MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Leuconostoc citreum KM20 plasmid pLCK1

Total Repeats: 174

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010470	TTA	2	6	17	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010470	TTAA	2	8	30	37	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010470	AAATA	2	10	61	70	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010470	GAT	2	6	6007	6012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010470	ATC	2	6	6025	6030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010470	AAC	2	6	6059	6064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010470	AGTA	2	8	6467	6474	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010470	TAAA	2	8	6489	6496	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010470	TGAAG	2	10	6543	6552	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010470	ATT	2	6	6570	6575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010470	AAT	2	6	6589	6594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010470	T	6	6	6684	6689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010470	AT	3	6	6690	6695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010470	TAGA	2	8	6711	6718	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010470	T	7	7	6754	6760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010470	TTA	2	6	7418	7423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010470	TCT	2	6	7464	7469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010470	T	6	6	7497	7502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010470	TCGC	2	8	7805	7812	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_010470	TTA	2	6	7867	7872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010470	CAA	2	6	7898	7903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010470	ACA	2	6	7947	7952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010470	CCG	2	6	7975	7980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_010470	GTTTG	2	10	8020	8029	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010470	ATGA	2	8	8037	8044	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010470	GT	3	6	8566	8571	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010470	A	6	6	8595	8600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010470	T	6	6	8619	8624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010470	TAA	2	6	8630	8635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010470	ATAA	2	8	8637	8644	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010470	CT	3	6	8675	8680	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_010470	ATTA	2	8	8703	8710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010470	T	7	7	8767	8773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010470	T	6	6	8787	8792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010470	TGAT	2	8	8823	8830	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010470	A	7	7	8840	8846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010470	TAGT	2	8	8878	8885	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010470	CTC	2	6	10444	10449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_010470	CTTT	2	8	10862	10869	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_010470	ATTC	2	8	10870	10877	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_010470	A	7	7	10914	10920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010470	GTAAA	2	10	10942	10951	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010470	A	8	8	11238	11245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010470	TCG	2	6	11444	11449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010470	GTAT	2	8	11604	11611	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010470	TAT	2	6	11703	11708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010470	T	6	6	11713	11718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010470	TTA	2	6	11744	11749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010470	GAA	2	6	11774	11779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010470	T	10	10	12433	12442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010470	ATA	2	6	12447	12452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010470	TAA	3	9	12461	12469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010470	GTT	2	6	12473	12478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010470	GGT	3	9	12497	12505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010470	A	6	6	12658	12663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010470	GTT	2	6	12691	12696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010470	TTG	2	6	12700	12705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010470	TTATA	2	10	12774	12783	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010470	TTG	2	6	12808	12813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010470	TAT	2	6	12835	12840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010470	ATT	2	6	12858	12863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010470	AGT	2	6	12900	12905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010470	T	6	6	13000	13005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010470	A	7	7	14237	14243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010470	TA	4	8	14287	14294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010470	AT	3	6	14296	14301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010470	TTGAT	2	10	14347	14356	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010470	TA	4	8	14413	14420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010470	AT	3	6	14432	14437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010470	TGT	2	6	14468	14473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010470	TATAT	2	10	14491	14500	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010470	TAA	2	6	14510	14515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010470	A	6	6	14514	14519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010470	AAAAG	2	10	14524	14533	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010470	CCA	2	6	14534	14539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_010470	TACA	2	8	14561	14568	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_010470	TTTG	2	8	14574	14581	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010470	TAT	2	6	14595	14600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010470	ACA	2	6	14601	14606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_010470	TGT	2	6	14616	14621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010470	A	6	6	14745	14750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010470	ACT	2	6	14775	14780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010470	GTA	2	6	14826	14831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010470	T	7	7	14951	14957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010470	GACG	2	8	15024	15031	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_010470	GTTT	2	8	15051	15058	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010470	T	7	7	15067	15073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010470	