MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 8680

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_010524	ATG	2	6	3317337	3317342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_010524	TGG	2	6	3317431	3317436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_010524	CGA	2	6	3317470	3317475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_010524	CGA	2	6	3317488	3317493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_010524	GGC	2	6	3317564	3317569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_010524	GTG	2	6	3317604	3317609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_010524	ATT	2	6	3317629	3317634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_010524	GCG	2	6	3317640	3317645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_010524	GAC	2	6	3317651	3317656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_010524	TCG	2	6	3317805	3317810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_010524	GGC	2	6	3317866	3317871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_010524	GAC	2	6	3319034	3319039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_010524	GCTG	2	8	3319058	3319065	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6014	NC_010524	AGC	4	12	3319080	3319091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_010524	CGAT	2	8	3319126	3319133	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6016	NC_010524	GGT	2	6	3319134	3319139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_010524	GATC	2	8	3319222	3319229	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6018	NC_010524	CGG	2	6	3319237	3319242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_010524	CCGCAG	2	12	3319264	3319275	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6020	NC_010524	GAC	2	6	3319353	3319358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_010524	ACA	2	6	3319372	3319377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_010524	GTC	2	6	3319386	3319391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_010524	TGGC	2	8	3319399	3319406	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6024	NC_010524	CGGTC	2	10	3319420	3319429	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6025	NC_010524	CCA	2	6	3319450	3319455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6026	NC_010524	CAA	2	6	3319541	3319546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_010524	CGA	2	6	3319568	3319573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_010524	TGG	2	6	3319606	3319611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_010524	CGG	2	6	3319699	3319704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_010524	GCG	2	6	3319752	3319757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_010524	GCC	3	9	3319806	3319814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6032	NC_010524	CGG	2	6	3319826	3319831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_010524	GCG	2	6	3319855	3319860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_010524	CGT	2	6	3319898	3319903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_010524	CGAA	2	8	3319915	3319922	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6036	NC_010524	CAG	3	9	3319937	3319945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6038	NC_010524	CAA	2	6	3320054	3320059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_010524	GAC	2	6	3320082	3320087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_010524	CGG	2	6	3320096	3320101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_010524	ACG	2	6	3320137	3320142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_010524	GTG	2	6	3320169	3320174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_010524	GGC	2	6	3320180	3320185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_010524	GCA	2	6	3320233	3320238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_010524	TAC	2	6	3320288	3320293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6047	NC_010524	TGGC	2	8	3320344	3320351	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6048	NC_010524	CGG	2	6	3320393	3320398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_010524	CAA	2	6	3320540	3320545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_010524	CGG	2	6	3320564	3320569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_010524	GAT	2	6	3320579	3320584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_010524	TGG	2	6	3320677	3320682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_010524	GCA	2	6	3320700	3320705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_010524	GCG	3	9	3320709	3320717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_010524	ACG	2	6	3320751	3320756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_010524	GCT	2	6	3320783	3320788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_010524	CTT	2	6	3320812	3320817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_010524	CGCGG	2	10	3320900	3320909	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6059	NC_010524	GC	3	6	3320971	3320976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6060	NC_010524	GC	3	6	3320989	3320994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6061	NC_010524	GCC	2	6	3321009	3321014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6062	NC_010524	CGG	2	6	3323599	3323604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_010524	C	6	6	3323678	3323683	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6064	NC_010524	GCC	2	6	3323688	3323693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6065	NC_010524	CGT	2	6	3327449	3327454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6067	NC_010524	GGC	3	9	3327491	3327499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_010524	GCG	2	6	3327510	3327515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_010524	GCC	2	6	3327526	3327531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6078	NC_010524	GC	3	6	3339130	3339135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6079	NC_010524	GCG	2	6	3339148	3339153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6080	NC_010524	GAA	2	6	3339882	3339887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_010524	CTC	2	6	3345139	3345144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6082	NC_010524	GGACAG	2	12	3346323	3346334	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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6087	NC_010524	GGGT	2	8	3351879	3351886	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_010524	CGG	2	6	3351898	3351903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6090	NC_010524	CAC	2	6	3351931	3351936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6091	NC_010524	AATC	2	8	3351966	3351973	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6092	NC_010524	CAAT	2	8	3352309	3352316	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6093	NC_010524	ACG	2	6	3352328	3352333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6094	NC_010524	GACC	2	8	3359143	3359150	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6095	NC_010524	C	6	6	3359176	3359181	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6096	NC_010524	CCT	2	6	3359196	3359201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6097	NC_010524	GGC	2	6	3359205	3359210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6099	NC_010524	CGA	2	6	3359408	3359413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_010524	GCC	2	6	3359414	3359419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6101	NC_010524	CGGC	2	8	3371980	3371987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6102	NC_010524	GT	3	6	3385358	3385363	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_010524	GGTGCG	2	12	3386664	3386675	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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6105	NC_010524	CCG	2	6	3387336	3387341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6106	NC_010524	GC	3	6	3390254	3390259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6107	NC_010524	GCC	2	6	3390292	3390297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6108	NC_010524	GTGC	2	8	3390333	3390340	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6109	NC_010524	CA	3	6	3390355	3390360	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6110	NC_010524	CA	3	6	3391051	3391056	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6111	NC_010524	A	6	6	3394777	3394782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_010524	C	6	6	3394786	3394791	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6113	NC_010524	GCG	2	6	3394797	3394802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_010524	G	6	6	3394802	3394807	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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6118	