MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 1500

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010524	GCCA	2	8	5709	5716	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010524	GGCG	2	8	10461	10468	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3	NC_010524	CCGG	2	8	16319	16326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_010524	TGCG	2	8	16353	16360	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_010524	CGGC	2	8	39017	39024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_010524	GATC	2	8	39523	39530	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_010524	TCGC	2	8	42942	42949	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_010524	CGAC	2	8	42979	42986	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010524	CGGC	2	8	43180	43187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010524	GGCC	2	8	43247	43254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010524	CGTG	2	8	43260	43267	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_010524	GCCC	2	8	43309	43316	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13	NC_010524	CGGC	2	8	43335	43342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_010524	CTGG	2	8	43999	44006	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_010524	GTTC	2	8	44052	44059	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_010524	TCGG	2	8	45603	45610	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_010524	TTGC	2	8	45619	45626	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_010524	GCCG	2	8	46951	46958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_010524	TGCG	2	8	49408	49415	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_010524	GGGC	2	8	57067	57074	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_010524	AGCC	2	8	63013	63020	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_010524	CGGC	2	8	71503	71510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_010524	ACTT	2	8	71908	71915	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_010524	TCCA	2	8	72085	72092	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_010524	CGGC	2	8	76937	76944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_010524	CCTG	2	8	85496	85503	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010524	CGAA	2	8	92137	92144	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_010524	CCGG	2	8	95444	95451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_010524	TCGA	2	8	100778	100785	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_010524	AGCG	2	8	103285	103292	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_010524	CGGC	2	8	104881	104888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_010524	ACGC	2	8	109956	109963	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_010524	GCTC	2	8	116801	116808	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_010524	TGGA	2	8	120048	120055	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010524	CTCG	2	8	120101	120108	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_010524	AGCC	2	8	123687	123694	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_010524	CCGC	2	8	123818	123825	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_010524	CTGC	2	8	123878	123885	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_010524	AGGC	2	8	133050	133057	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_010524	GGGC	2	8	141565	141572	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_010524	CTCC	2	8	141580	141587	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
42	NC_010524	CTTG	2	8	143007	143014	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_010524	GACG	2	8	143019	143026	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_010524	TCTG	2	8	144457	144464	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_010524	GTCG	2	8	144923	144930	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_010524	ACGC	2	8	151073	151080	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_010524	CGAT	2	8	151596	151603	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_010524	CATC	2	8	152200	152207	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_010524	GGAC	2	8	154977	154984	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_010524	CGGG	2	8	156372	156379	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
51	NC_010524	AGAA	2	8	158904	158911	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010524	GGCC	2	8	160406	160413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_010524	CGCT	2	8	168483	168490	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_010524	GGAT	2	8	182913	182920	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010524	GCCG	2	8	185329	185336	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_010524	GGCT	2	8	188448	188455	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_010524	CGGC	2	8	188709	188716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_010524	CGGC	2	8	189936	189943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_010524	CAGC	2	8	195805	195812	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_010524	GGTT	2	8	200425	200432	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010524	GTCT	2	8	201350	201357	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_010524	CGTG	2	8	204176	204183	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_010524	GCAC	2	8	204346	204353	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_010524	GCCG	2	8	207617	207624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_010524	GCCG	2	8	214338	214345	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_010524	AGCG	2	8	248962	248969	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_010524	TCAA	2	8	250823	250830	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_010524	CGCT	2	8	256737	256744	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_010524	GTCA	2	8	257466	257473	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_010524	GCCG	2	8	259241	259248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_010524	GCGT	2	8	262572	262579	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_010524	CGAG	2	8	263871	263878	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_010524	CTCC	2	8	270332	270339	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
74	NC_010524	CGCA	2	8	271187	271194	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_010524	CCTG	2	8	274033	274040	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_010524	GAAA	2	8	274052	274059	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010524	GCGG	2	8	280456	280463	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
78	NC_010524	TCGG	2	8	283414	283421	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_010524	GGTT	2	8	284952	284959	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010524	CGCC	2	8	285083	285090	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
81	NC_010524	GAAT	2	8	295144	295151	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010524	CCGG	2	8	319883	319890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_010524	CCCG	2	8	320863	320870	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
84	NC_010524	TACC	2	8	325455	325462	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_010524	CCAT	2	8	326246	326253	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_010524	GTCG	2	8	326294	326301	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_010524	ATTG	2	8	326424	326431	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010524	ACCC	2	8	326705	326712	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
