MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lysinibacillus sphaericus C3-41 chromosome

Total Repeats: 322

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010382	TAGGCG	2	12	13527	13538	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_010382	ATAAAA	2	12	16595	16606	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010382	TAGGCG	2	12	20242	20253	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_010382	ATTTAT	2	12	33008	33019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010382	ATTTTT	2	12	45550	45561	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010382	TAGGCG	2	12	52667	52678	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_010382	TTTTTA	2	12	68031	68042	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010382	TTATAT	2	12	108695	108706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010382	TAGGCG	2	12	112663	112674	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_010382	TGATAA	2	12	145959	145970	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010382	TGTTTT	2	12	157954	157965	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010382	TAATTT	2	12	205606	205617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010382	AAAATT	2	12	208862	208873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010382	TAGGCG	2	12	225471	225482	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_010382	TAATAC	2	12	285570	285581	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_010382	CAAAAA	2	12	323975	323986	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_010382	AATAAA	2	12	324102	324113	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010382	TAGGCG	2	12	361020	361031	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_010382	TCTATT	2	12	379977	379988	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_010382	CGGTGG	2	12	420622	420633	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_010382	AAAAGA	2	12	423038	423049	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010382	TGTAAG	2	12	442855	442866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010382	GCAGGC	2	12	454698	454709	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010382	AAAGCT	2	12	457670	457681	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_010382	TAATAT	2	12	471935	471946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010382	ACTAAC	2	12	475092	475103	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010382	TTTGAA	2	12	479397	479408	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010382	GCTCAA	2	12	500898	500909	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010382	TTTTAT	2	12	509346	509357	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010382	TTACAT	2	12	515793	515804	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_010382	TAATTA	2	12	518655	518666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010382	ATCAAT	2	12	578592	578603	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_010382	AATCTC	2	12	623196	623207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010382	TAGGCG	2	12	647829	647840	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_010382	TAAAAT	2	12	662542	662553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010382	CGATAG	2	12	663072	663083	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_010382	CTCCCA	2	12	678390	678401	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_010382	GCGATT	2	12	691566	691577	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_010382	TTTAAT	2	12	714565	714576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010382	AAATGA	2	12	726286	726297	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010382	ATCAAT	2	12	730211	730222	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_010382	TAGCAT	2	12	736282	736293	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_010382	TTGGAT	2	12	744182	744193	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010382	CTATAA	2	12	745761	745772	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_010382	TAGGCG	2	12	761976	761987	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_010382	GAAAAA	2	12	779300	779311	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010382	CTAAAA	2	12	791868	791879	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_010382	ATTATC	2	12	831475	831486	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_010382	ATTAAT	2	12	842953	842964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010382	AAATAA	2	12	843532	843543	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010382	AAGTTA	2	12	852171	852182	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010382	CATAAA	2	12	856361	856372	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_010382	ATTATC	2	12	868095	868106	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_010382	ATGTGT	2	12	870663	870674	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010382	TCTACG	2	12	878104	878115	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010382	GCAACC	2	12	879203	879214	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
57	NC_010382	ATTTGT	2	12	881646	881657	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010382	CAAGAA	2	12	923815	923826	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_010382	TAGGCG	2	12	943292	943303	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_010382	ACCATA	2	12	945375	945386	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010382	AAATTT	2	12	945868	945879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010382	AGTTTA	2	12	1006498	1006509	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010382	TTCATT	2	12	1006510	1006521	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_010382	GTTAAC	2	12	1014555	1014566	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_010382	AAATGG	2	12	1025084	1025095	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010382	ATGGGG	2	12	1027266	1027277	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010382	AAAGCA	2	12	1037385	1037396	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_010382	TGTTTC	2	12	1098588	1098599	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_010382	AAAGAA	2	12	1103333	1103344	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010382	TAGGGG	2	12	1112174	1112185	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010382	GATATA	2	12	1113603	1113614	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010382	CTTTTT	2	12	1128429	1128440	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_010382	TGGGGA	2	12	1129651	1129662	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010382	TGATAA	2	12	1134540	1134551	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010382	AATCTA	2	12	1140372	1140383	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_010382	TATTTG	2	12	1140914	1140925	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010382	TCGAAT	2	12	1144028	1144039	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_010382	ACTAAA	2	12	1144250	1144261	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_010382	AATTAC	2	12	1153029	