MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis JB197 chromosome chromosome 2

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008511	CCCTA	2	10	22496	22505	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_008511	ATTTT	2	10	26442	26451	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008511	ATTGG	2	10	26488	26497	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008511	ATACT	2	10	29506	29515	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_008511	GTGTT	2	10	37432	37441	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008511	TGTGA	2	10	37456	37465	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008511	ATGTA	2	10	41953	41962	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008511	ATTTT	2	10	42884	42893	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008511	AATTC	2	10	55625	55634	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_008511	CGGTT	2	10	59141	59150	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_008511	TTGTA	2	10	59935	59944	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008511	AAGAT	2	10	60044	60053	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008511	TTATG	2	10	62189	62198	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008511	GAGTA	2	10	70714	70723	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008511	AAATC	2	10	71035	71044	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_008511	TAATT	2	10	72701	72710	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008511	TTGGA	2	10	73613	73622	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008511	TTTTA	2	10	74474	74483	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008511	ATTTT	2	10	76648	76657	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008511	TTTTG	2	10	78907	78916	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008511	TTTCT	2	10	81084	81093	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_008511	CGGTG	2	10	83407	83416	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_008511	TAACT	2	10	85223	85232	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_008511	ATTGC	2	10	87353	87362	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_008511	GAGCC	2	10	87467	87476	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_008511	AGGAA	2	10	88396	88405	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008511	CATTC	2	10	88715	88724	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_008511	AGAGG	2	10	89633	89642	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008511	TGTCG	2	10	89827	89836	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_008511	GGAAA	2	10	90375	90384	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008511	TAAAT	2	10	90850	90859	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008511	TCATT	2	10	91350	91359	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_008511	CTTTT	2	10	91639	91648	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_008511	CAAAA	2	10	91900	91909	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_008511	CGAGA	2	10	96184	96193	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_008511	TACGA	2	10	106581	106590	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_008511	TTGAA	2	10	106600	106609	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008511	AGAAC	2	10	107610	107619	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_008511	AGCGA	2	10	109108	109117	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_008511	GATGC	2	10	115785	115794	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_008511	GGGGC	2	10	117938	117947	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
42	NC_008511	AGTTG	2	10	120481	120490	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008511	TTTAT	2	10	137957	137966	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008511	TGAAT	2	10	153861	153870	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008511	CATTC	2	10	155796	155805	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_008511	TTTGA	2	10	155830	155839	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008511	CTTTT	2	10	155943	155952	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_008511	ACGGA	2	10	157078	157087	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_008511	GCTCT	2	10	162275	162284	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_008511	AATGA	2	10	165541	165550	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008511	TTTCT	2	10	181708	181717	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_008511	TAAAA	2	10	184339	184348	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008511	TTCTT	2	10	203350	203359	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_008511	GACCA	2	10	205124	205133	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_008511	GAAAA	2	10	219082	219091	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008511	ACAAA	2	10	228377	228386	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_008511	CAAAA	2	10	232834	232843	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_008511	AAAAG	2	10	237387	237396	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008511	GAATT	2	10	239870	239879	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008511	GATTG	2	10	241057	241066	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008511	CGGAA	2	10	247104	247113	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_008511	TCTAT	2	10	249770	249779	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_008511	ATCCT	2	10	256611	256620	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_008511	ATTTT	3	15	261857	261871	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008511	AGTTG	2	10	262454	262463	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008511	TCATA	2	10	267664	267673	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_008511	TCGCT	2	10	267902	267911	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_008511	TTTGT	2	10	279424	279433	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008511	TTTAG	2	10	284092	284101	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008511	TTAAA	2	10	284352	284361	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008511	TTAAA	2	10	289192	289201	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008511	TAAGA	2	10	294212	294221	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.