89	NC_010524	GCGA	2	8	326820	326827	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_010524	GCAT	2	8	327091	327098	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_010524	AAAC	2	8	327360	327367	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_010524	AAAG	2	8	327654	327661	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010524	CAAT	2	8	329529	329536	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_010524	GATG	2	8	329971	329978	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010524	AGGT	2	8	329997	330004	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010524	ACGT	2	8	330034	330041	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_010524	CGGC	2	8	336359	336366	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_010524	TGGG	2	8	342565	342572	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010524	CGTC	2	8	349129	349136	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_010524	CCGG	2	8	349211	349218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_010524	GCCG	2	8	356984	356991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_010524	GATC	2	8	359051	359058	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_010524	CGGC	3	12	359110	359121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_010524	TTCA	2	8	359301	359308	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_010524	CGGG	2	8	367142	367149	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_010524	CGAT	2	8	367819	367826	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_010524	CCGC	2	8	369996	370003	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
108	NC_010524	GCCG	2	8	372206	372213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_010524	GTTT	2	8	372228	372235	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010524	GGGC	2	8	376309	376316	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
111	NC_010524	TTCA	2	8	385388	385395	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_010524	CCGT	2	8	386983	386990	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_010524	CAAC	2	8	388797	388804	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_010524	CGAT	2	8	390717	390724	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_010524	GGGC	2	8	391510	391517	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
116	NC_010524	ACCC	2	8	393966	393973	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
117	NC_010524	CCTG	2	8	396692	396699	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_010524	CGTC	2	8	403694	403701	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_010524	AGGC	2	8	405205	405212	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_010524	GCCC	2	8	409888	409895	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
121	NC_010524	GGAC	2	8	409929	409936	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_010524	GGCC	2	8	412342	412349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_010524	CGTC	2	8	412413	412420	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_010524	GCCT	2	8	418008	418015	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_010524	GTGC	2	8	418032	418039	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_010524	AGAC	2	8	422429	422436	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_010524	TGGC	2	8	425005	425012	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_010524	GGCG	2	8	425077	425084	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
129	NC_010524	GCTC	2	8	425144	425151	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_010524	CGCC	2	8	425166	425173	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
131	NC_010524	GCCA	2	8	425445	425452	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_010524	CGGG	2	8	430108	430115	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
133	NC_010524	GCGG	2	8	433591	433598	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
134	NC_010524	TGCG	2	8	444903	444910	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_010524	CGGG	2	8	454528	454535	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
136	NC_010524	GAGG	2	8	454742	454749	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010524	CGTA	2	8	455547	455554	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_010524	ATCG	2	8	458672	458679	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_010524	GAAC	2	8	469856	469863	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_010524	CCCG	2	8	481118	481125	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
141	NC_010524	GCCG	2	8	481952	481959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_010524	GCCG	2	8	485940	485947	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_010524	AGTG	2	8	488882	488889	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010524	GCGA	2	8	489465	489472	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_010524	GCTC	2	8	490374	490381	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_010524	ATCG	2	8	497001	497008	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_010524	CCCG	2	8	501593	501600	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
148	NC_010524	CTCC	3	12	501770	501781	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
149	NC_010524	CACG	2	8	504047	504054	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_010524	TTCG	2	8	505385	505392	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_010524	GGGA	2	8	510173	510180	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_010524	GTAC	2	8	950438	950445	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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471	NC_010524	GCGA	2	8	1236724	1236731	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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473	NC_010524	GCGA	2	8	1236796	1236803	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
474	NC_010524	CGCC	2	8	1236850	1236857	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
475	NC_010524	GCGA	2	8	1236867	1236874	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
476	NC_010524	GCAT	2	8	1245621	1245628	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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479	NC_010524	GCGT	2	8	1257885	1257892	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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485	NC_010524	TGCA	2	8	1262566	1262573	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
486	NC_010524	GCGG	2	8	1262654	1262661	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
487	NC_010524	TCGA	2	8	1262677	1262684	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
488	NC_010524	GCTG	2	8	1262717	1262724	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
489	NC_010524	CCGG	2	8	1262759	1262766	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
490	NC_010524	CGGA	2	8	1264059	1264066	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
491	NC_010524	GTTC	2	8	1267614	1267621	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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495	NC_010524	CCGG	2	8	1309777	1309784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
496	NC_010524	GCCT	2	8	1311026	1311033	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
497	NC_010524	GTGC	2	8	1313832	1313839	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
498	NC_010524	CACC	2	8	1315007	1315014	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
499	NC_010524	CGGG	2	8	1320871	1320878	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
500	NC_010524	CGGC	2	8	1325451	1325458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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