MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis str. L550 chromosome 1

Total Repeats: 18937

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008508	AAAT	2	8	1927	1934	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008508	AGATG	2	10	1945	1954	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008508	ACA	2	6	1992	1997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008508	AT	3	6	2004	2009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008508	AT	3	6	3919	3924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008508	AT	4	8	3937	3944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008508	TAAT	2	8	4011	4018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008508	T	7	7	4041	4047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008508	GA	4	8	4048	4055	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008508	A	6	6	4097	4102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008508	TCAT	2	8	4113	4120	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_008508	TTGA	2	8	4165	4172	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008508	T	7	7	4231	4237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008508	GGA	2	6	4244	4249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008508	A	6	6	5612	5617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008508	ATT	2	6	5918	5923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008508	A	6	6	5974	5979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008508	TTA	2	6	6206	6211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008508	AAT	2	6	6223	6228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008508	GTT	2	6	6239	6244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008508	GAA	2	6	6312	6317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008508	CAA	2	6	6327	6332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008508	TAA	2	6	6427	6432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008508	TAAA	2	8	6458	6465	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008508	ATA	2	6	6480	6485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008508	A	8	8	6554	6561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008508	TAC	2	6	6616	6621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008508	TAA	3	9	6635	6643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008508	ATTT	2	8	6646	6653	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008508	TAA	2	6	6657	6662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008508	A	6	6	6673	6678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008508	TGA	2	6	9364	9369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008508	ATT	2	6	14829	14834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008508	TCT	2	6	14846	14851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008508	AACG	2	8	14873	14880	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008508	ATT	2	6	14907	14912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008508	GAA	2	6	14956	14961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008508	A	7	7	14960	14966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008508	A	6	6	15033	15038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008508	AGTC	2	8	15047	15054	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_008508	GAA	2	6	15069	15074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008508	A	6	6	15114	15119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008508	A	6	6	15185	15190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008508	GAT	2	6	15228	15233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008508	CGA	2	6	15247	15252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008508	CTT	2	6	15426	15431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008508	A	7	7	15452	15458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008508	GAA	2	6	15498	15503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008508	A	7	7	15502	15508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008508	A	6	6	15539	15544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008508	GGC	2	6	15545	15550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008508	A	6	6	15642	15647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008508	CTA	2	6	16281	16286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008508	A	6	6	16291	16296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008508	T	6	6	16327	16332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008508	A	7	7	19940	19946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008508	GAA	2	6	19949	19954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008508	TAAAG	2	10	19960	19969	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008508	TAT	2	6	20242	20247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008508	GAA	2	6	20294	20299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008508	T	6	6	20308	20313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008508	T	8	8	20341	20348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008508	T	6	6	20399	20404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008508	T	6	6	20411	20416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008508	AAT	2	6	20426	20431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008508	CGA	2	6	20457	20462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008508	CAA	2	6	20574	20579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008508	TCC	2	6	20584	20589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_008508	TCT	2	6	20601	20606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008508	ATT	2	6	20619	20624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008508	T	7	7	21757	21763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008508	CGA	3	9	21976	21984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008508	T	6	6	22009	22014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008508	AAG	2	6	24310	24315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008508	CTT	2	6	25477	25482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_008508	ACT	2	6	25518	25523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008508	CT	3	6	25522	25527	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_008508	T	6	6	25615	25620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008508	A	6	6	25650	25655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008508	CCT	2	6	25673	25678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_008508	GGA	2	6	25722	25727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008508	GATT	2	8	25756	25763	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008508	TAT	2	6	25775	25780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008508	AAG	2	6	25792	25797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008508	CTT	2	6	25857	25862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_008508	A	6	6	25964	25969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008508	TTC	2	6	26054	26059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008508	AGA	2	6	26097	26102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008508	ATC	2	6	26110	26115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008508	AAT	2	6	26126	26131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008508	ATAA	2	8	26581	26588	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008508	ACCG	2	8	26615	26622	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_008508	A	6	6	26721	26726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008508	AAG	2	6	26828	26833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008508	CAG	2	6	26974	26979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008508	AAAT	2	8	26999	27006	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008508	TTG	2	6	27263	27268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008508	CCCG	2	8	27319	27326	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
