MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus ATCC BAA-365 chromosome

Total Repeats: 159

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008529	TCTTTT	2	12	10251	10262	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_008529	AGATTT	2	12	20763	20774	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008529	GCAGAA	2	12	21120	21131	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_008529	TCTTGC	2	12	21513	21524	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008529	TGAAAA	2	12	34665	34676	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008529	TGGCAA	2	12	48466	48477	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_008529	GGCAGC	2	12	81760	81771	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008529	AAAAGC	2	12	96243	96254	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_008529	ATGAAA	2	12	96485	96496	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008529	AATTTA	2	12	127387	127398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008529	CAAGTA	2	12	131522	131533	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_008529	TTTTGA	2	12	160337	160348	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008529	TGAGCG	2	12	164677	164688	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_008529	AGAAAA	3	18	183662	183679	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008529	TTACTT	2	12	188461	188472	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_008529	CCAAGA	2	12	189879	189890	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008529	TTTGGA	2	12	218174	218185	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008529	CCAACA	2	12	222256	222267	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_008529	GTCAGC	2	12	222591	222602	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008529	GTCAGC	2	12	226289	226300	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008529	GATCTT	2	12	237552	237563	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_008529	ACCAGG	2	12	261320	261331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008529	AAAATC	2	12	262000	262011	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_008529	TCCAGA	2	12	262025	262036	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008529	ATAACA	2	12	263869	263880	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_008529	TAAAAA	2	12	268729	268740	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008529	AGCATC	2	12	359231	359242	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008529	TTTATA	2	12	359306	359317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008529	AAAATG	2	12	360129	360140	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008529	GCAAGA	2	12	361350	361361	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_008529	GACCGG	2	12	368785	368796	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008529	CGCGGC	2	12	369295	369306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008529	GGGGAC	2	12	369738	369749	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_008529	GACCAG	2	12	370582	370593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008529	CTCTTG	2	12	381574	381585	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_008529	CTTGAC	2	12	411077	411088	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008529	ATAACA	2	12	423114	423125	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_008529	GCCGGG	2	12	429087	429098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008529	GAAAAA	2	12	459916	459927	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008529	CATGTC	2	12	477636	477647	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008529	TTGTCG	2	12	478096	478107	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_008529	TGGGCC	2	12	508327	508338	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008529	GACCTG	2	12	509190	509201	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008529	AAAAGC	2	12	524361	524372	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_008529	AGCTTT	2	12	526114	526125	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_008529	TATCAA	2	12	531964	531975	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_008529	ATGGGG	2	12	532328	532339	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008529	AAGTAA	2	12	542726	542737	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008529	AGAAAA	2	12	544350	544361	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008529	AATTAA	2	12	599136	599147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008529	AAAAAT	2	12	619152	619163	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008529	TCTTTT	2	12	653681	653692	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_008529	AAAAGA	2	12	657763	657774	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008529	TCATGC	2	12	658627	658638	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008529	TTAAAA	2	12	658647	658658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008529	TAAGAA	2	12	667829	667840	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008529	TTCCTT	2	12	668108	668119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008529	ACCTTG	2	12	681756	681767	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008529	TGGCAA	2	12	688265	688276	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_008529	CGATGG	2	12	715372	715383	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_008529	GCTCTT	2	12	740587	740598	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008529	AGAGGA	2	12	744982	744993	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008529	ATGTGC	2	12	746489	746500	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_008529	CTGGAA	2	12	756738	756749	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_008529	CTGGAA	2	12	756751	756762	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_008529	GCAATT	2	12	788096	788107	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_008529	TGGCAA	2	12	797485	797496	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_008529	CAAGAA	2	12	803081	803092	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_008529	ATGACG	2	12	818325	818336	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_008529	CCTTTT	2	12	881050	881061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008529	TCATGG	2	12	881292	881303	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_008529	AATTTT	2	12	882793	882804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008529	TCTTTT	2	12	895080	895091	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_008529	GATCCA	2	12	903019	903030	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008529	AACAGT	2	12	904215	904226	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_008529	AAAGGT	2	12	904601	904612	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008529	GCCTTT	2	12	906680	906691	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008529	GAACTG	2	12	915244	915255	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_008529	TCCCCC	2	12	936085	936096	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
80	NC_008529	CCAGTT	2	12	944162	944173	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008529	AGAAAA	2	12	948855	948866	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008529	AAAGGC	2	12	952727	952738	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_008529	GAAAAG	2	12	953244	953255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008529	ACCTTT	2	12	954806	954817	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_008529	ACTGTT	2	12	955192	955203	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_008529	TGGATC	2	12	956388	956399	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_008529	TCTATA	2	12	961131	961142	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_008529	AAAAGA	2	12	964327	964338	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008529	AGGGAT	2	12	981160	981171	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008529	AGCTGC	2	12	981235	981246	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008529	TCCCCT	2	12	981654	981665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_008529	GTATTC	2	12	998805	998816	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_008529	ATAAGA	2	12	1012930	1012941	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008529	CGGAAG	2	12	1027404	1027415	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_008529	TTTAAC	2	12	1038682	1038693	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_008529	AAGAAA	2	12	1042226	1042237	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008529	CACCTG	2	12	1042766	1042777	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
98	NC_008529	AAGATC	2	12	1043206	1043217	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_008529	ATTTTG	2	12	1057110	1057121	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008529	CTGCCG	2	12	1066903	1066914	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
101	NC_008529	GCGGTT	2	12	1069740	1069751	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_008529	TTTTTC	2	12	1097953	1097964	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_008529	ATTTTT	2	12	1097970	1097981	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008529	AAAAAG	2	12	1097994	1098005	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008529	GAAAAT	2	12	1111359	1111370	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008529	ACGATA	2	12	1111978	1111989	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_008529	GAGGAC	2	12	1117424	1117435	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_008529	GTCATA	2	12	1117517	1117528	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_008529	GCTATA	2	12	1123844	1123855	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_008529	ATTTTC	2	12	1126740	1126751	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_008529	GTTAAG	2	12	1150859	1150870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008529	GTTCCC	2	12	1194210	1194221	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
113	NC_008529	CATTTT	2	12	1209268	1209279	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_008529	TCTCTT	2	12	1209659	1209670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008529	TTTTCT	2	12	1213750	1213761	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_008529	TTAATC	2	12	1233671	1233682	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_008529	GTCCTT	2	12	1245014	1245025	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_008529	CATCCC	2	12	1321318	1321329	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_008529	TACTTC	2	12	1335230	1335241	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_008529	AGAAAA	2	12	1344592	1344603	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008529	TTCCAG	2	12	1358077	1358088	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008529	TCCATG	2	12	1358879	1358890	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_008529	TGTGAA	2	12	1407965	1407976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008529	TAGACA	2	12	1426027	1426038	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_008529	TCGGAC	2	12	1499457	1499468	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_008529	GCACTT	2	12	1511233	1511244	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_008529	AAAACA	2	12	1518488	1518499	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_008529	TAAGGT	2	12	1521838	1521849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008529	TAGCAT	2	12	1529137	1529148	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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131	NC_008529	CATAAC	2	12	1532640	1532651	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_008529	TTGCAC	2	12	1533135	1533146	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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159	NC_008529	TAACAA	2	12	1839927	1839938	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.