TCAA	2	8	15125	15132	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_010470	TTGT	2	8	15144	15151	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010470	CAA	2	6	15154	15159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010470	CTT	2	6	15160	15165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_010470	GATTTA	2	12	15181	15192	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010470	A	7	7	15201	15207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010470	ATA	3	9	15217	15225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010470	TGT	2	6	15244	15249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010470	CG	3	6	15266	15271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_010470	TGG	2	6	15283	15288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010470	TTG	2	6	16382	16387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010470	ATA	2	6	16408	16413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010470	AGTT	2	8	16423	16430	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010470	A	7	7	16434	16440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010470	T	6	6	16485	16490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010470	TCT	2	6	16492	16497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_010470	GA	3	6	16506	16511	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010470	A	7	7	16514	16520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010470	AAT	2	6	16635	16640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010470	T	6	6	16646	16651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010470	T	7	7	16659	16665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010470	AGT	2	6	16682	16687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010470	TGA	2	6	16717	16722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010470	TATGT	2	10	16728	16737	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010470	ACT	2	6	16751	16756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_010470	GC	3	6	16784	16789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_010470	T	6	6	16864	16869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010470	GTT	2	6	16925	16930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010470	TAAGT	2	10	16950	16959	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010470	T	6	6	16962	16967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010470	T	8	8	16971	16978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010470	TTG	2	6	16992	16997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010470	T	7	7	17009	17015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010470	GTAG	2	8	17064	17071	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010470	AAG	2	6	18205	18210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010470	AAGCA	2	10	19824	19833	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_010470	CTG	2	6	19872	19877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_010470	CTG	2	6	19899	19904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_010470	TGG	2	6	19914	19919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010470	C	6	6	20005	20010	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
128	NC_010470	G	7	7	20023	20029	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010470	CTC	2	6	20060	20065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_010470	TAA	2	6	20118	20123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010470	TGA	2	6	20133	20138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010470	GAG	2	6	22957	22962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010470	A	6	6	23717	23722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010470	T	7	7	24894	24900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010470	ATC	2	6	25617	25622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_010470	AGTTA	2	10	28223	28232	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010470	GTG	2	6	28234	28239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010470	GGT	2	6	28262	28267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010470	AGGAA	2	10	28301	28310	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010470	TTAA	2	8	28452	28459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010470	AGT	2	6	28505	28510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010470	T	7	7	32748	32754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010470	AG	3	6	32769	32774	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010470	TCT	2	6	34769	34774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_010470	T	6	6	34802	34807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010470	A	6	6	34823	34828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010470	TTG	2	6	34845	34850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010470	GAA	2	6	34975	34980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010470	TCGC	2	8	35067	35074	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_010470	TTA	2	6	35129	35134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010470	CAA	2	6	35160	35165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_010470	ACA	2	6	35209	35214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_010470	CCG	2	6	35237	35242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
154	NC_010470	GTTTG	2	10	35282	35291	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
155	NC_010470	ATGA	2	8	35299	35306	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
156	NC_010470	TTG	2	6	35957	35962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_010470	ACC	2	6	36003	36008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_010470	TC	3	6	36014	36019	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
159	NC_010470	A	6	6	36131	36136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_010470	CAG	2	6	36196	36201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_010470	T	6	6	36722	36727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_010470	GTA	2	6	36728	36733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_010470	TAT	2	6	36738	36743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_010470	A	6	6	36762	36767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_010470	TAAA	2	8	36772	36779	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_010470	AAG	2	6	37583	37588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
167	NC_010470	TTA	2	6	38512	38517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_010470	A	7	7	38517	38523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_010470	TATT	2	8	38524	38531	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_010470	AAT	3	9	38532	38540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_010470	ATT	2	6	38560	38565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_010470	AAG	2	6	38644	38649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
173	NC_010470	ATT	2	6	38668	38673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_010470	T	7	7	38706	38712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.