MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 10158

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008526	GTG	2	6	264412	264417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_008526	AAG	2	6	264426	264431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_008526	CTT	2	6	264468	264473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_008526	AGT	2	6	264483	264488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_008526	TGG	2	6	264489	264494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_008526	CTGC	2	8	264499	264506	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_008526	T	7	7	264557	264563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_008526	TAAG	2	8	264573	264580	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_008526	AGCA	2	8	264604	264611	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1010	NC_008526	AGG	2	6	265731	265736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_008526	CCG	2	6	266278	266283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1012	NC_008526	AACC	2	8	266607	266614	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_008526	AGG	2	6	266628	266633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_008526	TTG	3	9	266702	266710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_008526	CCGA	2	8	266722	266729	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_008526	T	6	6	266817	266822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_008526	GAG	2	6	268092	268097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_008526	TAG	2	6	271434	271439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_008526	AAC	2	6	271565	271570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_008526	TGT	2	6	271595	271600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_008526	AAG	2	6	271683	271688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_008526	T	6	6	271720	271725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_008526	GCT	2	6	271740	271745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_008526	AGA	2	6	271763	271768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_008526	CAAAA	2	10	271773	271782	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1026	NC_008526	A	6	6	271807	271812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_008526	ATT	2	6	274634	274639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_008526	A	6	6	274651	274656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_008526	CAA	2	6	274683	274688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_008526	ATT	2	6	274746	274751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_008526	ACA	2	6	274821	274826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_008526	TGT	2	6	274861	274866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_008526	CTGG	2	8	274942	274949	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1034	NC_008526	T	7	7	277220	277226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_008526	AGT	2	6	277272	277277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_008526	AAAG	2	8	277289	277296	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_008526	ATG	2	6	277305	277310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_008526	TAT	2	6	278057	278062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_008526	ACCAT	2	10	278245	278254	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1040	NC_008526	TGA	2	6	278273	278278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_008526	TCT	2	6	278304	278309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_008526	AGATA	2	10	278312	278321	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_008526	T	7	7	281032	281038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_008526	A	6	6	281120	281125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_008526	GGA	2	6	281140	281145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_008526	AAATT	2	10	282649	282658	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_008526	T	7	7	282685	282691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_008526	T	7	7	282694	282700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_008526	A	6	6	282712	282717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_008526	ATC	2	6	282771	282776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_008526	ATGG	2	8	282844	282851	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_008526	CAT	2	6	282908	282913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_008526	TTG	2	6	282995	283000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_008526	CTG	2	6	283032	283037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_008526	TAGA	2	8	283055	283062	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_008526	GGC	2	6	283103	283108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_008526	T	6	6	283112	283117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_008526	TGC	2	6	283145	283150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_008526	TCG	2	6	283155	283160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_008526	A	6	6	283172	283177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_008526	ACG	2	6	283186	283191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_008526	A	6	6	283192	283197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_008526	T	6	6	283217	283222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_008526	TC	3	6	283240	283245	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_008526	T	6	6	283278	283283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_008526	G	6	6	283289	283294	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_008526	CAT	2	6	283373	283378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_008526	TCC	2	6	283579	283584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_008526	AAT	2	6	283704	283709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_008526	CTT	2	6	283722	283727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_008526	CAC	2	6	283764	283769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_008526	T	6	6	283981	283986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_008526	TAC	2	6	284000	284005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_008526	CAG	2	6	284031	284036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_008526	ATA	2	6	284237	284242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_008526	GCA	2	6	284266	284271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_008526	CGA	2	6	284334	284339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_008526	A	6	6	284339	284344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_008526	T	6	6	284364	284369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_008526	AAC	2	6	284434	284439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_008526	A	7	7	284467	284473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_008526	TCA	2	6	284474	284479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_008526	CCT	2	6	284674	284679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NC_008526	T	6	6	284762	284767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_008526	AAG	2	6	284819	284824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_008526	TTG	2	6	284828	284833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_008526	AAAG	2	8	286268	286275	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_008526	TTA	2	6	286332	286337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_008526	A	6	6	286373	286378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_008526	C	6	6	290307	290312	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1091	NC_008526	GTTA	2	8	290325	290332	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_008526	ACAT	2	8	290343	290350	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1093	NC_008526	CCGG	2	8	290421	290428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1094	NC_008526	ATA	2	6	290518	290523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_008526	CGG	2	6	290547	290552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_008526	TTTA	2	8	291896	291903	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_008526	A	7	7	291903	291909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_008526	TTGC	2	8	291926	291933	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1099	NC_008526	T	6	6	291944	291949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_008526	TGCT	2	8	291960	291967	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1101	NC_008526	GTG	2	6	291968	291973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_008526	ATG	2	6	291978	291983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_008526	GCT	2	6	292714	292719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_008526	CAA	2	6	292771	292776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_008526	AAT	2	6	292833	292838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_008526	TTGAA	2	10	292882	292891	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_008526	TTG	2	6	292915	292920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_008526	TTG	2	6	292937	292942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_008526	AGG	2	6	292960	292965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_008526	TGA	2	6	294786	294791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1113	NC_008526	AGC	2	6	294973	294978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_008526	ATGA	2	8	295018	295025	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_008526	GAT	2	6	295026	295031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_008526	TCA	2	6	295039	295044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_008526	ATC	2	6	296092	296097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_008526	AAT	2	6	296133	296138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_008526	GTG	2	6	297010	297015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_008526	TC	3	6	297076	297081	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1121	NC_008526	T	6	6	297129	297134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_008526	GGT	2	6	297146	297151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_008526	GAT	2	6	297263	297268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_008526	GAA	2	6	297313	297318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_008526	TTGT	2	8	297341	297348	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_008526	CCA	2	6	297362	297367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1127	NC_008526	T	6	6	297386	297391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_008526	GTCT	2	8	297444	297451	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1129	NC_008526	CGC	2	6	299988	299993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NC_008526	TTG	2	6	299997	300002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_008526	A	6	6	300054	300059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_008526	T	6	6	303652	303657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_008526	T	6	6	303669	303674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_008526	TGT	3	9	303681	303689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_008526	ACT	2	6	303734	303739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1137	NC_008526	AGG	2	6	303797	303802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1264	NC_008526	TAC	2	6	340620	340625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1266	NC_008526	CGT	2	6	340795	340800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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