MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria welshimeri serovar 6b str. SLCC5334 chromosome

Total Repeats: 353

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008555	ATTTT	2	10	4497	4506	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008555	ATAAA	2	10	23879	23888	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008555	GAAAA	2	10	24827	24836	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008555	TAGTG	2	10	33370	33379	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008555	TAAAA	2	10	38781	38790	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008555	TTATG	2	10	40989	40998	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008555	ATTTT	2	10	46671	46680	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008555	TTTAG	2	10	78285	78294	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008555	GGATA	2	10	86304	86313	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008555	ATATC	2	10	93189	93198	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_008555	TGTTA	2	10	93230	93239	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008555	AAAAT	2	10	94790	94799	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008555	CATTC	2	10	125003	125012	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_008555	TTAAT	2	10	126491	126500	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008555	GATAA	2	10	128326	128335	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008555	ATGCT	2	10	144471	144480	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_008555	ATAGA	2	10	159100	159109	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008555	ACAAA	2	10	164989	164998	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_008555	GAGTG	2	10	172122	172131	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008555	GAAAA	2	10	188430	188439	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008555	GAAAA	2	10	188633	188642	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008555	GAAAA	2	10	188836	188845	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008555	GAATA	2	10	191923	191932	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008555	AAATT	2	10	193608	193617	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008555	TAATT	2	10	193810	193819	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008555	TCGTG	2	10	194969	194978	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_008555	AAGGT	2	10	196437	196446	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008555	TAATT	2	10	199833	199842	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008555	TCGTG	2	10	200992	201001	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_008555	AAGGT	2	10	202460	202469	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008555	GGCAT	2	10	219285	219294	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_008555	CTTTT	2	10	222161	222170	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_008555	AGTGA	2	10	244273	244282	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008555	TATTG	2	10	246496	246505	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008555	ACTAA	2	10	252216	252225	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_008555	TCTTT	2	10	256364	256373	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_008555	AAAAG	2	10	267183	267192	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008555	CAATT	2	10	277176	277185	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_008555	TAAAC	2	10	292083	292092	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_008555	GTATT	2	10	301661	301670	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008555	CTATG	2	10	311538	311547	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_008555	AAATT	2	10	314722	314731	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008555	TAAAA	2	10	322234	322243	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008555	TTCTT	2	10	336552	336561	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_008555	AAAAT	2	10	351086	351095	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008555	TCCAA	2	10	372075	372084	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_008555	AGGTG	2	10	391324	391333	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008555	GGAAA	2	10	396458	396467	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008555	ATTTT	2	10	419619	419628	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008555	TAAGT	2	10	423299	423308	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008555	GTTTT	2	10	425261	425270	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008555	AAGAA	2	10	428780	428789	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008555	AAAGA	2	10	428887	428896	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008555	CAAAA	2	10	435155	435164	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_008555	GGGTT	2	10	460496	460505	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008555	GAAAT	2	10	460728	460737	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008555	ATACA	2	10	487962	487971	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_008555	TATAG	2	10	519728	519737	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008555	ATAAA	2	10	519832	519841	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008555	AATTA	2	10	547301	547310	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008555	TAAAA	2	10	552125	552134	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008555	TTTTA	2	10	554213	554222	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008555	CTATG	2	10	554357	554366	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_008555	TTAAT	2	10	555623	555632	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008555	ATAAA	2	10	574895	574904	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008555	CAAAA	2	10	581475	581484	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_008555	ATTAA	2	10	602942	602951	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008555	AGAAA	2	10	621350	621359	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008555	CAACT	2	10	640724	640733	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
70	NC_008555	ATAAA	2	10	642429	642438	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008555	GAGAA	2	10	647362	647371	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008555	TGATA	2	10	660536	660545	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008555	ATTTA	2	10	664402	664411	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008555	TTACT	2	10	667090	667099	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_008555	TGGAT	2	10	667144	667153	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008555	GAAAT	2	10	671334	671343	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008555	TATTG	2	10	673270	673279	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008555	TATTT	2	10	688894	688903	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008555	AGAGA	2	10	689045	689054	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008555	CTTTT	2	10	690021	690030	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_008555	TATAA	2	10	723716	723725	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008555	CTTTT	2	10	743211	743220	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_008555	TTTTG	2	10	759206	759215	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008555	AAAGG	2	10	788088	788097	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008555	GCTTT	2	10	805769	805778	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_008555	CCCAG	2	10	805897	805906	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
