MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis str. JB197 chromosome 1

Total Repeats: 9369

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008510	ACA	2	6	1992	1997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008510	GGA	2	6	4244	4249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008510	ATT	2	6	5918	5923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008510	TTA	2	6	6206	6211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008510	AAT	2	6	6223	6228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008510	GTT	2	6	6239	6244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008510	GAA	2	6	6312	6317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008510	CAA	2	6	6327	6332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008510	GAT	2	6	6388	6393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008510	TAA	2	6	6427	6432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008510	ATA	2	6	6480	6485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008510	TAC	2	6	6616	6621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008510	TAA	3	9	6635	6643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008510	TAA	2	6	6657	6662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008510	TGA	2	6	9364	9369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008510	ATT	2	6	14829	14834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008510	TCT	2	6	14846	14851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008510	ATT	2	6	14907	14912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008510	GAA	2	6	14956	14961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008510	GAA	2	6	15069	15074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008510	GAT	2	6	15228	15233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008510	CGA	2	6	15247	15252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008510	CTT	2	6	15426	15431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008510	GAA	2	6	15498	15503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008510	GGC	2	6	15545	15550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008510	CTA	2	6	16281	16286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008510	GAA	2	6	19948	19953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008510	GAA	2	6	20293	20298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008510	AAT	2	6	20425	20430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008510	CGA	2	6	20456	20461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008510	CAA	2	6	20579	20584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008510	TCC	2	6	20589	20594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_008510	TCT	2	6	20606	20611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008510	ATT	2	6	20624	20629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008510	CGA	3	9	21981	21989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_008510	AAG	2	6	24315	24320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008510	CTT	2	6	25482	25487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008510	ACT	2	6	25523	25528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008510	CCT	2	6	25678	25683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_008510	GGA	2	6	25727	25732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008510	TAT	2	6	25780	25785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008510	AAG	2	6	25797	25802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008510	CTT	2	6	25862	25867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008510	TTC	2	6	26059	26064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008510	AGA	2	6	26102	26107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008510	ATC	2	6	26115	26120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008510	AAT	2	6	26131	26136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008510	AAG	2	6	26833	26838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008510	CAG	2	6	26979	26984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008510	TTG	2	6	27268	27273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008510	ACG	2	6	27515	27520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008510	ACC	2	6	27574	27579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_008510	CAA	2	6	27589	27594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008510	AAG	2	6	27747	27752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008510	TCC	2	6	27757	27762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_008510	TAA	2	6	28066	28071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008510	AAC	2	6	28402	28407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008510	TCA	2	6	28441	28446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008510	TTG	2	6	28478	28483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008510	ATT	2	6	28696	28701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008510	TGA	2	6	28752	28757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008510	TTA	2	6	28763	28768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008510	AAC	2	6	28844	28849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008510	ATT	2	6	28875	28880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008510	AAG	2	6	28899	28904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008510	GAG	2	6	28992	28997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008510	CTC	2	6	29328	29333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_008510	TGA	2	6	29337	29342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008510	GGC	2	6	29380	29385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008510	AAT	2	6	29425	29430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008510	AGA	2	6	29443	29448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008510	AGG	2	6	29459	29464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008510	TTG	2	6	29470	29475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008510	TCG	2	6	29593	29598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008510	ATT	2	6	29624	29629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008510	TAT	2	6	29787	29792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008510	TAA	2	6	30065	30070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008510	TTA	2	6	34151	34156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008510	TAA	2	6	34425	34430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008510	TAC	2	6	34472	34477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008510	AAT	2	6	34546	34551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008510	GAA	2	6	34618	34623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008510	TTG	2	6	34740	34745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008510	ATT	2	6	34804	34809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008510	TTC	2	6	34960	34965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_008510	AAT	2	6	35036	35041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008510	CAT	2	6	35235	35240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008510	TAT	2	6	35273	35278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008510	TAC	3	9	35335	35343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008510	TCA	2	6	35345	35350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008510	TAA	2	6	35469	35474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008510	CTT	2	6	35500	35505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_008510	ATC	2	6	35594	35599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008510	GAA	2	6	35647	35652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008510	GAA	2	6	35665	35670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008510	GCA	2	6	35935	35940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008510	ATA	2	6	36003	36008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008510	TTC	2	6	36275	36280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008510	TTA	2	6	36817	36822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008510	TAA	2	6	36823	36828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008510	TAC	2	6	36872	36877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008510	TTG	2	6	36967	36972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008510	AAG	2	6	37293	37298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008510	GAA	2	6	37385	37390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008510	CCT	2	6	37451	37456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_008510	TCA	2	6	37470	37475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_008510	ACG	2	6	37485	37490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_008510	CGG	2	6	37558	37563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_008510	ATA	2	6	37827	37832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008510	GTC	2	6	40247	40252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008510	TAA	2	6	40280	40285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008510	TAC	2	6	40550	40555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_008510	TCG	2	6	40579	40584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008510	TCC	2	6	40597	40602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_008510	GGA	2	6	40634	40639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008510	TGG	2	6	40768	40773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008510	TCT	2	6	41095	41100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_008510	CTT	3	9	41226	41234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_008510	AGA	2	6	41401	41406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008510	ATG	2	6	41454	41459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008510	GTA	2	6	41697	41702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008510	TAA	2	6	41844	41849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008510	TCT	2	6	41997	42002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008510	GAG	2	6	42074	42079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008510	CGG	2	6	42092	42097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_008510	ACG	2	6	42357	42362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_008510	ACG	2	6	42379	42384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008510	TTC	2	6	42442	42447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_008510	GAA	2	6	45441	45446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008510	TAA	2	6	45616	45621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008510	ACT	2	6	45965	45970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_008510	ACT	2	6	46099	46104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_008510	ATA	2	6	47860	47865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008510	GTA	2	6	47898	47903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008510	TTA	2	6	49806	49811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008510	AAC	2	6	49823	49828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_008510	AGA	2	6	56076	56081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008510	ACC	2	6	57032	57037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_008510	CAT	2	6	57068	57073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_008510	GGA	2	6	58482	58487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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