC_010999	T	6	6	1847480	1847485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_010999	TTATA	2	10	1849159	1849168	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_010999	CT	3	6	1849273	1849278	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5533	NC_010999	AAG	2	6	1849296	1849301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_010999	TTC	2	6	1849321	1849326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_010999	TGAA	2	8	1849387	1849394	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_010999	ATC	2	6	1849418	1849423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_010999	AGC	2	6	1849460	1849465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_010999	AGG	3	9	1849518	1849526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_010999	TA	3	6	1853719	1853724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_010999	TCC	2	6	1854147	1854152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5541	NC_010999	TCAAA	2	10	1854153	1854162	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5542	NC_010999	TCC	2	6	1854383	1854388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5543	NC_010999	GTT	2	6	1854972	1854977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_010999	A	6	6	1855000	1855005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_010999	CTTT	2	8	1856256	1856263	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5546	NC_010999	GT	3	6	1856268	1856273	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_010999	AAC	2	6	1856362	1856367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_010999	ATGA	2	8	1856374	1856381	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_010999	AAT	2	6	1856982	1856987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_010999	TTCC	2	8	1857058	1857065	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5551	NC_010999	TTGA	2	8	1857070	1857077	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_010999	T	6	6	1859079	1859084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_010999	GAA	2	6	1859086	1859091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_010999	A	6	6	1859095	1859100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_010999	GAT	2	6	1861941	1861946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_010999	TTA	2	6	1862448	1862453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_010999	GCT	2	6	1866599	1866604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_010999	AGTT	2	8	1866619	1866626	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_010999	ATG	2	6	1867504	1867509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_010999	GTCA	2	8	1867516	1867523	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5561	NC_010999	TAT	2	6	1867541	1867546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_010999	CAA	2	6	1867586	1867591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_010999	AAT	2	6	1871438	1871443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_010999	AAAAG	2	10	1871518	1871527	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_010999	T	6	6	1871553	1871558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_010999	ATG	2	6	1872645	1872650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_010999	CAA	2	6	1872698	1872703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_010999	CA	3	6	1872713	1872718	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5569	NC_010999	AGA	2	6	1872743	1872748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_010999	TCA	2	6	1872817	1872822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5571	NC_010999	T	6	6	1873908	1873913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_010999	ATGA	2	8	1873915	1873922	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_010999	CTTG	2	8	1873924	1873931	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5574	NC_010999	GCA	2	6	1873935	1873940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_010999	ACT	2	6	1874723	1874728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5577	NC_010999	TGATA	2	10	1876959	1876968	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_010999	A	6	6	1876991	1876996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_010999	GCA	2	6	1877014	1877019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5580	NC_010999	ATTA	2	8	1877843	1877850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_010999	TG	3	6	1877874	1877879	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_010999	TAG	2	6	1877910	1877915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5584	NC_010999	AATT	2	8	1878898	1878905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_010999	AATG	2	8	1878941	1878948	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_010999	TTGT	2	8	1878957	1878964	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_010999	A	7	7	1878972	1878978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_010999	ACTG	2	8	1879044	1879051	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5589	NC_010999	GTC	2	6	1880029	1880034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5590	NC_010999	ACT	2	6	1880056	1880061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5592	NC_010999	TGGT	2	8	1880213	1880220	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_010999	CAC	2	6	1880238	1880243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5595	NC_010999	AGC	2	6	1883764	1883769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5596	NC_010999	TG	3	6	1883781	1883786	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_010999	TTG	2	6	1883821	1883826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5599	NC_010999	TTG	2	6	1884335	1884340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_010999	AGTC	2	8	1884347	1884354	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5601	NC_010999	TCC	2	6	1886173	1886178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5602	NC_010999	ATG	3	9	1886183	1886191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_010999	A	6	6	1886197	1886202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_010999	TC	3	6	1886210	1886215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5605	NC_010999	GC	3	6	1886294	1886299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5606	NC_010999	CGA	2	6	1886395	1886400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5609	NC_010999	TGA	2	6	1886534	1886539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_010999	A	6	6	1886541	1886546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_010999	AAG	2	6	1886609	1886614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_010999	TCA	2	6	1887239	1887244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5613	NC_010999	AAG	2	6	1887249	1887254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_010999	T	6	6	1887277	1887282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_010999	AATCG	2	10	1887310	1887319	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5616	NC_010999	GT	3	6	1887375	1887380	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_010999	TCA	2	6	1887412	1887417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5618	NC_010999	AAT	2	6	1887518	1887523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_010999	A	6	6	1890309	1890314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_010999	TGC	2	6	1891044	1891049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5621	NC_010999	TAC	2	6	1891101	1891106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5622	NC_010999	GC	3	6	1891168	1891173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5623	NC_010999	GCTC	2	8	1891723	1891730	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5624	NC_010999	GTATA	2	10	1891765	1891774	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_010999	T	6	6	1891817	1891822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_010999	CAA	2	6	1891871	1891876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5627	NC_010999	AATA	2	8	1891895	1891902	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5628	NC_010999	TAA	2	6	1891913	1891918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_010999	TCCT	2	8	1892716	1892723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5630	NC_010999	GGT	2	6	1892765	1892770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5631	NC_010999	T	6	6	1893341	1893346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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