MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus gasseri ATCC 33323 chromosome

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008530	AATAGC	2	12	21460	21471	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_008530	TTTAAA	2	12	25018	25029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008530	TCTTTT	2	12	109274	109285	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_008530	CTTTTT	2	12	111918	111929	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_008530	AGTAAT	2	12	119851	119862	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008530	TATATC	2	12	187390	187401	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_008530	AAGCAA	2	12	190080	190091	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_008530	TGTAAT	2	12	223699	223710	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008530	TATAAA	2	12	230057	230068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008530	TTCAGG	2	12	235851	235862	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_008530	TAGATA	2	12	274942	274953	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008530	AGCTAA	2	12	276651	276662	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_008530	TGTAAG	2	12	318768	318779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008530	AGTATC	2	12	374446	374457	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_008530	ATAGAA	2	12	408616	408627	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008530	ATATTA	2	12	419714	419725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008530	TTTTAA	2	12	434976	434987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008530	TAAGGA	2	12	442127	442138	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008530	AATTGA	2	12	458171	458182	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008530	CGGAGC	2	12	480014	480025	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008530	AAAATA	2	12	497465	497476	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008530	CATTAT	2	12	510809	510820	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_008530	AAGAAA	2	12	540880	540891	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008530	TTGCGA	2	12	550533	550544	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_008530	AAGCTA	2	12	550854	550865	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_008530	TTAAAT	2	12	551020	551031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008530	ATTTAA	2	12	557380	557391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008530	AAAAGA	2	12	584647	584658	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008530	GTATTT	2	12	817003	817014	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008530	TCTAGT	2	12	820375	820386	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_008530	GTAAAC	2	12	820420	820431	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_008530	TTTTAA	2	12	923124	923135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008530	TTAAAT	2	12	949239	949250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008530	TTCTTT	2	12	951956	951967	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_008530	GCAATT	2	12	955908	955919	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_008530	AATTGC	2	12	966041	966052	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_008530	GAGAAA	2	12	968165	968176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008530	TTAATA	2	12	971058	971069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008530	GCAATT	2	12	973659	973670	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_008530	TATCGG	2	12	983893	983904	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_008530	TAAAAT	2	12	1010240	1010251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008530	TAAAAA	2	12	1139677	1139688	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008530	ATAATT	2	12	1212041	1212052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008530	TTACTT	2	12	1229813	1229824	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_008530	ATTTCA	2	12	1243524	1243535	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_008530	TAAAAA	2	12	1247916	1247927	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008530	CAAAAT	2	12	1251259	1251270	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_008530	ATTACC	2	12	1260919	1260930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008530	AATAAA	2	12	1307353	1307364	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008530	TCAAAG	2	12	1326086	1326097	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_008530	AAATGT	2	12	1358769	1358780	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008530	GCTTAT	2	12	1366816	1366827	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_008530	CATAAC	2	12	1377223	1377234	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008530	TACCTA	2	12	1386067	1386078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008530	AAAATT	2	12	1401030	1401041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008530	AAAGAA	2	12	1428424	1428435	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008530	TTTTAT	2	12	1445315	1445326	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008530	GGGCCT	2	12	1470080	1470091	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008530	AATTTA	2	12	1488002	1488013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008530	TCAATT	2	12	1537417	1537428	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_008530	GCTCCG	2	12	1558276	1558287	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_008530	CCCTTT	2	12	1561291	1561302	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008530	ATGATA	2	12	1562088	1562099	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008530	GCTCCG	2	12	1564946	1564957	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008530	ATTTTT	2	12	1575014	1575025	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008530	ATCTAA	2	12	1575033	1575044	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_008530	CCCTTT	2	12	1575465	1575476	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008530	ATGATA	2	12	1576262	1576273	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008530	GCTCCG	2	12	1579120	1579131	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70	NC_008530	AAAAAG	2	12	1595228	1595239	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008530	TTTTAT	2	12	1598806	1598817	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008530	AAGAAA	2	12	1608123	1608134	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008530	AGTTAA	2	12	1639469	1639480	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008530	CAGTTT	2	12	1653645	1653656	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_008530	AGCTGC	2	12	1653676	1653687	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_008530	GTTCTA	2	12	1658608	1658619	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_008530	TTGCAA	2	12	1665675	1665686	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_008530	TTTAAC	2	12	1668369	1668380	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_008530	CAATTG	2	12	1668574	1668585	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_008530	GCTTTT	2	12	1699335	1699346	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_008530	TAATAT	2	12	1718008	1718019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008530	ATTTTA	2	12	1736541	1736552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008530	TTTCAT	2	12	1756804	1756815	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_008530	GCTCCG	2	12	1785576	1785587	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
85	NC_008530	GCTCCG	2	12	1791091	1791102	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
86	NC_008530	AATTAA	2	12	1795659	1795670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008530	ATATCT	2	12	1815060	1815071	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_008530	TACCAT	2	12	1817998	1818009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008530	ACTAAT	2	12	1818309	1818320	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_008530	TTTTTA	2	12	1881181	1881192	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.