MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293 chromosome

Total Repeats: 285

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008531	TCATT	2	10	75	84	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_008531	AAACA	2	10	2869	2878	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_008531	AGCGA	2	10	22356	22365	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_008531	TACCA	2	10	23157	23166	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_008531	TCGTG	2	10	23743	23752	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_008531	GTTAA	2	10	24592	24601	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008531	CTAGT	2	10	26750	26759	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_008531	GAGAT	2	10	27381	27390	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008531	GTGTC	2	10	27604	27613	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_008531	TAAAA	2	10	31737	31746	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008531	GACAA	2	10	41941	41950	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_008531	TTCTC	2	10	47028	47037	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_008531	AGTAT	2	10	55165	55174	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008531	TAACT	2	10	59083	59092	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_008531	CTAAA	2	10	67335	67344	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_008531	AAAAG	2	10	67381	67390	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008531	ATGGG	2	10	70147	70156	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008531	TTTAT	2	10	73768	73777	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008531	AATAA	2	10	78818	78827	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008531	AAATA	2	10	89843	89852	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008531	AAAGA	2	10	89938	89947	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008531	AAAGA	2	10	90434	90443	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008531	AGAAT	2	10	107865	107874	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008531	ATTAA	2	10	111650	111659	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008531	ATCAA	2	10	114790	114799	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_008531	CTTTT	2	10	144009	144018	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_008531	AGCGA	2	10	148091	148100	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_008531	TACCA	2	10	148892	148901	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_008531	TCGTG	2	10	149478	149487	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_008531	GTTAA	2	10	150327	150336	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008531	CTAGT	2	10	152485	152494	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_008531	GAGAT	2	10	153116	153125	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008531	GTGTC	2	10	153339	153348	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_008531	TATAA	2	10	160383	160392	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008531	TCTGT	2	10	163689	163698	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_008531	TTAAA	2	10	172264	172273	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008531	CTTGC	2	10	172285	172294	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_008531	CTTTT	2	10	194080	194089	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_008531	GTGAT	2	10	196473	196482	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008531	AATCT	2	10	197548	197557	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_008531	ATAGA	2	10	197598	197607	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008531	ATATA	2	10	198861	198870	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008531	GGGAA	2	10	213035	213044	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008531	ATTCA	2	10	213207	213216	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_008531	ATGAA	2	10	215927	215936	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008531	TTTAA	2	10	219283	219292	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008531	ATTGA	2	10	221623	221632	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008531	ATATA	2	10	231004	231013	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008531	CAGGA	2	10	231046	231055	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_008531	TATAA	2	10	241666	241675	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008531	AAATT	2	10	241683	241692	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008531	TTATA	2	10	247142	247151	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008531	CATCA	2	10	247264	247273	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_008531	TTCTC	2	10	247361	247370	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_008531	ATTTG	2	10	257518	257527	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008531	ACATA	2	10	265037	265046	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_008531	TGGTA	2	10	283002	283011	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008531	AATCG	2	10	299763	299772	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_008531	TTAAG	2	10	319914	319923	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008531	ACATG	2	10	327982	327991	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_008531	CTAAT	2	10	355784	355793	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_008531	ATTAA	2	10	364861	364870	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008531	GCAAA	2	10	367760	367769	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_008531	TAAAA	2	10	370474	370483	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008531	TATAA	2	10	370649	370658	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008531	AATAG	2	10	374978	374987	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008531	ATAAA	2	10	401872	401881	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008531	CTATT	2	10	402103	402112	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_008531	TAGTT	2	10	411672	411681	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008531	TGAGA	2	10	429486	429495	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008531	ATTGT	2	10	430942	430951	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008531	AAAAC	2	10	439435	439444	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_008531	TTATA	2	10	475927	475936	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008531	TATTT	2	10	481248	481257	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008531	ATTGA	2	10	500327	500336	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008531	TAAGT	2	10	544131	544140	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008531	CATAA	2	10	557134	557143	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_008531	TATAA	2	10	564095	564104	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008531	AAGTC	2	10	572964	572973	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_008531	TTTCA	2	10	578038	578047	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_008531	CTAAA	2	10	584563	584572	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_008531	AATTT	2	10	586600	586609	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008531	TATGA	2	10	589743	589752	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008531	CTATT	2	10	591164	591173	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_008531	CAAAA	2	10	608014	608023	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_008531	TATTT	2	10	611024	611033	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008531	GCATT	2	10	611188	611197	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_008531	CTTTT	2	10	611220	611229	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_008531	TTTTG	2	10	611366	611375	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008531	AAGTC	2	10	611828	611837	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_008531	AATAA	2	10	616813	616822	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008531	TAAAT	2	10	617010	617019	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008531	TAAAA	2	10	617491	617500	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008531	AAATT	2	10	626589	626598	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008531	ATAAA	2	10	626663	626672	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008531	TATAA	2	10	669930	669939	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008531	CAGTG	2	10	678833	678842	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_008531	ATTGA	2	10	688196	688205	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008531	TAAAA	2	10	719154	719163	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008531	AATCA	2	10	723809	723818	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_008531	ATTGT	2	10	737067	737076	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008531	GAAAG	2	10	737099	737108	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008531	TAAAA	2	10	738657	738666	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008531	TGATT	2	10	753748	753757	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008531	ATTAA	2	10	753839	753848	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008531	ATAAA	2	10	784832	784841	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008531	GATAT	2	10	793607	793616	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008531	GGAAA	2	10	797678	797687	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008531	TATCA	2	10	799136	799145	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_008531	AATTA	2	10	805542	805551	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008531	CAGTA	2	10	817242	817251	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_008531	ATTTA	2	10	817311	817320	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008531	AATTC	2	10	819209	819218	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_008531	AGAGA	2	10	857048	857057	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008531	CATTG	2	10	881567	881576	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_008531	ATTTT	2	10	909547	909556	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008531	ATTTT	2	10	909594	909603	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008531	GTTGT	2	10	914732	914741	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008531	ATATA	2	10	914806	914815	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008531	AACAA	2	10	945948	945957	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_008531	TTTTA	2	10	947008	947017	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008531	AACTA	2	10	966878	966887	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_008531	AACTA	2	10	968436	968445	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_008531	TTTTG	2	10	974128	974137	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008531	ATCAT	2	10	981746	981755	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_008531	TCAAC	2	10	990384	990393	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_008531	TACTC	2	10	990455	990464	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
128	NC_008531	GTTTG	2	10	991293	991302	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008531	ATTCA	2	10	1001428	1001437	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_008531	AATTA	2	10	1001544	1001553	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008531	TTTTG	2	10	1002427	1002436	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008531	GCGTG	2	10	1008144	1008153	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
133	NC_008531	GGCTG	2	10	1012139	1012148	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
134	NC_008531	GATGA	2	10	1013562	1013571	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008531	TAAAG	2	10	1021930	1021939	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008531	TTATT	2	10	1022139	1022148	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008531	CGATG	2	10	1022457	1022466	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_008531	ATATA	2	10	1024328	1024337	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008531	CTTTT	2	10	1024852	1024861	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_008531	AAATT	2	10	1025339	1025348	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008531	GCCCT	2	10	1044504	1044513	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
142	NC_008531	AGCGT	2	10	1044514	1044523	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_008531	GAAAG	2	10	1044758	1044767	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008531	TTTCC	2	10	1056964	1056973	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_008531	TTGAT	2	10	1081856	1081865	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008531	TTTAA	2	10	1082230	1082239	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008531	TAATT	2	10	1082445	1082454	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.