1153040	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_010382	GTTGAT	2	12	1153191	1153202	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010382	TAAATA	2	12	1160484	1160495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010382	GGTAAG	2	12	1171312	1171323	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010382	GATATA	2	12	1175820	1175831	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010382	AGTATG	2	12	1184341	1184352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010382	TGTCCG	2	12	1191574	1191585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010382	TTTGCA	2	12	1207584	1207595	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_010382	TCAAAT	2	12	1222035	1222046	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_010382	AGATGA	2	12	1251649	1251660	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010382	ATAAGA	2	12	1255098	1255109	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010382	TTTTTG	2	12	1266077	1266088	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010382	TTTTTA	2	12	1304787	1304798	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010382	GGCGGG	2	12	1379781	1379792	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_010382	ATACAC	2	12	1432436	1432447	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_010382	ATAACT	2	12	1467833	1467844	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_010382	ATGCAC	2	12	1503497	1503508	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010382	TATTAG	2	12	1524137	1524148	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010382	ATTTGC	2	12	1524500	1524511	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_010382	CATTAG	2	12	1524586	1524597	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_010382	TTTTAC	2	12	1524640	1524651	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_010382	ATTTTG	2	12	1574611	1574622	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010382	TAAATA	2	12	1600258	1600269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010382	AGCAAA	2	12	1631787	1631798	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_010382	GTAAAA	2	12	1633645	1633656	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010382	CTTTTT	2	12	1635203	1635214	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_010382	AAATAA	2	12	1735602	1735613	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010382	TTTACT	2	12	1817258	1817269	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_010382	ACATAA	2	12	1821706	1821717	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_010382	TAAAGC	2	12	1839270	1839281	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_010382	TAAAAA	2	12	1854881	1854892	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010382	AAGTAA	2	12	1857859	1857870	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010382	TAAATA	2	12	1860555	1860566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010382	GTTTTT	2	12	1871128	1871139	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010382	GATAAT	2	12	1879261	1879272	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010382	GTTACT	2	12	1881663	1881674	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_010382	AAAGTT	2	12	1930912	1930923	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010382	TCATTT	2	12	1947601	1947612	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_010382	TTTGAC	2	12	1975694	1975705	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_010382	TTGTCT	2	12	1997961	1997972	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_010382	CATACA	2	12	2000770	2000781	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_010382	TCAAAT	2	12	2028631	2028642	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_010382	TGTACT	2	12	2038388	2038399	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_010382	TTATGG	2	12	2048746	2048757	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010382	CAAGAG	2	12	2058798	2058809	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_010382	GAAAGA	2	12	2065631	2065642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010382	TTTGAT	2	12	2077785	2077796	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010382	ATTTTT	2	12	2079479	2079490	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010382	TATAAA	2	12	2088870	2088881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010382	CATTGC	2	12	2091134	2091145	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_010382	ATAAGA	2	12	2098452	2098463	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010382	ATTAGA	2	12	2136080	2136091	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010382	ATGCAT	2	12	2136455	2136466	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_010382	AGGTAA	2	12	2142461	2142472	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010382	CGACTA	2	12	2179375	2179386	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_010382	ATTTTT	2	12	2181639	2181650	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010382	TAAAAG	2	12	2207506	2207517	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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137	NC_010382	ATTATA	2	12	2242399	2242410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010382	ATTTGA	2	12	2243084	2243095	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010382	ATACCG	2	12	2247215	2247226	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_010382	CAATAT	2	12	2254152	2254163	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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143	NC_010382	GGGGAT	2	12	2323527	2323538	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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148	NC_010382	TCTCCT	2	12	2378822	2378833	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_010382	TCTTTC	2	12	2391414	2391425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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157	NC_010382	TCTTTC	2	12	2438617	2438628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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248	NC_010382	TTCACC	2	12	3363294	3363305	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
249	NC_010382	CTAATG	2	12	3389622	3389633	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
250	NC_010382	AAGCCT	2	12	3403223	3403234	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
251	NC_010382	GAAAAA	2	12	3405982	3405993	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
252	NC_010382	TAAATA	2	12	3424524	3424535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_010382	AAGCAT	2	12	3444752	3444763	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
254	NC_010382	ACTTTA	2	12	3449338	3449349	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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261	NC_010382	ATTCAA	2	12	3501565	3501576	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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269	NC_010382	AAAATA	2	12	3708562	3708573	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.