MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria welshimeri serovar 6b str. SLCC5334 chromosome

Total Repeats: 1239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008555	TAAT	2	8	1	8	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008555	ATTA	3	12	1810	1821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008555	AATA	2	8	4511	4518	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008555	AAAG	2	8	6005	6012	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008555	TTGT	2	8	15900	15907	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008555	AATT	2	8	20271	20278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008555	CATA	2	8	23926	23933	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_008555	TTAT	2	8	24801	24808	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008555	AGGA	2	8	29903	29910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008555	ATAA	2	8	33460	33467	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008555	AGTG	2	8	33538	33545	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008555	GCTC	2	8	35692	35699	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008555	ATAA	2	8	37783	37790	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008555	AACA	2	8	38907	38914	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_008555	TTTA	2	8	38974	38981	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008555	AGTT	2	8	40922	40929	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008555	GTTA	2	8	40978	40985	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008555	CATA	2	8	47059	47066	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008555	TTTA	2	8	59988	59995	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008555	ATAA	2	8	62929	62936	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008555	TTAT	2	8	63514	63521	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008555	ATCA	2	8	63676	63683	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_008555	AGGT	2	8	63827	63834	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008555	CTAA	2	8	65476	65483	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_008555	CTTT	2	8	65500	65507	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_008555	GAAG	2	8	71689	71696	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008555	TATC	2	8	76132	76139	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_008555	AATT	2	8	76492	76499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008555	TCTA	2	8	76649	76656	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008555	ATTT	2	8	76681	76688	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008555	ATTT	2	8	79104	79111	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008555	TTAA	2	8	79412	79419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008555	TTAT	2	8	79485	79492	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008555	AACA	2	8	79647	79654	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_008555	ATAA	2	8	79748	79755	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008555	ATTA	2	8	79774	79781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008555	TAAG	2	8	79893	79900	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008555	TAAT	2	8	80029	80036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008555	AATT	2	8	80064	80071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008555	AAAT	2	8	87280	87287	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008555	AAAT	2	8	87460	87467	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008555	TGTC	2	8	90764	90771	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_008555	CATA	2	8	90787	90794	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_008555	CTTT	2	8	95371	95378	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_008555	GAAT	2	8	95412	95419	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008555	ATAA	2	8	99491	99498	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008555	TAAA	2	8	100015	100022	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008555	GACT	2	8	100180	100187	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_008555	TTTG	2	8	100485	100492	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008555	AGAA	2	8	105037	105044	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008555	AAAT	2	8	110376	110383	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008555	TTGG	2	8	115858	115865	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008555	ACCA	2	8	115894	115901	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008555	AAAT	2	8	125631	125638	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008555	TCCT	2	8	131636	131643	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_008555	CTTT	2	8	135068	135075	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_008555	TTTA	2	8	135099	135106	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008555	AACT	2	8	140787	140794	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_008555	AAAC	2	8	143562	143569	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_008555	TGAA	2	8	151517	151524	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008555	TAAT	2	8	151544	151551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008555	CTTT	2	8	161790	161797	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_008555	TCAC	2	8	161841	161848	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008555	TAAA	2	8	162629	162636	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008555	TATT	2	8	164758	164765	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008555	CAAA	2	8	164970	164977	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_008555	TTGC	2	8	165132	165139	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_008555	AATA	2	8	166197	166204	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008555	CAAA	2	8	166230	166237	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_008555	TCAT	2	8	166326	166333	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_008555	ATTT	2	8	172791	172798	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008555	TCTT	2	8	174145	174152	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_008555	GAAT	2	8	174183	174190	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008555	GGGA	2	8	179893	179900	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008555	GAAG	2	8	180965	180972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008555	ATTA	2	8	182931	182938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008555	AATA	2	8	183087	183094	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008555	AATT	2	8	187213	187220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008555	AAAT	2	8	188234	188241	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008555	CAAT	2	8	193443	193450	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_008555	GAAA	2	8	193690	193697	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008555	AAAC	2	8	193799	193806	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_008555	CGAA	2	8	193953	193960	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_008555	CCTG	2	8	194020	194027	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_008555	ATGG	2	8	195136	195143	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008555	AGCC	2	8	195354	195361	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_008555	TGTT	2	8	195478	195485	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008555	TGTT	2	8	195515	195522	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008555	AGAA	2	8	195907	195914	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008555	AAAG	2	8	196010	196017	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008555	TACT	2	8	196449	196456	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_008555	CACG	2	8	196470	196477	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_008555	AGTG	2	8	197209	197216	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008555	GGAA	2	8	197263	197270	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008555	TAGG	2	8	197837	197844	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008555	ATGG	2	8	198020	198027	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008555	ATCG	2	8	198598	198605	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_008555	GAAA	2	8	199713	199720	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008555	AAAC	2	8	199822	199829	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_008555	CGAA	2	8	199976	199983	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_008555	CCTG	2	8	200043	200050	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_008555	ATGG	2	8	201159	201166	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008555	AGCC	2	8	201377	201384	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_008555	TGTT	2	8	201501	201508	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008555	TGTT	2	8	201538	201545	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008555	AGAA	2	8	201930	201937	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008555	AAAG	2	8	202033	202040	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008555	TACT	2	8	202472	202479	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_008555	CACG	2	8	202493	202500	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_008555	AGTG	2	8	203232	203239	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008555	GGAA	2	8	203286	203293	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008555	TAGG	2	8	203860	203867	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008555	ATGG	2	8	204043	204050	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008555	ATCG	2	8	204621	204628	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_008555	ATAA	2	8	204881	204888	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008555	CCTT	2	8	209487	209494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_008555	AAAT	2	8	211008	211015	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008555	ACAA	2	8	222914	222921	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_008555	TTTA	2	8	223368	223375	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008555	AGTT	3	12	223482	223493	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008555	ATAA	2	8	225015	225022	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008555	AAGG	2	8	226331	226338	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008555	CGTT	2	8	227124	227131	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_008555	TCTT	2	8	227150	227157	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_008555	GTTT	2	8	236355	236362	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008555	CTTT	2	8	236612	236619	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_008555	AATT	2	8	236855	236862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008555	ATGA	2	8	246539	246546	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008555	ATGA	2	8	250961	250968	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008555	AGAA	2	8	250972	250979	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008555	ATTC	2	8	256329	256336	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_008555	TCTA	2	8	256394	256401	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_008555	AAAT	2	8	256567	256574	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008555	GTTA	2	8	257824	257831	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008555	AATG	2	8	257876	257883	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008555	CTAT	2	8	267130	267137	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_008555	TGAT	2	8	267162	267169	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008555	AAAG	2	8	270350	270357	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008555	CTTT	2	8	272160	272167	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_008555	TTCG	2	8	273366	273373	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_008555	AATT	2	8	273543	273550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008555	TAAA	2	8	280760	280767	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008555	GTTA	2	8	280840	280847	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008555	TAAA	2	8	282301	282308	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008555	TAAA	2	8	283159	283166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008555	GAAG	2	8	288288	288295	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008555	ATTT	2	8	290025	290032	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008555	ATTA	2	8	290511	290518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008555	GAAA	2	8	290573	290580	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008555	TAAA	2	8	292995	293002	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008555	GAGG	2	8	301605	301612	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008555	AATT	2	8	301644	301651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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