MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis L550 chromosome chromosome 2

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008509	CCCTA	2	10	22496	22505	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_008509	ATTTT	2	10	26442	26451	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008509	ATTGG	2	10	26488	26497	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008509	ATACT	2	10	29506	29515	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_008509	GTGTT	2	10	37432	37441	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008509	TGTGA	2	10	37456	37465	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008509	ATGTA	2	10	41953	41962	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008509	ATTTT	2	10	42884	42893	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008509	AATTC	2	10	55624	55633	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_008509	TCGAA	2	10	58319	58328	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_008509	GAAAG	2	10	58462	58471	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008509	GTTTT	2	10	58914	58923	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008509	CGGTT	2	10	59140	59149	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_008509	TTGTA	2	10	59934	59943	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008509	AAGAT	2	10	60043	60052	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008509	TTATG	2	10	62188	62197	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008509	GAGTA	2	10	70712	70721	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008509	AAATC	2	10	71033	71042	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_008509	TAATT	2	10	72699	72708	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008509	TTGGA	2	10	73611	73620	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008509	TTTTA	2	10	74472	74481	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008509	ATTTT	2	10	76646	76655	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008509	TTTTG	2	10	78640	78649	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008509	ATTTC	2	10	80541	80550	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_008509	TCTTT	2	10	80754	80763	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_008509	TTATA	2	10	84146	84155	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008509	AAAAC	2	10	84780	84789	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_008509	AAAGC	2	10	87975	87984	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_008509	TTTGA	2	10	90249	90258	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008509	CTTTT	2	10	90362	90371	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_008509	GATCT	2	10	90737	90746	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_008509	AGGGT	2	10	97127	97136	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008509	TATGA	2	10	97521	97530	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008509	CAACA	2	10	99005	99014	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_008509	TTTCT	2	10	99400	99409	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_008509	GGTGC	2	10	101724	101733	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
37	NC_008509	TAACT	2	10	103539	103548	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_008509	ATTGC	2	10	105669	105678	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_008509	GAGCC	2	10	105783	105792	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_008509	AGGAA	2	10	106712	106721	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008509	CATTC	2	10	107031	107040	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_008509	AGAGG	2	10	107949	107958	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008509	TGTCG	2	10	108143	108152	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_008509	GGAAA	2	10	108691	108700	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008509	TAAAT	2	10	109166	109175	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008509	TCATT	2	10	109666	109675	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_008509	CTTTT	2	10	109955	109964	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_008509	CAAAA	2	10	110216	110225	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_008509	CGAGA	2	10	114500	114509	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_008509	TACGA	2	10	123893	123902	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_008509	TTGAA	2	10	123912	123921	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008509	AGAAC	2	10	124922	124931	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_008509	AGCGA	2	10	126420	126429	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_008509	GATGC	2	10	133098	133107	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_008509	GGGGC	2	10	135263	135272	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
56	NC_008509	AGTTG	2	10	137800	137809	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008509	TTTAT	2	10	155278	155287	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008509	TGAAT	2	10	171182	171191	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008509	ACGGA	2	10	174336	174345	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_008509	GCTCT	2	10	179533	179542	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_008509	AATGA	2	10	182907	182916	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008509	TTTCT	2	10	199074	199083	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_008509	TAAAA	2	10	201705	201714	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008509	TTCTT	2	10	220715	220724	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_008509	GAAAA	2	10	236447	236456	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008509	ACAAA	2	10	245736	245745	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_008509	CAAAA	2	10	250391	250400	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_008509	AAAAG	2	10	254944	254953	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008509	GAATT	2	10	257427	257436	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008509	GATTG	2	10	258614	258623	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008509	TCTAT	2	10	267349	267358	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_008509	AATTC	2	10	271580	271589	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_008509	ATCCT	2	10	274189	274198	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_008509	ATTTT	3	15	279435	279449	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008509	AGTTG	2	10	280032	280041	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008509	TCATA	2	10	285240	285249	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_008509	TCGCT	2	10	285478	285487	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_008509	TTTGT	2	10	296999	297008	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008509	TTTAG	2	10	301667	301676	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008509	TTAAA	2	10	301927	301936	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008509	TTAAA	2	10	306767	306776	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008509	TAAGA	2	10	311787	311796	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.