MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris MG1363 chromosome

Total Repeats: 154

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009004	TAATAT	2	12	52991	53002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009004	TGAAAA	2	12	54347	54358	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009004	TTTTAA	2	12	54937	54948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009004	TAAAAT	2	12	62061	62072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009004	TAAAAA	2	12	92734	92745	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009004	TAAAAA	2	12	150516	150527	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009004	TTATTT	2	12	173441	173452	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009004	TATAAA	2	12	177675	177686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009004	AAAACA	2	12	188183	188194	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_009004	TGATTT	2	12	191289	191300	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009004	TAAAAA	2	12	220398	220409	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009004	TGAAAA	2	12	222158	222169	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009004	TCAAAA	2	12	225318	225329	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_009004	ATTCTA	2	12	262333	262344	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_009004	GAAAAT	2	12	275477	275488	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009004	TTTAAA	2	12	293007	293018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009004	AAGTTT	2	12	322710	322721	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009004	TTGTTT	2	12	323149	323160	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009004	ATTTTT	2	12	341225	341236	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009004	ACTTTG	2	12	353538	353549	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_009004	TTAAAA	2	12	383502	383513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009004	TAAAAT	2	12	385798	385809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009004	TAAAAA	2	12	403734	403745	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009004	ATGAAA	2	12	428321	428332	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009004	TTTTTA	2	12	433157	433168	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009004	TTTTAA	2	12	438802	438813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009004	ACACCG	2	12	438895	438906	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009004	TGTTTT	2	12	460966	460977	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009004	AAAATA	2	12	472151	472162	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009004	TTATTT	2	12	472497	472508	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009004	TGGAAG	2	12	516112	516123	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009004	TATAAT	2	12	546905	546916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009004	AGCATA	2	12	561299	561310	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_009004	GGTTAA	2	12	579554	579565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009004	ATTTAT	2	12	585359	585370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009004	TGTTAA	2	12	595809	595820	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009004	TAATTT	2	12	628188	628199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009004	AAGAAA	2	12	642755	642766	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009004	AAGTTC	2	12	648103	648114	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_009004	TAAACT	2	12	668773	668784	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_009004	ATTTTT	2	12	669977	669988	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009004	CTCAAA	2	12	676423	676434	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009004	ATTTAT	2	12	696802	696813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009004	TTACTT	2	12	706013	706024	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_009004	AAAATG	2	12	728448	728459	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009004	AACTAA	2	12	800313	800324	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_009004	AACAAA	2	12	800382	800393	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_009004	CAAATA	3	18	820409	820426	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_009004	CTGACA	2	12	826551	826562	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009004	TAAAAA	2	12	852587	852598	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009004	TAAAAA	2	12	869866	869877	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009004	ATTTTT	2	12	873472	873483	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009004	AGTAAT	2	12	889984	889995	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009004	TACTTA	2	12	892951	892962	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_009004	ATTTTA	2	12	893487	893498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009004	ATATAA	2	12	896535	896546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009004	ATAAAT	2	12	903204	903215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009004	TATAAA	2	12	945209	945220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009004	TACTTT	2	12	961089	961100	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_009004	TTTCTA	2	12	963223	963234	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_009004	TTATCT	2	12	978712	978723	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_009004	CTAGAA	2	12	984583	984594	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_009004	TGACAA	2	12	984798	984809	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_009004	ATTGAA	2	12	997901	997912	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009004	AGCAAA	2	12	1004632	1004643	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_009004	ATAAAT	2	12	1023532	1023543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009004	TAAAAA	2	12	1024758	1024769	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009004	AACTGC	2	12	1029102	1029113	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009004	AAAAAG	2	12	1072289	1072300	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009004	AAAGAA	2	12	1076623	1076634	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009004	TATTTT	2	12	1089185	1089196	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009004	AATAAA	2	12	1094799	1094810	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009004	TTTATT	2	12	1111863	1111874	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009004	AATATT	2	12	1115379	1115390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009004	AGTTGA	2	12	1180594	1180605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009004	GAATAA	2	12	1207041	1207052	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009004	TTAGAA	2	12	1207316	1207327	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009004	AATAAA	2	12	1226191	1226202	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009004	TTAAAT	2	12	1245393	1245404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009004	TATTTA	2	12	1262956	1262967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009004	GATTAT	2	12	1298703	1298714	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009004	AAAAAG	2	12	1300951	1300962	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009004	ACTCTG	2	12	1341745	1341756	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_009004	TGAGCT	2	12	1379019	1379030	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_009004	AATAAA	2	12	1404638	1404649	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009004	TTTTAC	2	12	1408823	1408834	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_009004	AAAGGA	2	12	1412895	1412906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009004	TTTTAA	2	12	1482085	1482096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009004	TTTTAT	2	12	1497215	1497226	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009004	TATTTT	2	12	1499955	1499966	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009004	CAAATC	2	12	1500669	1500680	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_009004	CTTATA	2	12	1526267	1526278	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_009004	TTTTAT	2	12	1534997	1535008	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009004	GGTTAT	2	12	1613988	1613999	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009004	CGTAAA	2	12	1629901	1629912	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_009004	TATAGT	2	12	1643728	1643739	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009004	AAGCTT	2	12	1652113	1652124	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_009004	TAAATT	2	12	1653294	1653305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009004	TTGATT	2	12	1659559	1659570	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009004	TAAAAA	2	12	1660118	1660129	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009004	TTGAAT	2	12	1683585	1683596	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009004	ATTTCT	2	12	1686884	1686895	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_009004	TCTTCA	2	12	1698459	1698470	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_009004	ATTTTG	2	12	1702917	1702928	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009004	TATATT	2	12	1713830	1713841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009004	TGGAAT	2	12	1719530	1719541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009004	AAATCT	2	12	1728561	1728572	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_009004	TTTTTA	2	12	1730197	1730208	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009004	TTTTAT	2	12	1792537	1792548	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009004	ATTTTG	2	12	1831119	1831130	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009004	TTTTAT	2	12	1912220	1912231	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009004	AGTTTG	2	12	1931612	1931623	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009004	TTTTGT	2	12	1933806	1933817	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009004	TTATTT	2	12	1935461	1935472	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009004	CTCTTT	2	12	1936793	1936804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_009004	ATTTAT	2	12	1940657	1940668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009004	TTTTTA	2	12	1955494	1955505	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009004	TTTCAT	2	12	1986030	1986041	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_009004	TATAAA	2	12	1989950	1989961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009004	AAAAGA	2	12	2021651	2021662	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009004	TATCCT	2	12	2051315	2051326	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_009004	TATTTG	2	12	2064302	2064313	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009004	TTAAAA	2	12	2099466	2099477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009004	TTTACA	2	12	2127561	2127572	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_009004	CTTCCA	2	12	2131149	2131160	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_009004	AAAACA	2	12	2171351	2171362	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_009004	TAATAG	2	12	2175213	2175224	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009004	ATAAAA	2	12	2175510	2175521	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009004	TGGGAG	2	12	2182003	2182014	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009004	TCTTTT	2	12	2183561	2183572	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_009004	TAAAAG	2	12	2207075	2207086	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009004	TGTTTT	2	12	2214148	2214159	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009004	TTTTTA	2	12	2233371	2233382	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009004	ACAATT	2	12	2243790	2243801	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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138	NC_009004	TTTTTA	2	12	2313711	2313722	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.