MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus brevis ATCC 367

Total Repeats: 272

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008497	TATAA	2	10	3266	3275	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008497	GTGTG	2	10	9548	9557	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008497	AAGCG	2	10	31368	31377	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_008497	TATCA	2	10	31562	31571	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_008497	TAAAA	2	10	61832	61841	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008497	GCCAA	2	10	62045	62054	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_008497	AAAAG	2	10	62075	62084	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008497	TGCGT	2	10	78956	78965	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_008497	CTGAT	2	10	78973	78982	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_008497	GACCG	2	10	84587	84596	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_008497	GATAT	2	10	85863	85872	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008497	ATGAT	2	10	85956	85965	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008497	TCGTG	2	10	87238	87247	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_008497	GCTAA	2	10	87438	87447	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_008497	TTGGT	2	10	92680	92689	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008497	CGGGC	2	10	95897	95906	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
17	NC_008497	TTTAA	2	10	102332	102341	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008497	TTAAA	2	10	104315	104324	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008497	TCACT	2	10	105415	105424	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_008497	TCATT	2	10	116612	116621	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_008497	ACTAA	2	10	116771	116780	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_008497	TCTAT	2	10	163221	163230	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_008497	GATAA	2	10	164324	164333	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008497	CATTA	2	10	174624	174633	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_008497	AAAAG	2	10	178302	178311	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008497	GACTA	2	10	183135	183144	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_008497	AAAAG	2	10	185865	185874	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008497	GCCAG	2	10	187260	187269	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_008497	CGTGG	2	10	195252	195261	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
30	NC_008497	TAGAA	2	10	196347	196356	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008497	TTTTA	2	10	196395	196404	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008497	CAAAA	2	10	210242	210251	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_008497	TAGAA	2	10	216247	216256	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008497	ATTGT	2	10	231625	231634	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008497	ATATA	2	10	234884	234893	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008497	TAGTT	2	10	250322	250331	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008497	ATTTA	2	10	258988	258997	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008497	TTGAA	2	10	262621	262630	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008497	ATTTG	2	10	297243	297252	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008497	ACTAG	2	10	303832	303841	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_008497	GGATG	2	10	313019	313028	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008497	TCATG	2	10	316756	316765	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_008497	CTAGT	2	10	322191	322200	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_008497	AACTG	2	10	325637	325646	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_008497	AATTG	2	10	334252	334261	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008497	AAAAT	2	10	334420	334429	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008497	GAAGA	2	10	335265	335274	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008497	TTATT	2	10	338357	338366	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008497	ATGAA	2	10	347458	347467	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008497	GATGA	2	10	353036	353045	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008497	GTAAA	2	10	363436	363445	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008497	TTGGG	2	10	373342	373351	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008497	TTTAA	2	10	387022	387031	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008497	AGCTT	2	10	433343	433352	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_008497	GGTGA	2	10	448845	448854	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008497	GATAT	2	10	452928	452937	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008497	ATGAT	2	10	453021	453030	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008497	TCGTG	2	10	454303	454312	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_008497	GCTAA	2	10	454503	454512	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_008497	ATTTT	2	10	496579	496588	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008497	TCCCC	2	10	501685	501694	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
62	NC_008497	GAGAT	2	10	501793	501802	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008497	AAGCC	2	10	513757	513766	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_008497	TGGCA	2	10	513877	513886	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_008497	AGTAA	2	10	531817	531826	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008497	TAAAA	2	10	545750	545759	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008497	CTATA	2	10	548857	548866	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_008497	GGTAA	2	10	560551	560560	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008497	TCGTG	2	10	564082	564091	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_008497	GCTAA	2	10	564282	564291	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_008497	AAATA	2	10	568400	568409	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008497	TTTTA	2	10	583074	583083	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008497	AATTA	2	10	587909	587918	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008497	ATATC	2	10	593622	593631	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_008497	ACTTA	2	10	611369	611378	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_008497	AAATG	2	10	618663	618672	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008497	AATTG	2	10	620777	620786	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008497	GGTTA	2	10	633678	633687	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008497	GTCGA	2	10	633776	633785	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_008497	AAAAT	2	10	649321	649330	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008497	AAGCA	2	10	655193	655202	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_008497	TAAAA	2	10	701574	701583	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008497	CTTTC	2	10	706087	706096	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_008497	CCGAC	2	10	714542	714551	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