99	NC_008508	ACTG	2	8	27434	27441	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_008508	ACG	2	6	27510	27515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008508	ACC	2	6	27569	27574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_008508	CAA	2	6	27584	27589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_008508	AAG	2	6	27742	27747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008508	TCC	2	6	27752	27757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_008508	TAA	2	6	28061	28066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008508	A	6	6	28075	28080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008508	A	6	6	28132	28137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008508	A	6	6	28139	28144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008508	A	8	8	28148	28155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008508	CAAAA	2	10	28276	28285	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_008508	A	7	7	28282	28288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008508	GAAAA	2	10	28308	28317	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008508	AAC	2	6	28397	28402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008508	TCAAA	2	10	28422	28431	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_008508	TCA	2	6	28436	28441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_008508	A	6	6	28441	28446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008508	AT	3	6	28468	28473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008508	TGT	2	6	28474	28479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008508	ATT	2	6	28691	28696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008508	AGGA	2	8	28728	28735	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008508	TGA	2	6	28748	28753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008508	TTA	2	6	28759	28764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008508	AAC	2	6	28840	28845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008508	ATT	2	6	28871	28876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008508	AAG	2	6	28895	28900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008508	GA	3	6	28958	28963	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008508	GAG	2	6	28988	28993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008508	GTTC	2	8	29061	29068	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_008508	AAAC	2	8	29120	29127	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_008508	TC	3	6	29276	29281	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_008508	CTC	2	6	29325	29330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_008508	TGA	2	6	29334	29339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008508	AG	3	6	29354	29359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008508	GGC	2	6	29377	29382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_008508	AAT	2	6	29422	29427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008508	AGA	2	6	29440	29445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008508	AGG	2	6	29456	29461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008508	TTG	2	6	29467	29472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008508	TCG	2	6	29584	29589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_008508	ATT	2	6	29615	29620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008508	A	6	6	29630	29635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008508	A	6	6	29642	29647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008508	GTA	2	6	29690	29695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008508	AG	3	6	29747	29752	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008508	A	6	6	29825	29830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008508	AC	3	6	29851	29856	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_008508	T	6	6	29986	29991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008508	T	6	6	30088	30093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008508	TTA	2	6	30192	30197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008508	TACTT	2	10	30211	30220	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_008508	AT	3	6	30221	30226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008508	A	8	8	30228	30235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008508	T	10	10	30276	30285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_008508	TA	4	8	30302	30309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_008508	GTT	2	6	30360	30365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_008508	A	6	6	30380	30385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_008508	GGA	2	6	30387	30392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
158	NC_008508	A	7	7	31671	31677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_008508	CGT	2	6	31685	31690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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161	NC_008508	TTTTG	2	10	31710	31719	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
162	NC_008508	AT	3	6	32450	32455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_008508	A	6	6	35975	35980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_008508	TAATA	2	10	36118	36127	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_008508	AGA	2	6	36145	36150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
166	NC_008508	TGA	2	6	36152	36157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
167	NC_008508	A	6	6	36184	36189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_008508	AAAGT	2	10	36208	36217	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
169	NC_008508	A	6	6	38061	38066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_008508	ATTTT	2	10	38072	38081	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_008508	TTTC	2	8	38163	38170	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
174	NC_008508	AG	3	6	38352	38357	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
175	NC_008508	TAATA	2	10	38397	38406	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_008508	TGA	2	6	38431	38436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
177	NC_008508	GTT	2	6	38492	38497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
178	NC_008508	AATT	2	8	38502	38509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_008508	CTG	2	6	38522	38527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_008508	CAA	2	6	38580	38585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_008508	CAA	2	6	38604	38609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
182	NC_008508	CAT	2	6	38637	38642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_008508	AATTT	2	10	38724	38733	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_008508	GAAAA	2	10	40607	40616	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
185	NC_008508	AATG	2	8	42626	42633	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
186	NC_008508	CTT	2	6	42757	42762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
187	NC_008508	AAAT	2	8	42769	42776	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_008508	AAC	2	6	42778	42783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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191	NC_008508	AAG	2	6	42832	42837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_008508	ACG	2	6	42905	42910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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198	NC_008508	TCT	2	6	43327	43332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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259	NC_008508	AAT	2	6	53819	53824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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276	NC_008508	CT	3	6	58491	58496	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
277	NC_008508	A	6	6	60640	60645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_008508	ACT	2	6	60666	60671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_008508	T	7	7	60686	60692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_008508	TTG	2	6	60733	60738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
281	NC_008508	CTT	2	6	60742	60747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_008508	GAAAAT	2	12	60785	60796	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_008508	T	6	6	61007	61012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_008508	T	6	6	61019	61024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_008508	AAT	2	6	61034	61039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_008508	CGA	2	6	61065	61070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_008508	CAA	2	6	61182	61187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_008508	TCC	2	6	61192	61197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
290	NC_008508	TCT	2	6	61209	61214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_008508	ATT	2	6	61227	61232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_008508	TCGC	2	8	62439	62446	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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