MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Leuconostoc citreum KM20 plasmid pLCK3

Total Repeats: 133

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010467	TAT	2	6	11	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010467	TTTAA	2	10	171	180	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010467	ATA	2	6	200	205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010467	A	6	6	1959	1964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010467	TGAT	2	8	1975	1982	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010467	TGT	2	6	2074	2079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010467	TTA	2	6	2089	2094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010467	TAA	2	6	3062	3067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010467	AGT	2	6	3073	3078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010467	CGT	2	6	3215	3220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010467	A	7	7	3243	3249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010467	T	8	8	3275	3282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010467	GGTT	2	8	3288	3295	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010467	ATT	2	6	3296	3301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010467	GAT	2	6	3318	3323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010467	A	7	7	3340	3346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010467	T	6	6	3372	3377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010467	T	7	7	3452	3458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010467	CT	3	6	3503	3508	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_010467	T	6	6	3564	3569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010467	ATCTA	2	10	3636	3645	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_010467	TAA	2	6	3653	3658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010467	AAT	2	6	3663	3668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010467	TCA	2	6	3749	3754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010467	AC	3	6	3767	3772	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_010467	CA	3	6	3773	3778	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010467	TGG	2	6	3784	3789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010467	A	8	8	3801	3808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010467	TTG	2	6	3858	3863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010467	TA	3	6	3879	3884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010467	TTTG	2	8	3920	3927	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010467	TGA	2	6	3980	3985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010467	AACA	2	8	3998	4005	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_010467	TAA	2	6	4574	4579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010467	ACA	2	6	4596	4601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010467	ATA	2	6	4618	4623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010467	TTG	2	6	4679	4684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010467	AGAACT	2	12	4721	4732	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_010467	TTAC	2	8	4748	4755	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_010467	TAT	2	6	4756	4761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010467	CAGA	2	8	4839	4846	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_010467	AAC	2	6	4892	4897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010467	GTC	2	6	4938	4943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010467	AAT	2	6	4961	4966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010467	AAG	2	6	5028	5033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010467	AGAGA	2	10	5131	5140	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010467	AGA	2	6	5168	5173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010467	TCAAA	2	10	5271	5280	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_010467	AAAT	2	8	5334	5341	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010467	TTG	2	6	5342	5347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010467	TAG	2	6	5987	5992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010467	AT	3	6	5995	6000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010467	TTA	2	6	6047	6052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010467	AAC	2	6	6083	6088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010467	AAT	2	6	6111	6116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010467	TAT	2	6	6123	6128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010467	CCT	2	6	6771	6776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_010467	ATA	2	6	6820	6825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010467	A	7	7	6888	6894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010467	GT	3	6	6904	6909	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010467	CTC	2	6	6962	6967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_010467	TATT	2	8	7015	7022	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010467	AGTT	2	8	7027	7034	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010467	A	6	6	7049	7054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010467	TATGT	2	10	7068	7077	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010467	AAT	2	6	7096	7101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010467	ATT	2	6	7696	7701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010467	GATAA	2	10	7720	7729	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010467	TAA	2	6	7744	7749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010467	GGTT	2	8	7773	7780	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010467	T	7	7	7789	7795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010467	A	6	6	7840	7845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010467	AGT	2	6	7858	7863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010467	A	6	6	7941	7946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010467	AAC	2	6	7961	7966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010467	AACA	2	8	7985	7992	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_010467	AAT	2	6	8011	8016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010467	A	6	6	8033	8038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010467	ATT	2	6	8100	8105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010467	GTT	2	6	8277	8282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010467	CAC	2	6	8293	8298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_010467	TGA	2	6	8376	8381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010467	ATA	2	6	8421	8426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010467	TGAT	2	8	8427	8434	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010467	ATT	2	6	8464	8469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010467	TAA	2	6	8830	8835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010467	TA	3	6	8845	8850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010467	GAA	2	6	10118	10123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010467	TAT	2	6	10878	10883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010467	AGA	3	9	10908	10916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010467	TA	3	6	10941	10946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010467	AGG	2	6	10948	10953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010467	TTACTT	2	12	12315	12326	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_010467	ATA	2	6	12357	12362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010467	AT	3	6	12368	12373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010467	AGA	2	6	12423	12428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010467	AGT	2	6	12432	12437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010467	TAAAA	2	10	13118	13127	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010467	TA	6	12	13465	13476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010467	T	7	7	13515	13521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010467	ATTG	2	8	13609	13616	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010467	TGA	2	6	13675	13680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010467	AGT	2	6	13765	13770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010467	ATA	2	6	13803	13808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010467	T	6	6	13813	13818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010467	AGA	2	6	13843	13848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010467	AT	3	6	13855	13860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010467	GAATT	2	10	13878	13887	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010467	AAT	2	6	13912	13917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010467	TGTT	2	8	14526	14533	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010467	GGGA	2	8	14557	14564	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010467	GA	4	8	14578	14585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010467	TGA	2	6	14592	14597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010467	GA	3	6	14611	14616	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010467	T	7	7	15829	15835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010467	CTA	2	6	15881	15886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_010467	CTTT	2	8	15904	15911	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_010467	TAT	2	6	16173	16178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010467	ATT	2	6	16195	16200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010467	CCG	2	6	16310	16315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_010467	ATA	2	6	16333	16338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010467	AGG	2	6	16367	16372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010467	T	6	6	16492	16497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010467	GAG	2	6	16498	16503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010467	T	6	6	16507	16512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010467	TAA	2	6	17796	17801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010467	CAA	2	6	17807	17812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_010467	ATT	2	6	17863	17868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010467	ATC	2	6	17891	17896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_010467	A	6	6	17897	17902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010467	TGT	2	6	17927	17932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010467	T	7	7	17949	17955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010467	TAA	2	6	17964	17969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.