85	NC_008497	AAGCT	2	10	722430	722439	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_008497	GTTTT	2	10	723994	724003	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008497	ATAAA	2	10	741209	741218	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008497	AGTGC	2	10	763796	763805	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_008497	CAGGG	2	10	801092	801101	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
90	NC_008497	GGAAC	2	10	807245	807254	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_008497	AAATG	2	10	822460	822469	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008497	AAACA	2	10	827463	827472	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_008497	GTAAA	2	10	832419	832428	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008497	TAATT	2	10	839708	839717	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008497	TAATA	2	10	844643	844652	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008497	GCTTC	2	10	849051	849060	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_008497	TATTT	2	10	851445	851454	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008497	TACTT	2	10	856307	856316	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_008497	TTTAA	2	10	864046	864055	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008497	AAAGT	2	10	868518	868527	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008497	TCACT	2	10	879266	879275	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_008497	ATATT	2	10	880338	880347	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008497	TTACT	2	10	896589	896598	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_008497	TCACA	2	10	896680	896689	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_008497	TGTTT	2	10	899222	899231	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008497	ATACT	2	10	904028	904037	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_008497	CCAAA	2	10	906137	906146	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_008497	CCAAA	2	10	906251	906260	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_008497	CCCAA	2	10	906908	906917	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
110	NC_008497	AGAAA	2	10	907014	907023	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008497	CAATG	2	10	917447	917456	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_008497	CTGAT	2	10	917945	917954	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_008497	AGCAG	2	10	918135	918144	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_008497	CTTCT	2	10	925788	925797	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_008497	AGCTA	2	10	931325	931334	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_008497	AAAGA	2	10	934559	934568	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008497	GTTTT	2	10	940953	940962	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008497	TTAGG	2	10	947404	947413	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008497	CAACC	2	10	959948	959957	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
120	NC_008497	AAACA	2	10	965328	965337	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_008497	GTCTC	2	10	1010656	1010665	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_008497	AACTT	2	10	1023270	1023279	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_008497	GAAAA	2	10	1035678	1035687	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008497	AACGG	2	10	1049166	1049175	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_008497	GAGTT	2	10	1056621	1056630	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008497	CTTAA	2	10	1059476	1059485	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_008497	ATAAA	2	10	1061207	1061216	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008497	GCTAG	2	10	1085088	1085097	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_008497	ATTAT	2	10	1086252	1086261	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008497	TTGGC	2	10	1109432	1109441	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_008497	GAATC	2	10	1118656	1118665	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_008497	TAGCC	2	10	1135834	1135843	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
133	NC_008497	TTAAT	2	10	1138937	1138946	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008497	GTCCA	2	10	1142824	1142833	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
135	NC_008497	TTAGC	2	10	1147066	1147075	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_008497	CACGA	2	10	1147266	1147275	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_008497	ATTTT	2	10	1158689	1158698	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008497	CAAAA	2	10	1160086	1160095	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_008497	AACGG	2	10	1163672	1163681	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_008497	AATAG	2	10	1180270	1180279	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008497	TGGGC	2	10	1180337	1180346	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
142	NC_008497	TACCA	2	10	1182880	1182889	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
143	NC_008497	TCTCC	2	10	1189628	1189637	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
144	NC_008497	TCACG	2	10	1219773	1219782	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
145	NC_008497	TATTT	2	10	1235914	1235923	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008497	GCTTT	2	10	1239069	1239078	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_008497	CCATT	2	10	1239084	1239093	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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271	NC_008497	AAATG	2	10	2282669	2282678	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.