MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus brevis ATCC 367

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008497	TAAACT	2	12	10254	10265	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_008497	ATAGGT	2	12	40483	40494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008497	TTTTAG	2	12	95984	95995	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008497	ATGAAA	2	12	102257	102268	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008497	GCTAAG	2	12	186497	186508	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_008497	ATAAAA	2	12	214435	214446	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008497	TCAGCT	2	12	317028	317039	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008497	ATACGA	2	12	373292	373303	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_008497	TTAGTG	2	12	385444	385455	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008497	CGGTTA	2	12	426293	426304	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_008497	TTAAAG	2	12	438517	438528	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008497	TAGTCT	2	12	443129	443140	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_008497	TGTTAA	2	12	519475	519486	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008497	AACTTA	2	12	522009	522020	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_008497	AAGCTA	2	12	588064	588075	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_008497	AAGAAA	2	12	593484	593495	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008497	TCCTCA	2	12	600310	600321	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008497	GGTAAG	2	12	600537	600548	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008497	TGAATT	2	12	645442	645453	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008497	TTCTCT	2	12	723950	723961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008497	TTATAG	2	12	738854	738865	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008497	CTAGTA	2	12	820801	820812	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_008497	ATACCA	2	12	855473	855484	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008497	GTTTAA	2	12	868475	868486	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008497	GCCAAG	2	12	906792	906803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008497	GGCAAC	2	12	907053	907064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008497	GGCTTG	2	12	968822	968833	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_008497	AAATAG	2	12	981769	981780	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008497	CATAGT	2	12	993755	993766	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_008497	CCTCGC	2	12	994106	994117	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_008497	ATCGAA	2	12	994136	994147	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_008497	TAGACT	2	12	1005871	1005882	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_008497	ATCGTC	2	12	1019230	1019241	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008497	TTAAAA	2	12	1019410	1019421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008497	CCCCCA	2	12	1062673	1062684	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
36	NC_008497	TATCAA	2	12	1084315	1084326	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_008497	CTTTTA	2	12	1085172	1085183	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_008497	ATAAAA	2	12	1142721	1142732	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008497	TAACCT	2	12	1177010	1177021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008497	TCTTTT	2	12	1239100	1239111	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_008497	TCCCCT	2	12	1283060	1283071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_008497	CAAAAA	2	12	1292169	1292180	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_008497	AAAGCC	2	12	1301628	1301639	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008497	ATAAAA	2	12	1327043	1327054	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008497	CGAAAA	2	12	1359148	1359159	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_008497	GGAAAG	2	12	1359198	1359209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008497	AAAGTG	2	12	1468737	1468748	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008497	GAAAAA	2	12	1589849	1589860	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008497	AAAAGA	2	12	1601904	1601915	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008497	AATCAT	2	12	1613433	1613444	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_008497	TTAAAT	2	12	1620398	1620409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008497	GTTTTT	2	12	1676019	1676030	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008497	CCCAAG	2	12	1690913	1690924	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008497	CAACCA	2	12	1691726	1691737	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008497	AGCCGA	2	12	1725146	1725157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_008497	AAAATT	2	12	1732629	1732640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008497	AAATTA	2	12	1734510	1734521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008497	TCCCGT	2	12	1741972	1741983	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008497	CATCCT	2	12	1794115	1794126	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008497	TTCCTT	2	12	1799669	1799680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008497	TAATTG	2	12	1858679	1858690	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008497	AAAAAT	2	12	1905915	1905926	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008497	GAAAAT	2	12	1910678	1910689	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008497	CAACCA	2	12	1939448	1939459	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008497	GATTCT	2	12	2004335	2004346	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_008497	CCCTCA	2	12	2039407	2039418	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_008497	CCATGG	2	12	2052799	2052810	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008497	CGCGCC	2	12	2057331	2057342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_008497	TTGCAC	2	12	2057778	2057789	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008497	ACACCA	2	12	2066317	2066328	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_008497	ATTATG	2	12	2090360	2090371	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008497	TAAAAA	2	12	2115177	2115188	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008497	ATTTTT	2	12	2128828	2128839	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008497	CGTCTG	2	12	2135902	2135913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008497	AAATGA	2	12	2165946	2165957	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008497	AATCTC	2	12	2170521	2170532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008497	CATTCA	2	12	2177251	2177262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008497	CTGACG	2	12	2212855	2212866	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_008497	CAGGAT	2	12	2232607	2232618	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_008497	ACGGCA	2	12	2273346	2273357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.