MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus fermentum IFO 3956

Total Repeats: 480

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010610	AG	3	6	23311	23316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010610	TC	3	6	34605	34610	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_010610	CG	3	6	35884	35889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_010610	GC	3	6	40384	40389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_010610	GA	3	6	40521	40526	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010610	CA	3	6	55520	55525	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_010610	GT	3	6	57270	57275	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010610	AG	3	6	61119	61124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010610	AG	3	6	67453	67458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010610	GA	3	6	67693	67698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010610	GC	3	6	71872	71877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_010610	AC	3	6	73627	73632	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_010610	AG	3	6	85396	85401	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010610	AG	3	6	86899	86904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010610	AG	3	6	92875	92880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010610	AG	3	6	93075	93080	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010610	AT	3	6	104701	104706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010610	AT	3	6	106026	106031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010610	GA	3	6	125677	125682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010610	TC	3	6	130404	130409	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_010610	GA	3	6	136383	136388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010610	GA	3	6	137829	137834	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010610	TA	3	6	140535	140540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010610	AG	3	6	144128	144133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010610	GA	3	6	149043	149048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010610	GA	3	6	163624	163629	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010610	TA	3	6	169035	169040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010610	GA	3	6	169713	169718	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010610	AG	3	6	169990	169995	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010610	AT	3	6	170120	170125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010610	AC	3	6	170641	170646	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_010610	AC	3	6	170810	170815	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_010610	TC	3	6	171552	171557	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_010610	TC	3	6	172014	172019	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_010610	AT	3	6	172214	172219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010610	GA	3	6	173179	173184	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010610	GA	3	6	176662	176667	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010610	CG	3	6	177849	177854	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_010610	GT	3	6	178458	178463	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010610	GT	3	6	180629	180634	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010610	TG	3	6	181539	181544	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010610	GA	3	6	192240	192245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010610	GA	3	6	193342	193347	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010610	GA	3	6	193977	193982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010610	AG	3	6	194254	194259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010610	AT	3	6	194384	194389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010610	AC	3	6	194905	194910	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_010610	AC	3	6	195074	195079	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_010610	TC	3	6	195816	195821	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_010610	TC	3	6	196278	196283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010610	AT	3	6	196478	196483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010610	GA	3	6	197443	197448	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010610	GC	3	6	201381	201386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_010610	AC	3	6	207365	207370	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_010610	GA	3	6	246636	246641	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010610	GA	3	6	259550	259555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010610	GT	3	6	264563	264568	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010610	TC	3	6	273031	273036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_010610	GA	3	6	273823	273828	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010610	AG	3	6	274100	274105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010610	AT	3	6	274230	274235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010610	AC	3	6	274751	274756	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_010610	AC	3	6	274920	274925	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_010610	TC	3	6	275857	275862	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_010610	TC	3	6	276319	276324	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_010610	AT	3	6	276519	276524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010610	GA	3	6	277484	277489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010610	TG	3	6	279224	279229	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010610	GT	3	6	279284	279289	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010610	AG	3	6	279599	279604	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010610	AG	3	6	281308	281313	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010610	CA	3	6	282836	282841	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_010610	TG	3	6	284112	284117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010610	AT	3	6	284899	284904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010610	CT	3	6	286770	286775	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_010610	TC	3	6	287048	287053	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_010610	TA	3	6	287382	287387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010610	TA	3	6	287472	287477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010610	TA	4	8	287496	287503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010610	AT	3	6	293685	293690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010610	TG	3	6	294131	294136	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010610	GT	3	6	295302	295307	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010610	AG	3	6	318150	318155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010610	TA	3	6	319804	319809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010610	TA	3	6	328796	328801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010610	GA	3	6	332836	332841	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010610	TA	3	6	344257	344262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010610	GC	3	6	374387	374392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_010610	AG	3	6	393134	393139	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010610	AG	3	6	397849	397854	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010610	CT	3	6	397883	397888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_010610	GA	3	6	400842	400847	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010610	AG	3	6	421632	421637	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010610	GC	3	6	427525	427530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_010610	GT	3	6	428850	428855	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010610	GA	3	6	433375	433380	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010610	GC	3	6	434034	434039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_010610	TC	4	8	434645	434652	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_010610	GA	3	6	438175	438180	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010610	AG	3	6	439687	439692	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010610	TA	3	6	458707	458712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010610	CT	4	8	461906	461913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_010610	GA	3	6	467172	467177	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010610	AG	3	6	468225	468230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010610	TC	3	6	472007	472012	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_010610	CG	3	6	473502	473507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_010610	GA	5	10	476207	476216	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010610	TG	4	8	484192	484199	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010610	CT	3	6	497560	497565	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_010610	AT	3	6	518581	518586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010610	AT	4	8	531685	531692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010610	TA	3	6	537122	537127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010610	AG	3	6	538494	538499	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010610	GA	3	6	541406	541411	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010610	TA	5	10	548735	548744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010610	TA	4	8	548782	548789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010610	TA	4	8	548802	548809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010610	AG	3	6	549650	549655	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010610	TA	3	6	549919	549924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010610	GT	3	6	550273	550278	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010610	CA	3	6	559449	559454	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_010610	GA	3	6	560183	560188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010610	CG	3	6	560534	560539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_010610	CG	3	6	572596	572601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_010610	CG	3	6	572638	572643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_010610	AC	3	6	578713	578718	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_010610	GA	3	6	588622	588627	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010610	GC	3	6	596545	596550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_010610	AG	3	6	601840	601845	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010610	GC	3	6	626954	626959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_010610	CT	3	6	631208	631213	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_010610	GA	3	6	637987	637992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010610	TC	3	6	638003	638008	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_010610	AT	3	6	638066	638071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010610	TA	3	6	644763	644768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010610	CT	3	6	644795	644800	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_010610	TG	3	6	645015	645020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010610	AT	3	6	650967	650972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010610	TA	3	6	651013	651018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010610	GA	3	6	651680	651685	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010610	AG	3	6	651957	651962	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010610	AT	3	6	652087	652092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010610	AC	3	6	652608	652613	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_010610	AC	3	6	652777	652782	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_010610	TC	3	6	653519	653524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_010610	TC	3	6	653981	653986	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_010610	AT	3	6	654181	654186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010610	GA	3	6	655146	655151	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010610	TA	3	6	656575	656580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010610	AT	3	6	657326	657331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010610	TC	3	6	657642	657647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_010610	GT	3	6	666814	666819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_010610	AG	3	6	693970	693975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.