MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 8680

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010524	GC	3	6	513080	513085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1002	NC_010524	CAT	2	6	513111	513116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_010524	C	6	6	513128	513133	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1004	NC_010524	A	6	6	513148	513153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_010524	ACC	2	6	513155	513160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1006	NC_010524	CGC	2	6	514534	514539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_010524	GGCC	2	8	515696	515703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_010524	CA	3	6	520092	520097	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_010524	CGG	2	6	520125	520130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_010524	GGT	2	6	520166	520171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_010524	CCTA	2	8	520233	520240	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_010524	CCA	2	6	520542	520547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_010524	AAC	2	6	520561	520566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_010524	CCG	2	6	522239	522244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1015	NC_010524	T	6	6	522292	522297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_010524	TGC	2	6	524463	524468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_010524	A	6	6	524477	524482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_010524	GT	3	6	524528	524533	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_010524	T	6	6	525028	525033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_010524	GCCG	2	8	526596	526603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1021	NC_010524	TGC	2	6	526604	526609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_010524	CAG	2	6	526613	526618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_010524	CAG	2	6	526688	526693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_010524	AGCA	2	8	526728	526735	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1025	NC_010524	CCG	2	6	526789	526794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_010524	CCG	2	6	526807	526812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1027	NC_010524	CCA	2	6	526844	526849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_010524	G	6	6	528701	528706	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_010524	TCG	2	6	528759	528764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_010524	CGG	2	6	529120	529125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_010524	AGA	2	6	529153	529158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_010524	GC	3	6	529168	529173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_010524	GGCCG	2	10	529181	529190	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1034	NC_010524	GTC	2	6	531064	531069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_010524	GGA	2	6	531088	531093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_010524	CAA	2	6	532619	532624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_010524	CCTGGC	2	12	533084	533095	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1038	NC_010524	GCG	2	6	533111	533116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_010524	GTGC	2	8	533191	533198	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1040	NC_010524	CG	4	8	534900	534907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_010524	GCC	2	6	535344	535349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_010524	GGC	2	6	535354	535359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_010524	CTG	2	6	537526	537531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_010524	GGC	2	6	537543	537548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_010524	GCG	2	6	537550	537555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_010524	TGC	2	6	537592	537597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_010524	GC	3	6	539219	539224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1048	NC_010524	CAC	2	6	539294	539299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1049	NC_010524	ACA	2	6	539301	539306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_010524	GCC	2	6	539318	539323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NC_010524	AGA	2	6	539347	539352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_010524	GACA	2	8	539356	539363	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1053	NC_010524	CGC	2	6	540058	540063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_010524	CGAC	2	8	540070	540077	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_010524	CAT	2	6	545362	545367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_010524	C	6	6	545376	545381	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1057	NC_010524	GGC	2	6	545444	545449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_010524	CG	3	6	546428	546433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1059	NC_010524	CGG	2	6	546452	546457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_010524	TCAGC	2	10	547520	547529	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1061	NC_010524	GC	3	6	547604	547609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_010524	ACC	2	6	547674	547679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1063	NC_010524	GCC	2	6	547681	547686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1064	NC_010524	GGC	2	6	547701	547706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_010524	ATA	2	6	547750	547755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_010524	GCG	2	6	547801	547806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_010524	CGCTG	2	10	551077	551086	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1068	NC_010524	GGCG	2	8	553400	553407	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_010524	CTGAA	2	10	554408	554417	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1070	NC_010524	A	6	6	554416	554421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_010524	CG	3	6	555709	555714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1072	NC_010524	GCT	2	6	555718	555723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_010524	TGC	2	6	555742	555747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_010524	CGC	2	6	556910	556915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_010524	TTG	2	6	557073	557078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_010524	GCA	2	6	566853	566858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_010524	CGC	2	6	572484	572489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1078	NC_010524	CAAG	2	8	573762	573769	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1079	NC_010524	GCC	2	6	573834	573839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1080	NC_010524	CGC	2	6	575108	575113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1081	NC_010524	GCCC	2	8	575145	575152	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1082	NC_010524	CCG	2	6	576181	576186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1083	NC_010524	CG	3	6	576192	576197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1084	NC_010524	CGGC	2	8	576405	576412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1085	NC_010524	CCGC	2	8	578808	578815	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1086	NC_010524	CGGCG	2	10	579425	579434	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1087	NC_010524	GCTG	2	8	579447	579454	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1088	NC_010524	A	6	6	581099	581104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_010524	G	6	6	582423	582428	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_010524	CTG	2	6	582444	582449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_010524	AGG	2	