87	NC_008555	TTAAA	2	10	826446	826455	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008555	GGGAG	2	10	829590	829599	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008555	TAGAA	2	10	831828	831837	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008555	ATAAA	2	10	834611	834620	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008555	GTATA	2	10	835583	835592	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008555	AATAA	2	10	839094	839103	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008555	ATTTT	2	10	842678	842687	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008555	AATGA	2	10	842722	842731	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008555	TTGTT	2	10	847758	847767	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008555	GTTTT	2	10	853901	853910	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008555	ATAGA	2	10	871632	871641	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008555	AGACA	2	10	875164	875173	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_008555	CATAA	2	10	875377	875386	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_008555	TAAAG	2	10	877661	877670	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008555	TGGAA	2	10	910061	910070	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008555	CGAGT	2	10	910567	910576	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_008555	TTACT	2	10	910609	910618	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_008555	ATAGA	2	10	919611	919620	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008555	TAAAA	2	10	943360	943369	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008555	ATTTT	2	10	943732	943741	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008555	TTTAT	2	10	943965	943974	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008555	AAAAG	2	10	950862	950871	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008555	GAAAA	2	10	955716	955725	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008555	TTTTA	2	10	973979	973988	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008555	TTAAT	2	10	974065	974074	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008555	ATTAC	2	10	981861	981870	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_008555	TATAA	2	10	988531	988540	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008555	AGATA	2	10	1004988	1004997	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008555	GAGAG	2	10	1013935	1013944	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008555	TAGAA	2	10	1014308	1014317	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008555	TTCTA	2	10	1018620	1018629	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_008555	TAGAA	2	10	1021948	1021957	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008555	TTTTC	2	10	1022511	1022520	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_008555	AGTTT	2	10	1032405	1032414	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008555	TAATT	2	10	1032823	1032832	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008555	TAGGA	2	10	1040246	1040255	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008555	GTTTT	2	10	1040256	1040265	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008555	ATTTT	2	10	1042821	1042830	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008555	CTTTT	2	10	1044129	1044138	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_008555	AAAGC	2	10	1050061	1050070	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_008555	TTATT	2	10	1050104	1050113	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008555	AAGTT	2	10	1058222	1058231	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008555	ATAAA	2	10	1058276	1058285	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008555	GCTAT	2	10	1059148	1059157	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_008555	AATAA	2	10	1061210	1061219	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008555	TTTTC	2	10	1071236	1071245	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_008555	TTTTC	2	10	1073115	1073124	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_008555	TTATA	2	10	1091901	1091910	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008555	TTATC	2	10	1101274	1101283	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_008555	TTGAT	2	10	1102447	1102456	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008555	TTATT	2	10	1114814	1114823	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008555	TGTCA	2	10	1122794	1122803	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_008555	GTGAG	2	10	1127845	1127854	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008555	AAATA	2	10	1141568	1141577	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008555	TAAAA	2	10	1175210	1175219	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008555	ATTTA	2	10	1175238	1175247	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008555	GAAAG	2	10	1176670	1176679	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008555	CTTTT	2	10	1177830	1177839	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_008555	TTTAA	2	10	1193436	1193445	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008555	TCTTT	2	10	1195216	1195225	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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148	NC_008555	TAAAA	2	10	1202708	1202717	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_008555	AAATA	2	10	1426172	1426181	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_008555	TTTAT	2	10	1432662	1432671	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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344	NC_008555	TATAG	2	10	2710860	2710869	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
345	NC_008555	TTTTA	2	10	2714997	2715006	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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349	NC_008555	CACTC	2	10	2772815	2772824	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
350	NC_008555	GTTCT	2	10	2789632	2789641	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
351	NC_008555	ATTAT	2	10	2791945	2791954	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.