MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 8680

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010524	CGGG	2	8	1936022	1936029	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3502	NC_010524	CGG	3	9	1936034	1936042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_010524	TG	3	6	1936070	1936075	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_010524	A	6	6	1937740	1937745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_010524	ACA	2	6	1942138	1942143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_010524	CGC	2	6	1942666	1942671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3507	NC_010524	GC	3	6	1945101	1945106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3508	NC_010524	TGCC	2	8	1946016	1946023	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3509	NC_010524	AC	3	6	1946118	1946123	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3510	NC_010524	CGG	2	6	1947370	1947375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_010524	CGG	2	6	1947386	1947391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_010524	GGGC	2	8	1948092	1948099	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3513	NC_010524	GCGT	2	8	1948199	1948206	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3514	NC_010524	CGCAC	2	10	1948211	1948220	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3515	NC_010524	C	6	6	1948229	1948234	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3516	NC_010524	GCG	2	6	1948293	1948298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_010524	GCCG	2	8	1948345	1948352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3518	NC_010524	GGC	2	6	1948377	1948382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_010524	GC	3	6	1948389	1948394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3520	NC_010524	CA	3	6	1948413	1948418	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3521	NC_010524	G	6	6	1949272	1949277	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_010524	CAGG	2	8	1949285	1949292	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3525	NC_010524	GCAT	2	8	1949400	1949407	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3526	NC_010524	GAAAT	2	10	1949551	1949560	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_010524	TGCG	2	8	1949660	1949667	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3532	NC_010524	GGC	2	6	1955943	1955948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_010524	GT	3	6	1955971	1955976	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3550	NC_010524	GCG	2	6	1960612	1960617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3554	NC_010524	GCCCG	2	10	1963024	1963033	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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3559	NC_010524	T	6	6	1965625	1965630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3561	NC_010524	GAGC	2	8	1966963	1966970	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3562	NC_010524	GGC	2	6	1967875	1967880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3569	NC_010524	GTCG	2	8	1969342	1969349	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3570	NC_010524	ATC	2	6	1969370	1969375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3598	NC_010524	GC	3	6	1979917	1979922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3599	NC_010524	CGG	3	9	1979949	1979957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3613	NC_010524	TTCCG	2	10	1988354	1988363	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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3621	NC_010524	CTGGG	2	10	1992343	1992352	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3622	NC_010524	GCT	2	6	1992395	1992400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3627	NC_010524	TGCA	2	8	1994267	1994274	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3628	NC_010524	CCG	2	6	1994449	1994454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3629	NC_010524	TGCA	2	8	1994483	1994490	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3630	NC_010524	GGCG	2	8	1994510	1994517	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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3632	NC_010524	TG	3	6	1994560	1994565	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3894	NC_010524	GCG	2	6	2131285	2131290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3895	NC_010524	CCCAG	2	10	2131316	2131325	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3896	NC_010524	TGA	2	6	2133401	2133406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3897	NC_010524	GCA	2	6	2133621	2133626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3898	NC_010524	GCA	2	6	2133662	2133667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3899	NC_010524	GC	3	6	2133672	2133677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3900	NC_010524	TC	3	6	2136782	2136787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3901	NC_010524	CGG	2	6	2138113	2138118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3902	NC_010524	GCCAGC	2	12	2138677	2138688	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3903	NC_010524	CTA	2	6	2139533	2139538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3909	NC_010524	TGGAA	2	10	2143065	2143074	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3910	NC_010524	GCATCG	2	12	2146305	2146316	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3917	NC_010524	CTG	2	6	2150383	2150388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3927	NC_010524	AGGT	2	8	2150633	2150640	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3928	NC_010524	ACC	2	6	2150655	2150660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3929	NC_010524	TCGA	2	8	2150669	2150676	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3931	NC_010524	GT	3	6	2151399	2151404	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3932	NC_010524	TAC	2	6	2152156	2152161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3933	NC_010524	GGCCC	2	10	2152214	2152223	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3934	NC_010524	CG	3	6	2152805	2152810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3935	NC_010524	GGT	2	6	2153809	2153814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3999	NC_010524	GCAT	2	8	2201522	2201529	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4000	NC_010524	CTTTTT	2	12	2201595	2201606	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

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