MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis str. L550 chromosome 1

Total Repeats: 321

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008508	AAATCA	2	12	38090	38101	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_008508	TCGACT	2	12	53543	53554	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008508	GAAAAT	2	12	60785	60796	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008508	TCAAAT	2	12	63111	63122	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_008508	AATATT	2	12	64099	64110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008508	CGATTC	2	12	82030	82041	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008508	GGTTCC	2	12	90354	90365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008508	AAAAGT	2	12	94291	94302	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008508	CGTAGT	2	12	108582	108593	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_008508	ATAAGA	2	12	113657	113668	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008508	AAAGTA	2	12	113826	113837	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008508	ATTTAG	2	12	122043	122054	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008508	AAATTT	2	12	131968	131979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008508	TTTAAA	2	12	144589	144600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008508	ATTTTC	2	12	148660	148671	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_008508	GGAAAT	2	12	158799	158810	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008508	TCTTTG	2	12	159222	159233	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_008508	GACAAA	2	12	163917	163928	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_008508	GCGGCT	2	12	171298	171309	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008508	AACAAA	2	12	196357	196368	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_008508	TAATTT	2	12	210857	210868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008508	GAATCC	2	12	210894	210905	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008508	TGGACG	2	12	215517	215528	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_008508	TTTAAA	2	12	219344	219355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008508	AAGAAA	2	12	224281	224292	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008508	TTAAAA	2	12	252725	252736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008508	GATTCA	2	12	272628	272639	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_008508	TAATAG	2	12	273513	273524	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008508	GAATAG	2	12	301953	301964	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008508	GCCGAA	2	12	317836	317847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008508	TTTTTA	2	12	329593	329604	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008508	ATTTTT	2	12	330374	330385	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008508	ATTTGA	2	12	377944	377955	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008508	AATCGA	2	12	377983	377994	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_008508	AAAATA	2	12	384897	384908	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008508	ATTTTT	2	12	385930	385941	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008508	GAAAAT	2	12	387381	387392	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008508	AGAACG	2	12	387856	387867	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_008508	GTATCA	2	12	389265	389276	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_008508	CGTTTT	2	12	401101	401112	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_008508	TGAAAT	2	12	428855	428866	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008508	ATTTTT	2	12	435553	435564	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008508	TACAAA	2	12	446994	447005	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_008508	CCAAAA	2	12	447581	447592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008508	GAAATT	2	12	473398	473409	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008508	TATTTT	2	12	499238	499249	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008508	TTCATT	2	12	505689	505700	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_008508	TATTTT	2	12	528525	528536	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008508	TTCATT	2	12	534979	534990	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_008508	ATTTTT	2	12	555786	555797	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008508	TTCTTT	2	12	585309	585320	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_008508	TGAATC	2	12	592552	592563	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_008508	GAAAAG	2	12	614221	614232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008508	TTCCAT	2	12	628829	628840	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008508	AAACCT	2	12	654938	654949	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_008508	ATTCGG	2	12	673320	673331	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_008508	TCGATT	2	12	674130	674141	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_008508	TGATTT	2	12	691687	691698	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008508	ATCCCA	2	12	697372	697383	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008508	TTCAAT	2	12	697742	697753	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_008508	ATTTTC	2	12	700390	700401	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_008508	TGGATT	2	12	701582	701593	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008508	TTTCTA	2	12	713245	713256	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_008508	TTTATC	2	12	752378	752389	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_008508	CGGGTT	2	12	765338	765349	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_008508	AAAATT	2	12	766016	766027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008508	GACAGA	2	12	781132	781143	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_008508	AGAATT	2	12	793187	793198	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008508	GGAAAC	2	12	805253	805264	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_008508	TTTACT	2	12	810040	810051	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_008508	ATTCAA	2	12	849885	849896	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_008508	CGTTTT	2	12	850417	850428	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_008508	GTAATT	2	12	881606	881617	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008508	CGATTT	2	12	901580	901591	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_008508	AGGATT	2	12	903824	903835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008508	GAAAAG	2	12	923205	923216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008508	CTTTTA	2	12	950832	950843	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_008508	AAATTT	2	12	972763	972774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008508	TCGAAC	2	12	984092	984103	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_008508	GTTTTC	2	12	986762	986773	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_008508	TTCCGA	2	12	991197	991208	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008508	TTTTTA	2	12	993063	993074	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008508	TCCGCG	2	12	995220	995231	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
84	NC_008508	ATGGAA	2	12	1000606	1000617	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008508	TTCCAT	2	12	1008755	1008766	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_008508	CTAAAA	2	12	1018817	1018828	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_008508	GTTTAT	2	12	1027755	1027766	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008508	ATGGAA	2	12	1028348	1028359	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008508	CGATAT	2	12	1028436	1028447	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_008508	GTTTGA	2	12	1042793	1042804	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008508	AAAATA	2	12	1078580	1078591	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008508	TTGAAA	2	12	1085136	1085147	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008508	AAAATA	2	12	1088048	1088059	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008508	AAAAAC	2	12	1088204	1088215	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_008508	ATGGAA	2	12	1100152	1100163	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008508	TTATCC	2	12	1100449	1100460	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008508	CCATTC	2	12	1105656	1105667	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_008508	ATCGAA	2	12	1106121	1106132	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_008508	CCGAAC	2	12	1107281	1107292	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
100	NC_008508	TTTTCA	2	12	1112928	1112939	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_008508	ATTTCT	2	12	1113569	1113580	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_008508	ATATAA	2	12	1129070	1129081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008508	AATCGG	2	12	1148808	1148819	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_008508	ATTCGA	2	12	1156580	1156591	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_008508	GATTTC	2	12	1175347	1175358	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_008508	TTCAAG	2	12	1183281	1183292	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_008508	AGAGAA	2	12	1198304	1198315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008508	AGCTTT	2	12	1198877	1198888	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_008508	ATGGAA	2	12	1211670	1211681	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008508	AAACGA	2	12	1230040	1230051	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_008508	TTCCTT	2	12	1231724	1231735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_008508	ATCGGA	2	12	1235422	1235433	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_008508	ATAAAG	2	12	1235788	1235799	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008508	CCGCTT	2	12	1236951	1236962	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
115	NC_008508	TTACTT	2	12	1262537	1262548	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_008508	CTTTTT	2	12	1270119	1270130	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_008508	AATTGT	2	12	1270194	1270205	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008508	CGGCCG	2	12	1271402	1271413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_008508	GTTTCC	2	12	1273780	1273791	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_008508	GTGATC	2	12	1285578	1285589	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_008508	GCATTA	2	12	1288711	1288722	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_008508	TTCTTT	2	12	1289683	1289694	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_008508	TCCGGT	2	12	1292782	1292793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008508	AATTTT	2	12	1300231	1300242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008508	AAAATA	2	12	1300499	1300510	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008508	AATCCA	2	12	1306813	1306824	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_008508	CAATCT	2	12	1307159	1307170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008508	TTTCGG	2	12	1318643	1318654	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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131	NC_008508	TTTAAA	2	12	1351199	1351210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008508	TTTGTT	2	12	1358226	1358237	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.