NC_010524	ACTGC	2	10	3397341	3397350	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6119	NC_010524	CA	3	6	3397403	3397408	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6120	NC_010524	GCT	2	6	3397420	3397425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_010524	CAT	2	6	3398683	3398688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_010524	ACC	2	6	3400021	3400026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6123	NC_010524	CTTT	2	8	3401116	3401123	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6124	NC_010524	GCG	2	6	3401139	3401144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_010524	CGAC	2	8	3401149	3401156	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6126	NC_010524	ACC	2	6	3401304	3401309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6127	NC_010524	AGC	2	6	3401375	3401380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_010524	T	6	6	3401450	3401455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_010524	C	7	7	3401494	3401500	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6130	NC_010524	CAC	2	6	3401544	3401549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6131	NC_010524	TGC	2	6	3401576	3401581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6132	NC_010524	GGC	2	6	3401599	3401604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6133	NC_010524	AGC	2	6	3403141	3403146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6134	NC_010524	GT	3	6	3410057	3410062	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6135	NC_010524	TCGA	2	8	3410063	3410070	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6136	NC_010524	AG	3	6	3411223	3411228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6137	NC_010524	GC	3	6	3411244	3411249	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6138	NC_010524	GGGC	2	8	3412275	3412282	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6139	NC_010524	GCA	2	6	3412328	3412333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6140	NC_010524	GCC	2	6	3413418	3413423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6141	NC_010524	CGGAGA	3	18	3413471	3413488	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6142	NC_010524	ATC	2	6	3413697	3413702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6143	NC_010524	TGCA	2	8	3413761	3413768	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6144	NC_010524	CAC	2	6	3413777	3413782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6145	NC_010524	CGC	2	6	3415052	3415057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6146	NC_010524	GC	3	6	3415093	3415098	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6147	NC_010524	CA	3	6	3415108	3415113	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6148	NC_010524	GGC	2	6	3417146	3417151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6149	NC_010524	TCGC	2	8	3417171	3417178	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6150	NC_010524	TTC	2	6	3417181	3417186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6151	NC_010524	A	6	6	3417218	3417223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6152	NC_010524	AGAC	2	8	3418540	3418547	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6153	NC_010524	GGT	2	6	3418550	3418555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6154	NC_010524	CGC	2	6	3419704	3419709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6155	NC_010524	GCCGGT	2	12	3419840	3419851	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6156	NC_010524	GCCGGA	3	18	3419864	3419881	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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6161	NC_010524	GC	3	6	3420200	3420205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6162	NC_010524	CCG	2	6	3420287	3420292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6163	NC_010524	TG	3	6	3420521	3420526	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6164	NC_010524	ACAA	2	8	3420647	3420654	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6165	NC_010524	CGT	2	6	3420705	3420710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6166	NC_010524	AAG	2	6	3420754	3420759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6167	NC_010524	CGGG	2	8	3422669	3422676	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6168	NC_010524	CT	3	6	3422681	3422686	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6171	NC_010524	GC	3	6	3424171	3424176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6172	NC_010524	GCCCG	2	10	3424196	3424205	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6173	NC_010524	CGC	2	6	3424206	3424211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6175	NC_010524	T	6	6	3424269	3424274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6176	NC_010524	ACCCC	2	10	3424289	3424298	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
6177	NC_010524	C	6	6	3424295	3424300	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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6183	NC_010524	CACC	2	8	3438292	3438299	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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6202	NC_010524	CTG	3	9	3444694	3444702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6209	NC_010524	CGG	2	6	3451662	3451667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6210	NC_010524	ACCG	2	8	3452884	3452891	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6211	NC_010524	ATG	2	6	3452911	3452916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6220	NC_010524	CAA	2	6	3455322	3455327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6224	NC_010524	TCG	2	6	3456624	3456629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6227	NC_010524	TGCA	2	8	3456687	3456694	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6228	NC_010524	ATGCAC	2	12	3456794	3456805	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6229	NC_010524	CGT	2	6	3456850	3456855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6230	NC_010524	TGCA	2	8	3456863	3456870	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6231	NC_010524	C	10	10	3456957	3456966	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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6234	NC_010524	CCCA	2	8	3464716	3464723	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6235	NC_010524	GCC	2	6	3464777	3464782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6236	NC_010524	GCC	2	6	3464784	3464789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6237	NC_010524	CA	3	6	3464802	3464807	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6238	NC_010524	GCC	2	6	3464823	3464828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6239	NC_010524	ATCC	2	8	3464861	3464868	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6241	NC_010524	CGTC	2	8	3465724	3465731	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6242	NC_010524	GCC	2	6	3465758	3465763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6244	NC_010524	GCC	3	9	3471771	3471779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6248	NC_010524	CCAT	2	8	3474071	3474078	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6249	NC_010524	AAC	2	6	3474083	3474088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6250	NC_010524	ACG	2	6	3474177	3474182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6251	NC_010524	ACG	2	6	3474237	3474242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6252	NC_010524	CGC	2	6	3474265	3474270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6253	NC_010524	AC	3	6	3474276	3474281	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6254	NC_010524	GAG	2	6	3474284	3474289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6255	NC_010524	CG	3	6	3474837	3474842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6256	NC_010524	CG	3	6	3474854	3474859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6257	NC_010524	TCCG	2	8	3475428	3475435	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6258	NC_010524	CTG	2	6	3481746	3481751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6259	NC_010524	CGG	2	6	3481763	3481768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6261	NC_010524	GC	3	6	3481894	3481899	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6393	NC_010524	ACG	2	6	3519183	3519188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6452	NC_010524	GCCG	2	8	3552852	3552859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6479	NC_010524	CGTG	2	8	3574959	3574966	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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6499	NC_010524	CCCTG	2	10	3589405	3589414	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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