MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus helveticus DPC 4571

Total Repeats: 12950

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_010080	ATA	2	6	2022899	2022904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12502	NC_010080	ATTT	2	8	2022920	2022927	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_010080	CTAT	2	8	2022929	2022936	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12504	NC_010080	GCA	3	9	2022980	2022988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12505	NC_010080	TAAT	2	8	2023026	2023033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12506	NC_010080	GTT	2	6	2023053	2023058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12507	NC_010080	AGC	2	6	2023093	2023098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12508	NC_010080	CATC	2	8	2023110	2023117	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12509	NC_010080	ATA	2	6	2023157	2023162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12510	NC_010080	TCT	2	6	2023238	2023243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12511	NC_010080	GAT	2	6	2023295	2023300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_010080	ATT	2	6	2023376	2023381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_010080	CAG	2	6	2023454	2023459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12514	NC_010080	CAA	2	6	2023518	2023523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12515	NC_010080	TCA	2	6	2023526	2023531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12516	NC_010080	A	7	7	2023566	2023572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12517	NC_010080	CAG	2	6	2023575	2023580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12518	NC_010080	CAA	2	6	2023600	2023605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12519	NC_010080	CTT	2	6	2023712	2023717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12520	NC_010080	TAT	2	6	2023782	2023787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12521	NC_010080	A	6	6	2023801	2023806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_010080	ATT	3	9	2023819	2023827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_010080	GGA	2	6	2023831	2023836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_010080	GTT	2	6	2023843	2023848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12525	NC_010080	ATCC	2	8	2023853	2023860	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12526	NC_010080	AATTA	2	10	2023881	2023890	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12527	NC_010080	TACA	2	8	2023935	2023942	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12528	NC_010080	TTAA	2	8	2026467	2026474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12529	NC_010080	TA	3	6	2026488	2026493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12530	NC_010080	ACCT	2	8	2029258	2029265	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12531	NC_010080	AAATG	2	10	2029279	2029288	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12532	NC_010080	AAGT	2	8	2029294	2029301	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_010080	AAAT	2	8	2029317	2029324	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12534	NC_010080	ATAA	2	8	2029346	2029353	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12535	NC_010080	ATT	2	6	2029416	2029421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12536	NC_010080	TAA	2	6	2029444	2029449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12537	NC_010080	TTA	2	6	2029451	2029456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12538	NC_010080	AAT	2	6	2029469	2029474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12539	NC_010080	TTA	2	6	2029475	2029480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12540	NC_010080	TAC	2	6	2029494	2029499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12541	NC_010080	AAT	2	6	2029507	2029512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12542	NC_010080	ATC	2	6	2029519	2029524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12543	NC_010080	TTAAA	2	10	2029555	2029564	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12544	NC_010080	TAT	2	6	2029593	2029598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12545	NC_010080	T	7	7	2029603	2029609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12546	NC_010080	CAT	2	6	2029685	2029690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12547	NC_010080	AAT	2	6	2029754	2029759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12548	NC_010080	GTT	2	6	2029815	2029820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12549	NC_010080	TGA	2	6	2029872	2029877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12550	NC_010080	AAAC	2	8	2031023	2031030	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12551	NC_010080	T	6	6	2031039	2031044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_010080	TTA	2	6	2031111	2031116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12553	NC_010080	T	6	6	2031179	2031184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12554	NC_010080	ATGTA	2	10	2031204	2031213	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12555	NC_010080	TACT	2	8	2031228	2031235	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12556	NC_010080	CAACT	2	10	2031240	2031249	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
12557	NC_010080	T	7	7	2031249	2031255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12558	NC_010080	TCAT	2	8	2031261	2031268	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12559	NC_010080	CTC	2	6	2031270	2031275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12560	NC_010080	AAT	2	6	2031282	2031287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12561	NC_010080	A	7	7	2031294	2031300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12562	NC_010080	GCAA	2	8	2031400	2031407	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12563	NC_010080	GTA	2	6	2031458	2031463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12564	NC_010080	TA	3	6	2031462	2031467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12565	NC_010080	TA	3	6	2031495	2031500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12566	NC_010080	TCAT	2	8	2031517	2031524	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12567	NC_010080	CTC	2	6	2031530	2031535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12568	NC_010080	TAA	2	6	2031551	2031556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12569	NC_010080	CCTTTT	2	12	2031577	2031588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12570	NC_010080	T	6	6	2031585	2031590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12571	NC_010080	ATCA	2	8	2031635	2031642	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12572	NC_010080	AGT	2	6	2031822	2031827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12575	NC_010080	CAT	2	6	2032215	2032220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12577	NC_010080	GCT	2	6	2032274	2032279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12578	NC_010080	TAA	2	6	2032381	2032386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12580	NC_010080	CTTT	2	8	2032434	2032441	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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12589	NC_010080	TCAT	2	8	2032955	2032962	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12590	NC_010080	CAAA	2	8	2032982	2032989	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12591	NC_010080	TGT	2	6	2033024	2033029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12593	NC_010080	AAGA	2	8	2033116	2033123	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12594	NC_010080	A	9	9	2033136	2033144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12595	NC_010080	A	6	6	2033146	2033151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12596	NC_010080	TCA	2	6	2033159	2033164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12598	NC_010080	ATTA	2	8	2033249	2033256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12599	NC_010080	CTT	2	6	2033264	2033269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12600	NC_010080	TCG	2	6	2033275	2033280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12602	NC_010080	T	6	6	2033418	2033423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12603	NC_010080	T	6	6	2033505	2033510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12608	NC_010080	ATA	2	6	2036800	2036805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12611	NC_010080	ATA	2	6	2036847	2036852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12612	NC_010080	TAA	2	6	2036881	2036886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12613	NC_010080	A	7	7	2036891	2036897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12614	NC_010080	TGA	2	6	2036902	2036907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12615	NC_010080	TAC	2	6	2036923	2036928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12616	NC_010080	TTG	2	6	2036934	2036939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12622	NC_010080	T	6	6	2037421	2037426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12623	NC_010080	TTA	2	6	2039660	2039665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12625	NC_010080	ATT	2	6	2040635	2040640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12627	NC_010080	TAT	2	6	2040655	2040660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12628	NC_010080	ACCT	2	8	2040702	2040709	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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12891	NC_010080	CTA	2	6	2069762	2069767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.