MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis str. L550 chromosome 1

Total Repeats: 2774

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008508	AAAT	2	8	1927	1934	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008508	TAAT	2	8	4011	4018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008508	TCAT	2	8	4113	4120	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_008508	TTGA	2	8	4165	4172	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008508	TAAA	2	8	6458	6465	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008508	ATTT	2	8	6646	6653	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008508	AACG	2	8	14873	14880	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_008508	AGTC	2	8	15047	15054	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_008508	GATT	2	8	25756	25763	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008508	ATAA	2	8	26581	26588	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008508	ACCG	2	8	26615	26622	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008508	AAAT	2	8	26999	27006	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008508	CCCG	2	8	27319	27326	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_008508	ACTG	2	8	27434	27441	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_008508	AGGA	2	8	28728	28735	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008508	GTTC	2	8	29061	29068	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_008508	AAAC	2	8	29120	29127	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_008508	TTTC	2	8	38163	38170	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008508	AATT	2	8	38502	38509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008508	AATG	2	8	42626	42633	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008508	AAAT	2	8	42769	42776	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008508	CGAG	2	8	42806	42813	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_008508	ATGG	2	8	42858	42865	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008508	TACT	2	8	43219	43226	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_008508	AATT	2	8	43372	43379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008508	AAAG	2	8	43595	43602	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008508	AACC	2	8	45248	45255	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008508	TTTA	2	8	48660	48667	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008508	TTCA	2	8	49515	49522	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008508	TTTC	2	8	52344	52351	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_008508	TCCA	2	8	52574	52581	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008508	CGAT	2	8	52599	52606	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_008508	AATC	2	8	53059	53066	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_008508	TTGA	2	8	53688	53695	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008508	CGAA	2	8	53728	53735	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008508	GTTT	2	8	54958	54965	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008508	TCGC	2	8	62439	62446	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_008508	TAAA	2	8	62499	62506	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008508	CTTC	2	8	62682	62689	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008508	TTAC	2	8	62777	62784	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_008508	TTCC	2	8	63008	63015	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_008508	CGAA	2	8	63205	63212	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_008508	TTCA	2	8	63598	63605	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_008508	TTTC	2	8	63614	63621	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_008508	GAAT	2	8	63754	63761	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008508	AAAT	2	8	64166	64173	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008508	AATT	2	8	64291	64298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008508	GTCT	2	8	70202	70209	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_008508	AATT	2	8	71288	71295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008508	TTTC	2	8	71335	71342	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_008508	TTAT	2	8	71400	71407	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008508	TTCC	2	8	80908	80915	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008508	GATC	2	8	81904	81911	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_008508	TAGG	2	8	82092	82099	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008508	CTTT	2	8	82260	82267	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_008508	TTCT	2	8	82452	82459	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_008508	AAAT	2	8	82919	82926	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008508	AATC	2	8	84741	84748	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_008508	GATT	2	8	84785	84792	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008508	TCTT	2	8	89723	89730	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_008508	ATCC	2	8	89736	89743	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_008508	TTTC	2	8	89754	89761	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_008508	AGGA	2	8	89770	89777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008508	GAAA	2	8	89853	89860	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008508	AAGG	2	8	89914	89921	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008508	GAAA	2	8	91688	91695	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008508	ATTT	2	8	92141	92148	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008508	GTAG	2	8	94465	94472	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008508	AAAT	2	8	95710	95717	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008508	ATAA	2	8	96230	96237	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008508	TCGA	2	8	96785	96792	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_008508	AATT	2	8	97862	97869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008508	TTTC	2	8	102256	102263	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_008508	GTTA	2	8	102479	102486	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008508	TATT	2	8	105414	105421	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008508	TTGA	2	8	105466	105473	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008508	TTCT	2	8	105488	105495	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_008508	AAAG	2	8	105774	105781	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008508	CCAA	2	8	106039	106046	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_008508	GAAT	2	8	106056	106063	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008508	GTTT	2	8	106176	106183	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008508	AAAT	2	8	107964	107971	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008508	AATG	2	8	108141	108148	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008508	GTGA	2	8	108313	108320	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008508	GCTT	2	8	113799	113806	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_008508	AGCG	2	8	113973	113980	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_008508	AATC	2	8	114431	114438	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_008508	CAGT	2	8	114770	114777	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_008508	GCGA	2	8	115021	115028	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_008508	CTTT	2	8	115341	115348	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_008508	TTGA	2	8	115381	115388	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008508	GAAA	2	8	115396	115403	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008508	CGTT	2	8	115770	115777	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_008508	AAAT	2	8	116756	116763	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008508	AAAG	2	8	123280	123287	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008508	GAAA	2	8	127110	127117	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008508	AATT	2	8	127833	127840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008508	AAAT	2	8	129677	129684	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008508	AGGG	2	8	131499	131506	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008508	TTTG	2	8	131996	132003	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008508	GAAT	2	8	140721	140728	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008508	AAGA	2	8	140838	140845	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008508	ATCT	2	8	140908	140915	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_008508	AAAC	2	8	141073	141080	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_008508	GAAA	2	8	142173	142180	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008508	AAAT	2	8	142396	142403	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008508	TATC	2	8	142404	142411	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_008508	AATT	2	8	144797	144804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008508	CAAA	2	8	145811	145818	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_008508	TCAC	2	8	145844	145851	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_008508	TCTG	2	8	148697	148704	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_008508	GACG	2	8	149948	149955	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_008508	TTTG	2	8	154244	154251	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008508	ATTT	2	8	154902	154909	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008508	ATCC	2	8	158933	158940	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_008508	TTAC	2	8	159247	159254	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_008508	AAAT	2	8	160921	160928	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008508	TTCC	2	8	160948	160955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_008508	GTAA	2	8	162238	162245	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008508	GATT	2	8	162269	162276	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008508	AAAC	2	8	163509	163516	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_008508	TCAT	2	8	163792	163799	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_008508	AATG	2	8	164979	164986	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008508	CTTT	2	8	166861	166868	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_008508	AATT	2	8	170475	170482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008508	GAAA	2	8	170575	170582	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008508	TTCG	2	8	170722	170729	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_008508	TGAT	2	8	171458	171465	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008508	GGGA	2	8	171567	171574	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008508	TATG	2	8	172399	172406	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008508	TAAA	2	8	172501	172508	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008508	AAAT	2	8	172537	172544	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008508	ATTT	2	8	172714	172721	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008508	TTTC	2	8	175543	175550	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_008508	GAAA	2	8	179258	179265	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008508	CTAT	2	8	179400	179407	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_008508	ATTT	2	8	181553	181560	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008508	GTTT	2	8	181563	181570	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008508	TCTT	2	8	195067	195074	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_008508	ATTC	2	8	195155	195162	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_008508	GATC	2	8	196682	196689	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_008508	GTCC	2	8	207027	207034	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_008508	ATCT	2	8	207514	207521	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_008508	GTTT	2	8	207720	207727	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008508	GAAA	2	8	213510	213517	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008508	CCTT	2	8	213780	213787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_008508	AGAA	2	8	213926	213933	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008508	GGAA	2	8	214338	214345	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008508	ATTC	2	8	214801	214808	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_008508	ATTC	2	8	215300	215307	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_008508	ATCC	2	8	215313	215320	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_008508	ATTT	2	8	215495	215502	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008508	ATTT	2	8	218197	218204	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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