MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus brevis ATCC 367 plasmid 2

Total Repeats: 203

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008499	CAC	2	6	9	14	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_008499	ATA	2	6	145	150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008499	CAA	2	6	355	360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008499	GCT	2	6	368	373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008499	ATA	2	6	698	703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008499	TTG	2	6	748	753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008499	AGC	2	6	805	810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008499	CAA	2	6	819	824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008499	AAC	2	6	896	901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008499	CAG	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008499	TGT	2	6	980	985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008499	ACA	2	6	1027	1032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008499	TTA	2	6	3192	3197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008499	GAG	2	6	3301	3306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008499	AAC	2	6	3371	3376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008499	TCA	2	6	3438	3443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008499	AAG	2	6	3586	3591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008499	ACC	2	6	3622	3627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_008499	ATC	2	6	3737	3742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008499	ATT	2	6	3776	3781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008499	TGG	2	6	3879	3884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008499	ACT	2	6	4055	4060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008499	CAA	2	6	4137	4142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008499	AAG	2	6	4187	4192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008499	TAA	2	6	4242	4247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008499	CAA	3	9	4264	4272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008499	CAA	2	6	4294	4299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008499	GAA	2	6	4336	4341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008499	AAC	2	6	4361	4366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008499	AAC	2	6	4400	4405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008499	GTC	2	6	4554	4559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008499	ATT	2	6	4708	4713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008499	TAT	2	6	4783	4788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008499	TGA	2	6	4933	4938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008499	GAA	2	6	4965	4970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008499	TTC	2	6	4989	4994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008499	TGA	2	6	5076	5081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008499	TGC	2	6	5117	5122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008499	TCA	2	6	5130	5135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008499	GAA	2	6	5168	5173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008499	GTT	2	6	5514	5519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008499	GTT	2	6	5524	5529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008499	TGC	2	6	5735	5740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008499	ACG	2	6	5753	5758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008499	CTA	2	6	5987	5992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008499	CCT	2	6	6080	6085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_008499	CTT	2	6	7174	7179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008499	GAT	2	6	7285	7290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008499	ATG	2	6	7317	7322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008499	TCG	2	6	7343	7348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008499	TGT	2	6	7437	7442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008499	AAT	2	6	7555	7560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008499	CTT	2	6	7614	7619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008499	ATT	2	6	7636	7641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008499	AAG	2	6	7678	7683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008499	GTT	2	6	7942	7947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008499	CAA	2	6	8011	8016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008499	ATA	2	6	8899	8904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008499	ATT	3	9	8985	8993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008499	TCA	2	6	10337	10342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008499	CAT	2	6	10368	10373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008499	ATT	2	6	10461	10466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008499	TGA	2	6	10519	10524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008499	TCG	2	6	10528	10533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008499	TCA	2	6	10799	10804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008499	TTA	2	6	10815	10820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008499	TAC	2	6	11030	11035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008499	TCA	2	6	11223	11228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008499	CTT	2	6	11240	11245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008499	GTT	2	6	11284	11289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008499	TCA	2	6	11629	11634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008499	GTA	2	6	11643	11648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008499	GAT	2	6	11726	11731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008499	TTG	2	6	11733	11738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008499	TGA	2	6	11770	11775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008499	TAT	2	6	11849	11854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008499	CTT	2	6	11889	11894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008499	TGA	2	6	11949	11954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008499	GTA	2	6	11957	11962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008499	ATA	2	6	11987	11992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008499	TAA	2	6	12100	12105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008499	CTT	2	6	12211	12216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_008499	TAA	2	6	12316	12321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008499	ACC	2	6	12413	12418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_008499	CAA	2	6	12435	12440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_008499	ATG	2	6	12613	12618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008499	TCT	2	6	12675	12680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008499	TTC	2	6	12804	12809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008499	TGC	2	6	12859	12864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008499	CTG	2	6	12885	12890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008499	GAT	2	6	12915	12920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008499	TTG	2	6	12935	12940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008499	GTG	2	6	13024	13029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008499	ATA	2	6	13120	13125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008499	TGA	2	6	13140	13145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008499	GAC	2	6	13161	13166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008499	TCA	2	6	13185	13190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008499	CTA	2	6	13231	13236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008499	TTG	2	6	13260	13265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008499	CAA	2	6	13305	13310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008499	TTA	2	6	13414	13419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008499	AGG	2	6	13437	13442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008499	TAT	2	6	15040	15045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008499	AAC	2	6	15161	15166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_008499	CCG	3	9	15236	15244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_008499	CGC	2	6	15264	15269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_008499	GTA	2	6	15314	15319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008499	TGG	2	6	15342	15347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008499	CTG	2	6	15352	15357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008499	CTA	2	6	16540	16545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008499	TCC	2	6	17583	17588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_008499	AAC	2	6	18031	18036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_008499	TTC	2	6	18052	18057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008499	ATC	2	6	18094	18099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008499	ATA	2	6	18105	18110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008499	TGC	2	6	18164	18169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_008499	CAA	2	6	18192	18197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_008499	TGG	2	6	18224	18229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008499	AAT	2	6	18304	18309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008499	ACT	2	6	18421	18426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008499	TTC	2	6	18513	18518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008499	GAA	2	6	18527	18532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008499	GCT	2	6	18621	18626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008499	ATA	2	6	18678	18683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008499	ACC	2	6	18746	18751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_008499	TAA	3	9	19273	19281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008499	CAA	2	6	19337	19342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008499	CAA	2	6	19375	19380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_008499	CTT	2	6	19388	19393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_008499	GTG	2	6	19435	19440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008499	GCA	2	6	19604	19609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_008499	AAT	2	6	19629	19634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008499	TTC	2	6	19639	19644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_008499	CGG	2	6	19750	19755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_008499	TTA	2	6	19802	19807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008499	GCT	2	6	19931	19936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_008499	ATT	2	6	20057	20062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008499	GTT	2	6	20063	20068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008499	CTA	2	6	20089	20094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_008499	CTT	2	6	20314	20319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_008499	ATA	2	6	21268	21273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008499	ATT	2	6	21357	21362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.