MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 10158

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008526	CGG	2	6	827483	827488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_008526	GA	3	6	827581	827586	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_008526	TAGG	2	8	827699	827706	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_008526	TGG	2	6	827745	827750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_008526	TAC	2	6	827753	827758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_008526	CCT	2	6	827841	827846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3007	NC_008526	GGT	2	6	827977	827982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_008526	CGT	2	6	828172	828177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_008526	GAG	2	6	828221	828226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_008526	GCC	2	6	828280	828285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3011	NC_008526	C	6	6	828348	828353	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3012	NC_008526	GAGAT	2	10	828356	828365	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_008526	GA	3	6	828396	828401	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_008526	TGGAAG	2	12	828419	828430	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_008526	GGC	2	6	828554	828559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_008526	GCA	2	6	828627	828632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_008526	GTG	2	6	828679	828684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_008526	AAG	2	6	828693	828698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_008526	CTT	2	6	828735	828740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_008526	AGT	2	6	828750	828755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_008526	TGG	2	6	828756	828761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_008526	CTGC	2	8	828766	828773	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3023	NC_008526	GGA	2	6	828803	828808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_008526	TCC	2	6	828869	828874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3025	NC_008526	ATT	2	6	828955	828960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_008526	GGC	2	6	828971	828976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_008526	AAT	2	6	829072	829077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_008526	AGT	2	6	829103	829108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_008526	TGG	2	6	829134	829139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_008526	C	7	7	829468	829474	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3031	NC_008526	GGT	2	6	829573	829578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_008526	TGTTAT	2	12	829600	829611	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_008526	TCG	2	6	829636	829641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_008526	GCCT	2	8	829719	829726	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3035	NC_008526	TGT	2	6	829903	829908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_008526	GGT	2	6	829998	830003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_008526	CCT	2	6	830128	830133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3038	NC_008526	CGG	2	6	830181	830186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_008526	TCG	2	6	830351	830356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_008526	GCCT	2	8	830434	830441	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3041	NC_008526	TC	4	8	830482	830489	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3042	NC_008526	GA	3	6	830494	830499	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_008526	TAGTT	2	10	830509	830518	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_008526	CGG	2	6	830572	830577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_008526	GGA	2	6	830602	830607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_008526	CGG	2	6	830627	830632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_008526	TCC	2	6	830676	830681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3048	NC_008526	CTA	2	6	830748	830753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_008526	AC	3	6	830792	830797	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3050	NC_008526	TCG	2	6	831010	831015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_008526	AG	3	6	831056	831061	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_008526	TAT	2	6	831064	831069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_008526	CG	3	6	831106	831111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3054	NC_008526	T	9	9	831188	831196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_008526	CAAA	2	8	831216	831223	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3056	NC_008526	TCC	2	6	831265	831270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3057	NC_008526	AAG	2	6	831289	831294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_008526	GGA	2	6	831298	831303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_008526	TCCAA	2	10	831334	831343	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3060	NC_008526	GCC	2	6	831362	831367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3061	NC_008526	GTG	2	6	831371	831376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_008526	TAAAC	2	10	831400	831409	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3063	NC_008526	ATT	2	6	831458	831463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_008526	GAAA	2	8	831843	831850	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_008526	CTTT	2	8	831877	831884	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3066	NC_008526	T	6	6	831906	831911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_008526	A	6	6	833569	833574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_008526	AC	3	6	833636	833641	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3069	NC_008526	A	7	7	833643	833649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_008526	CTT	2	6	833659	833664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_008526	T	6	6	833697	833702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_008526	TGC	2	6	833732	833737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_008526	TCC	3	9	834301	834309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3074	NC_008526	T	6	6	834381	834386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_008526	ACA	2	6	834435	834440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_008526	T	7	7	834452	834458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_008526	T	7	7	834464	834470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_008526	TGG	2	6	834530	834535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_008526	GGT	2	6	834539	834544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_008526	TTA	2	6	834556	834561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_008526	A	6	6	834589	834594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_008526	TGA	2	6	834595	834600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_008526	A	7	7	834649	834655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_008526	AAT	2	6	834710	834715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_008526	T	6	6	834760	834765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_008526	TTC	2	6	834784	834789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_008526	ATA	2	6	834801	834806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_008526	AGTT	2	8	834822	834829	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_008526	GGCT	2	8	834860	834867	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3090	NC_008526	AGC	3	9	834883	834891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_008526	CGG	2	6	834903	834908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_008526	GGC	2	6	834929	834934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_008526	ATT	2	6	834938	834943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_008526	CAT	2	6	834946	834951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_008526	CTT	2	6	835050	835055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3096	NC_008526	TGC	2	6	835083	835088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_008526	AT	3	6	835114	835119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_008526	CAT	2	6	835122	835127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_008526	T	6	6	835159	835164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_008526	TGG	2	6	835197	835202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_008526	TCA	2	6	835212	835217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_008526	ATT	2	6	835424	835429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_008526	T	6	6	835428	835433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_008526	TCA	2	6	835455	835460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_008526	A	7	7	835488	835494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_008526	AGC	2	6	835591	835596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_008526	CTG	2	6	835649	835654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_008526	TA	3	6	835680	835685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_008526	TTG	2	6	835725	835730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_008526	GGGC	2	8	835739	835746	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3111	NC_008526	CAA	2	6	835765	835770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_008526	TGA	2	6	835798	835803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_008526	TGG	2	6	835830	835835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_008526	ATGGTT	2	12	835853	835864	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_008526	TAGC	2	8	835890	835897	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3116	NC_008526	GGC	2	6	836167	836172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_008526	GCA	2	6	836223	836228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_008526	TGT	2	6	836272	836277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_008526	A	6	6	836406	836411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_008526	ATC	2	6	836434	836439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_008526	T	6	6	836446	836451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_008526	ATG	2	6	836455	836460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_008526	GCC	2	6	836502	836507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3124	NC_008526	GGT	2	6	836508	836513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_008526	TGA	2	6	836563	836568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_008526	TATACT	2	12	836640	836651	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3127	NC_008526	GAG	2	6	838921	838926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_008526	AGGG	2	8	839968	839975	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_008526	ATAA	2	8	840345	840352	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_008526	TGCAA	2	10	841651	841660	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3131	NC_008526	AG	3	6	841677	841682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_008526	GGT	2	6	841809	841814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_008526	AGG	2	6	841827	841832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_008526	AGC	2	6	844460	844465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3136	NC_008526	GCT	2	6	844480	844485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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