MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus reuteri JCM 1112

Total Repeats: 8224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_010609	TTA	2	6	1501966	1501971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_010609	CTC	2	6	1503106	1503111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6003	NC_010609	TAA	2	6	1503158	1503163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_010609	ATA	2	6	1503724	1503729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_010609	TTTGTA	2	12	1503744	1503755	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_010609	CTG	2	6	1504312	1504317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_010609	T	6	6	1504354	1504359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_010609	CA	3	6	1504376	1504381	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6009	NC_010609	TTA	2	6	1504387	1504392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_010609	ATT	2	6	1505767	1505772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_010609	TCG	2	6	1505819	1505824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_010609	TCA	2	6	1505867	1505872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_010609	ATT	2	6	1505956	1505961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_010609	AGG	2	6	1505962	1505967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_010609	TGC	2	6	1507169	1507174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_010609	ATT	2	6	1507183	1507188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_010609	TA	3	6	1507193	1507198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_010609	TTA	2	6	1507238	1507243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_010609	AAT	2	6	1507299	1507304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_010609	TAT	3	9	1507316	1507324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_010609	A	6	6	1507449	1507454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_010609	ATG	2	6	1507465	1507470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_010609	A	6	6	1507649	1507654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_010609	CT	4	8	1507664	1507671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6025	NC_010609	TGA	3	9	1507733	1507741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_010609	AAT	2	6	1507759	1507764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_010609	TTATT	2	10	1507804	1507813	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_010609	TCT	2	6	1507957	1507962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_010609	TAA	2	6	1508029	1508034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_010609	CCA	3	9	1508040	1508048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6031	NC_010609	ACT	2	6	1508064	1508069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_010609	GGC	2	6	1508083	1508088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_010609	TGT	2	6	1508106	1508111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_010609	TAAC	2	8	1508122	1508129	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6035	NC_010609	ATT	2	6	1508163	1508168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_010609	TAT	2	6	1508178	1508183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_010609	TTAA	2	8	1508234	1508241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_010609	CAT	2	6	1508313	1508318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_010609	AAT	2	6	1508336	1508341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_010609	TTA	2	6	1508379	1508384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_010609	CCG	2	6	1508401	1508406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6042	NC_010609	ATA	2	6	1508516	1508521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_010609	TTC	2	6	1508527	1508532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_010609	CTAT	2	8	1508588	1508595	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6045	NC_010609	GCATAT	2	12	1508657	1508668	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6046	NC_010609	AGA	2	6	1508678	1508683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_010609	GCG	2	6	1508684	1508689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_010609	CTG	2	6	1508700	1508705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_010609	TTG	2	6	1508737	1508742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_010609	TTC	2	6	1508787	1508792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_010609	ATT	2	6	1508821	1508826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_010609	ATT	2	6	1508864	1508869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_010609	CTT	2	6	1508934	1508939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_010609	TCA	2	6	1508945	1508950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_010609	ATT	2	6	1508971	1508976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_010609	T	7	7	1508975	1508981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_010609	TGTT	2	8	1509025	1509032	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_010609	CCA	2	6	1509062	1509067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6059	NC_010609	T	7	7	1509102	1509108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_010609	TTG	2	6	1509124	1509129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_010609	CCA	2	6	1509153	1509158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6062	NC_010609	TAT	2	6	1509159	1509164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_010609	AAT	2	6	1509169	1509174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_010609	AGT	2	6	1509271	1509276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_010609	CTT	2	6	1509327	1509332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_010609	TAA	2	6	1509340	1509345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_010609	GTTG	2	8	1509350	1509357	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_010609	A	6	6	1509502	1509507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_010609	TAA	2	6	1509550	1509555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_010609	TAGC	2	8	1512353	1512360	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6071	NC_010609	TAT	2	6	1512364	1512369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_010609	AAC	2	6	1512413	1512418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_010609	TTC	2	6	1512440	1512445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_010609	CAA	2	6	1512532	1512537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_010609	ATTT	2	8	1512589	1512596	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_010609	ACCATC	2	12	1512605	1512616	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
6077	NC_010609	AT	3	6	1512651	1512656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_010609	AGC	2	6	1512675	1512680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_010609	TTG	2	6	1512681	1512686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_010609	AAT	2	6	1512687	1512692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_010609	ATT	2	6	1512713	1512718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_010609	TCATAT	2	12	1512914	1512925	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6083	NC_010609	ATCA	2	8	1512945	1512952	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6084	NC_010609	AT	3	6	1512971	1512976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_010609	AT	3	6	1512989	1512994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_010609	AGG	2	6	1512996	1513001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_010609	ATC	2	6	1515573	1515578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6088	NC_010609	TGA	2	6	1515599	1515604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_010609	CTT	2	6	1515647	1515652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6090	NC_010609	CTTTT	2	10	1515701	1515710	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6091	NC_010609	TAGT	2	8	1515785	1515792	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_010609	CAATG	2	10	1515887	1515896	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6093	NC_010609	ATT	2	6	1515903	1515908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_010609	GTT	2	6	1516959	1516964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_010609	TG	3	6	1517552	1517557	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_010609	AAAG	2	8	1517585	1517592	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_010609	CAAG	2	8	1517634	1517641	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6098	NC_010609	TAG	2	6	1517686	1517691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_010609	T	6	6	1517723	1517728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_010609	GGC	2	6	1517741	1517746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_010609	GTT	2	6	1517807	1517812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_010609	AGT	2	6	1517889	1517894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_010609	GA	3	6	1517959	1517964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_010609	TCA	2	6	1517978	1517983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6105	NC_010609	A	6	6	1518196	1518201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_010609	GCTT	2	8	1518328	1518335	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6107	NC_010609	T	6	6	1518334	1518339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_010609	A	8	8	1518350	1518357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_010609	TCC	2	6	1519051	1519056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6110	NC_010609	TAAA	2	8	1519885	1519892	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_010609	ATC	2	6	1519901	1519906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_010609	TCA	2	6	1519925	1519930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_010609	CAA	2	6	1520006	1520011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_010609	TCAT	2	8	1520062	1520069	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6115	NC_010609	GACTA	2	10	1520106	1520115	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6116	NC_010609	TGA	2	6	1520344	1520349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_010609	TAA	2	6	1520558	1520563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_010609	TAA	2	6	1520588	1520593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_010609	GGTT	2	8	1520651	1520658	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_010609	GGT	2	6	1520704	1520709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_010609	GTT	2	6	1520716	1520721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_010609	AAT	2	6	1520741	1520746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_010609	AAC	2	6	1520783	1520788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_010609	TAA	2	6	1521039	1521044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_010609	CTT	2	6	1521094	1521099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_010609	AAT	2	6	1521110	1521115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_010609	GTA	2	6	1521126	1521131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_010609	GTA	2	6	1521147	1521152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_010609	TCACCG	2	12	1521154	1521165	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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6131	NC_010609	TTAA	2	8	1521309	1521316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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