MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus reuteri JCM 1112

Total Repeats: 8224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_010609	TAAT	2	8	1997087	1997094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_010609	TA	3	6	1997102	1997107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_010609	GTA	2	6	1997150	1997155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_010609	AGT	2	6	1997180	1997185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_010609	TAA	2	6	1998109	1998114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_010609	A	7	7	1998113	1998119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_010609	T	6	6	1999174	1999179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_010609	T	6	6	2000189	2000194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_010609	AAATT	2	10	2000209	2000218	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_010609	A	6	6	2000234	2000239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_010609	ATTTT	2	10	2000259	2000268	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_010609	ATT	2	6	2000284	2000289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_010609	CTTGG	2	10	2000333	2000342	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8014	NC_010609	TAAT	2	8	2002577	2002584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_010609	TCC	2	6	2003406	2003411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8016	NC_010609	ATTA	2	8	2003436	2003443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_010609	GGTCA	2	10	2003456	2003465	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8018	NC_010609	TTC	2	6	2003477	2003482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8019	NC_010609	TAA	2	6	2003488	2003493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_010609	CTGT	2	8	2003508	2003515	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8021	NC_010609	ACC	4	12	2003520	2003531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8022	NC_010609	TAA	2	6	2003544	2003549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_010609	A	6	6	2003548	2003553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_010609	CCT	2	6	2003557	2003562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8025	NC_010609	ACC	2	6	2003602	2003607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8026	NC_010609	TTTA	2	8	2003608	2003615	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_010609	TCAA	2	8	2003632	2003639	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8028	NC_010609	GCT	2	6	2003674	2003679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8029	NC_010609	CTA	2	6	2003691	2003696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8030	NC_010609	CCT	2	6	2003737	2003742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8031	NC_010609	CCA	2	6	2003751	2003756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8032	NC_010609	ACC	2	6	2003757	2003762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8033	NC_010609	CT	3	6	2003765	2003770	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8034	NC_010609	CAG	2	6	2003776	2003781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8035	NC_010609	T	6	6	2003804	2003809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_010609	ATT	2	6	2003825	2003830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_010609	ATT	2	6	2003906	2003911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_010609	ATT	2	6	2005299	2005304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_010609	TAA	2	6	2005328	2005333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_010609	CCT	2	6	2006816	2006821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8041	NC_010609	A	6	6	2006853	2006858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_010609	ATG	2	6	2006862	2006867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_010609	AATC	2	8	2006880	2006887	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8044	NC_010609	TAA	2	6	2006939	2006944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_010609	TTC	2	6	2007017	2007022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8046	NC_010609	ACA	2	6	2007093	2007098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8047	NC_010609	TTTTAA	2	12	2007126	2007137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_010609	ATT	2	6	2007189	2007194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_010609	T	6	6	2007197	2007202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_010609	ATT	2	6	2007205	2007210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_010609	TATC	2	8	2007239	2007246	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8052	NC_010609	ACA	2	6	2007273	2007278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8053	NC_010609	T	6	6	2007653	2007658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_010609	TAT	2	6	2007669	2007674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_010609	ATTA	2	8	2007678	2007685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_010609	A	6	6	2008555	2008560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_010609	TTA	2	6	2009788	2009793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_010609	T	6	6	2009818	2009823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_010609	CTT	2	6	2009844	2009849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8060	NC_010609	T	6	6	2009863	2009868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_010609	A	6	6	2009889	2009894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_010609	T	7	7	2009909	2009915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_010609	ATT	2	6	2009930	2009935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_010609	CTGT	2	8	2009954	2009961	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8065	NC_010609	CTT	2	6	2010017	2010022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8066	NC_010609	CTG	2	6	2010059	2010064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8067	NC_010609	TGT	2	6	2010090	2010095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_010609	TTC	2	6	2010137	2010142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8069	NC_010609	CTAT	2	8	2010170	2010177	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8070	NC_010609	ATT	2	6	2010233	2010238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_010609	T	6	6	2010294	2010299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_010609	CAA	2	6	2010311	2010316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8073	NC_010609	AAAAAG	2	12	2010317	2010328	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_010609	T	6	6	2010330	2010335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_010609	GAAG	2	8	2010366	2010373	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_010609	AT	3	6	2011313	2011318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_010609	ATA	2	6	2011344	2011349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_010609	ATA	2	6	2011360	2011365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_010609	CCT	2	6	2011367	2011372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8080	NC_010609	ATG	2	6	2011379	2011384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_010609	AGG	2	6	2011398	2011403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_010609	ATT	2	6	2012302	2012307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_010609	TAGA	2	8	2012324	2012331	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_010609	AAT	2	6	2012393	2012398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_010609	A	6	6	2012442	2012447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_010609	CAAT	2	8	2012463	2012470	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8087	NC_010609	AGA	2	6	2012495	2012500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_010609	CAA	2	6	2012509	2012514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8089	NC_010609	AAT	2	6	2012543	2012548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_010609	AATATT	2	12	2012553	2012564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_010609	A	6	6	2012592	2012597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8092	NC_010609	TCAA	2	8	2012598	2012605	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8093	NC_010609	AAC	2	6	2012634	2012639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8094	NC_010609	TAAAA	2	10	2012683	2012692	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_010609	TAA	2	6	2012765	2012770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_010609	AT	3	6	2012774	2012779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_010609	TTC	2	6	2012811	2012816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8098	NC_010609	TAAT	2	8	2012827	2012834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_010609	CTTT	2	8	2013895	2013902	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8100	NC_010609	T	6	6	2013944	2013949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_010609	A	8	8	2013978	2013985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_010609	CTA	2	6	2014051	2014056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8103	NC_010609	TTAA	2	8	2014173	2014180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_010609	A	6	6	2014209	2014214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_010609	TTA	2	6	2014219	2014224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_010609	CAA	2	6	2014232	2014237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8107	NC_010609	TA	3	6	2014285	2014290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_010609	ACT	3	9	2014345	2014353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8109	NC_010609	ACT	2	6	2014360	2014365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8110	NC_010609	AGA	2	6	2014383	2014388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_010609	ATA	2	6	2014472	2014477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_010609	TTG	2	6	2014502	2014507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_010609	GAA	2	6	2014522	2014527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_010609	AAAT	2	8	2014536	2014543	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_010609	AATA	2	8	2014571	2014578	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_010609	TA	3	6	2014659	2014664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_010609	ATT	2	6	2014703	2014708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_010609	TTA	2	6	2014719	2014724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_010609	TTC	2	6	2015213	2015218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8120	NC_010609	CAAAA	2	10	2015227	2015236	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8121	NC_010609	A	6	6	2015597	2015602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_010609	AACTCC	2	12	2015664	2015675	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
8123	NC_010609	TTA	2	6	2015749	2015754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_010609	ATA	2	6	2015866	2015871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_010609	ATA	2	6	2015889	2015894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_010609	TTA	2	6	2015899	2015904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_010609	CTA	2	6	2015914	2015919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8128	NC_010609	TTC	2	6	2015944	2015949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8129	NC_010609	CAA	2	6	2015986	2015991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8130	NC_010609	A	6	6	2016001	2016006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_010609	TAAT	2	8	2016039	2016046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8132	NC_010609	TTAA	2	8	2016070	2016077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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