6	582454	582459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_010524	GCC	2	6	582502	582507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1093	NC_010524	CGG	2	6	584623	584628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_010524	G	7	7	584678	584684	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_010524	CCGG	2	8	584695	584702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1096	NC_010524	CAC	2	6	586641	586646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_010524	GAT	2	6	586974	586979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_010524	CCG	2	6	587010	587015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NC_010524	GCG	2	6	587036	587041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_010524	CCG	2	6	587058	587063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1101	NC_010524	GCC	2	6	587066	587071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_010524	TCC	2	6	587094	587099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_010524	AGCC	2	8	587102	587109	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_010524	GCCGG	2	10	588029	588038	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1105	NC_010524	GCC	2	6	588039	588044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_010524	TCA	2	6	588068	588073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_010524	CGC	2	6	588077	588082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1108	NC_010524	GCC	2	6	588083	588088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1109	NC_010524	GCGG	2	8	590022	590029	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1110	NC_010524	CTG	2	6	591493	591498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_010524	GCG	2	6	592561	592566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_010524	CTTGT	2	10	595400	595409	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1113	NC_010524	TCA	2	6	595412	595417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_010524	GAT	2	6	597194	597199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_010524	GGGC	2	8	597238	597245	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1116	NC_010524	TTGC	2	8	597352	597359	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1117	NC_010524	GCA	2	6	597441	597446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_010524	GCC	2	6	597456	597461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_010524	GC	3	6	597472	597477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_010524	GA	4	8	597510	597517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_010524	CCGCG	2	10	600551	600560	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1122	NC_010524	GC	3	6	601542	601547	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_010524	CCG	3	9	601586	601594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1124	NC_010524	GGC	2	6	602359	602364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_010524	G	6	6	602387	602392	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_010524	A	6	6	602462	602467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_010524	TGC	2	6	602474	602479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_010524	CTG	2	6	602493	602498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_010524	CGT	2	6	603126	603131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_010524	CGC	2	6	603225	603230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1131	NC_010524	GCG	2	6	605229	605234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_010524	TTGT	2	8	605241	605248	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_010524	GCA	2	6	605254	605259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_010524	CATC	2	8	605316	605323	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1135	NC_010524	CGC	2	6	607416	607421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1136	NC_010524	CCG	2	6	607974	607979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1137	NC_010524	GCAG	2	8	609249	609256	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1138	NC_010524	GGGT	2	8	609432	609439	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_010524	CG	3	6	614226	614231	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1140	NC_010524	GC	3	6	614235	614240	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1141	NC_010524	TCC	2	6	615785	615790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1142	NC_010524	GAC	2	6	616968	616973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1145	NC_010524	TGG	2	6	617023	617028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1146	NC_010524	CG	3	6	617045	617050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1147	NC_010524	CGG	2	6	617053	617058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1153	NC_010524	CG	3	6	618878	618883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1154	NC_010524	GAG	2	6	618924	618929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1156	NC_010524	GC	3	6	621288	621293	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1157	NC_010524	GC	3	6	621306	621311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1158	NC_010524	AAGC	2	8	621332	621339	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1159	NC_010524	CCG	2	6	621344	621349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1160	NC_010524	GGA	2	6	621377	621382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1164	NC_010524	CGG	2	6	621598	621603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1165	NC_010524	G	6	6	621602	621607	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1166	NC_010524	CTG	2	6	621622	621627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1175	NC_010524	GCG	2	6	626889	626894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1255	NC_010524	GCC	2	6	653366	653371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1258	NC_010524	A	6	6	657901	657906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1259	NC_010524	TTC	2	6	657939	657944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1263	NC_010524	GC	4	8	659771	659778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1264	NC_010524	CG	3	6	659781	659786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1265	NC_010524	CGA	2	6	661942	661947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1267	NC_010524	GGCT	2	8	662906	662913	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1268	NC_010524	CAA	2	6	662915	662920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1269	NC_010524	CGT	2	6	664349	664354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1271	NC_010524	TCG	2	6	667036	667041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1273	NC_010524	TCG	2	6	667138	667143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1274	NC_010524	GGT	2	6	668267	668272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1275	NC_010524	GCCG	2	8	670676	670683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1278	NC_010524	TCG	2	6	672234	672239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1282	NC_010524	GTT	2	6	672509	672514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1400	NC_010524	A	6	6	742380	742385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1402	NC_010524	GCG	2	6	745413	745418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1405	NC_010524	CGGCC	2	10	749014	749023	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1406	NC_010524	GCG	2	6	749096	749101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1407	NC_010524	TTC	2	6	749129	749134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1411	NC_010524	GC	3	6	751996	752001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1412	NC_010524	GAT	2	6	754759	754764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1443	NC_010524	TG	3	6	768552	768557	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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