MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 plasmid 3

Total Repeats: 279

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008014	T	6	6	229	234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008014	A	6	6	240	245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008014	A	6	6	254	259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008014	T	7	7	273	279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008014	A	9	9	309	317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008014	T	7	7	462	468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008014	T	6	6	1663	1668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008014	A	6	6	2032	2037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008014	A	6	6	2090	2095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008014	T	8	8	2120	2127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008014	A	6	6	2256	2261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008014	T	6	6	2307	2312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008014	T	6	6	4893	4898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008014	T	6	6	4922	4927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008014	T	7	7	5074	5080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008014	T	6	6	5773	5778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008014	T	7	7	7813	7819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008014	A	6	6	7825	7830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008014	T	7	7	10365	10371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008014	T	6	6	10438	10443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008014	A	6	6	11274	11279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008014	T	6	6	18444	18449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008014	A	7	7	26476	26482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008014	A	7	7	29834	29840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008014	A	6	6	29963	29968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008014	A	8	8	30006	30013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008014	T	7	7	30019	30025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008014	A	6	6	30048	30053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008014	T	6	6	30097	30102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008014	A	6	6	30148	30153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008014	A	6	6	32065	32070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008014	A	6	6	37527	37532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008014	T	6	6	37547	37552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008014	T	8	8	37634	37641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008014	A	7	7	37741	37747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008014	A	7	7	37788	37794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008014	T	7	7	39594	39600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008014	A	8	8	41147	41154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008014	A	6	6	41778	41783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008014	T	6	6	44319	44324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008014	T	6	6	46258	46263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008014	T	6	6	46502	46507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008014	A	8	8	46597	46604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008014	A	7	7	46666	46672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008014	T	6	6	46727	46732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008014	T	6	6	46746	46751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008014	T	6	6	46768	46773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008014	A	6	6	46776	46781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008014	A	6	6	53457	53462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008014	A	6	6	55609	55614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008014	T	6	6	55750	55755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54	NC_008014	A	6	6	55926	55931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.