MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 5152

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010524	GCG	2	6	5595	5600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010524	GCA	2	6	5602	5607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010524	GGT	2	6	5721	5726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010524	CCG	2	6	6280	6285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_010524	GCG	2	6	7198	7203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010524	GCG	2	6	7548	7553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010524	CTC	2	6	8800	8805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_010524	GAC	2	6	8816	8821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010524	GAT	2	6	8843	8848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010524	CAC	2	6	13667	13672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_010524	ACG	2	6	13682	13687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010524	TCT	2	6	16103	16108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010524	GCC	2	6	16111	16116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_010524	ACG	2	6	16143	16148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010524	CAT	2	6	16175	16180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010524	CGG	2	6	16216	16221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010524	CCA	2	6	16245	16250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_010524	CGA	2	6	16267	16272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010524	GGC	2	6	30431	30436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010524	GAA	2	6	31944	31949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010524	CCG	2	6	31961	31966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_010524	AGG	2	6	33876	33881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010524	ACC	2	6	36783	36788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_010524	TCA	2	6	36891	36896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010524	CGC	2	6	36955	36960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_010524	GTC	2	6	38981	38986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010524	GGC	2	6	38996	39001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010524	TTG	2	6	39002	39007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010524	CTT	2	6	39484	39489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010524	CGA	2	6	39499	39504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010524	ACA	2	6	41850	41855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010524	GCG	2	6	42914	42919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010524	CGC	2	6	42956	42961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_010524	CGA	2	6	42968	42973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010524	ATC	2	6	42990	42995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010524	CGG	2	6	43057	43062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010524	GCG	2	6	43063	43068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010524	CCG	2	6	43094	43099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_010524	GTG	2	6	43164	43169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010524	CGA	2	6	43235	43240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010524	GCT	2	6	43241	43246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010524	CGG	2	6	43269	43274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010524	TCG	2	6	43364	43369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010524	CGC	2	6	43423	43428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_010524	GCC	2	6	43513	43518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_010524	TGG	2	6	43596	43601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010524	GCT	2	6	43627	43632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010524	CGC	2	6	43653	43658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_010524	GCG	2	6	43662	43667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010524	CGG	2	6	43687	43692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010524	CCG	2	6	43701	43706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_010524	GGA	2	6	43714	43719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010524	CCG	3	9	43809	43817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_010524	ACT	2	6	43824	43829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010524	GGC	2	6	43849	43854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010524	GCT	2	6	43876	43881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010524	GCG	2	6	43893	43898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010524	TCG	2	6	43922	43927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010524	CCG	2	6	44012	44017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_010524	GGC	2	6	44043	44048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010524	CAT	2	6	45524	45529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010524	ACG	2	6	46979	46984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010524	GCG	2	6	47001	47006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010524	TGG	2	6	47608	47613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010524	CGC	2	6	47627	47632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_010524	GGC	2	6	47682	47687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010524	ACG	2	6	47692	47697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010524	GGC	2	6	47728	47733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_010524	GCC	2	6	53560	53565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_010524	GGC	2	6	54581	54586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010524	CCT	2	6	55745	55750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_010524	GCA	2	6	56963	56968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010524	GCA	2	6	56995	57000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_010524	AGC	2	6	57004	57009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010524	CGG	2	6	57107	57112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010524	CGG	2	6	57608	57613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010524	GCC	2	6	57626	57631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_010524	TCG	2	6	57639	57644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010524	GAG	2	6	57745	57750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010524	GAT	2	6	59298	59303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010524	GTG	2	6	61976	61981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010524	GCA	2	6	61992	61997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010524	GCC	2	6	62004	62009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_010524	GGC	2	6	62089	62094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_010524	CGG	2	6	63029	63034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010524	GAT	2	6	65032	65037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010524	CGC	2	6	65048	65053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_010524	TCG	2	6	67585	67590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_010524	CGG	2	6	68077	68082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010524	GCC	2	6	71444	71449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_010524	GCT	2	6	71453	71458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_010524	CGT	2	6	71583	71588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010524	TCG	2	6	71680	71685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_010524	GTT	2	6	71686	71691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010524	GAT	2	6	71713	71718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010524	CGA	2	6	71796	71801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_010524	ACG	2	6	71825	71830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010524	TGC	2	6	71929	71934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010524	ATC	2	6	71962	71967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010524	CGG	2	6	71994	71999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010524	CGG	2	6	72185	72190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010524	CGG	2	6	74655	74660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010524	CGC	2	6	75987	75992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_010524	ACC	2	6	86254	86259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_010524	CAC	2	6	86268	86273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_010524	AGC	2	6	86304	86309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_010524	CGG	2	6	86337	86342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010524	CGT	2	6	86420	86425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_010524	GCG	2	6	86454	86459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_010524	CGG	2	6	86461	86466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_010524	CGC	2	6	86471	86476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_010524	GCC	2	6	87121	87126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_010524	GTG	2	6	87137	87142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010524	TCG	2	6	87167	87172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_010524	CGC	2	6	89958	89963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_010524	GCT	2	6	90002	90007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_010524	ATC	2	6	92155	92160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_010524	GCC	2	6	92650	92655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_010524	CTG	2	6	92789	92794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_010524	GCA	2	6	92799	92804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_010524	GAG	2	6	92873	92878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010524	CGG	2	6	94707	94712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_010524	GCC	2	6	94722	94727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_010524	ATC	2	6	95459	95464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_010524	CTT	2	6	95491	95496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_010524	GTT	2	6	96882	96887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010524	TCG	2	6	96902	96907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_010524	GCC	2	6	98106	98111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_010524	CAA	2	6	100817	100822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_010524	AAT	2	6	100847	100852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010524	CGG	2	6	106322	106327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_010524	GCC	2	6	107224	107229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_010524	CGC	2	6	108487	108492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_010524	GCT	2	6	109942	109947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_010524	CAG	2	6	112139	112144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_010524	TGT	2	6	113563	113568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010524	GGC	2	6	113576	113581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_010524	GCC	2	6	113612	113617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_010524	GCC	2	6	113622	113627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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274	NC_010524	CGT	2	6	271893	271898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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291	NC_010524	GCG	2	6	285986	285991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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303	NC_010524	CGA	2	6	298930	298935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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