MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 plasmid 3

Total Repeats: 1453

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008014	AAT	2	6	121420	121425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_008014	AT	3	6	121442	121447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_008014	TAT	2	6	121454	121459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_008014	AT	3	6	121464	121469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_008014	AGA	2	6	121500	121505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_008014	ATG	2	6	121542	121547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_008014	AT	3	6	121555	121560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_008014	ATA	2	6	121568	121573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_008014	TTAT	2	8	121604	121611	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_008014	TAT	2	6	121615	121620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_008014	T	6	6	121622	121627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_008014	T	6	6	121640	121645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_008014	ACA	2	6	121668	121673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_008014	TAT	2	6	121692	121697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_008014	TA	3	6	121719	121724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_008014	A	6	6	121736	121741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_008014	CTTTAT	2	12	121769	121780	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1018	NC_008014	T	7	7	121783	121789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_008014	TTC	2	6	121803	121808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_008014	T	6	6	121813	121818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_008014	ATT	2	6	121938	121943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_008014	GAAA	2	8	121944	121951	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_008014	G	6	6	121974	121979	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_008014	GAA	2	6	123182	123187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_008014	AT	3	6	124541	124546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_008014	ACA	2	6	125201	125206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_008014	A	6	6	125263	125268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_008014	AAT	2	6	126735	126740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_008014	ATG	2	6	126766	126771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_008014	GT	3	6	126804	126809	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_008014	TAG	2	6	126826	126831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_008014	T	8	8	126849	126856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_008014	A	7	7	126867	126873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_008014	TAAG	2	8	126885	126892	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_008014	AAG	2	6	127728	127733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_008014	CAA	2	6	127760	127765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_008014	A	6	6	127776	127781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_008014	CAA	2	6	127785	127790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_008014	GTTTT	2	10	127849	127858	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_008014	ATGG	2	8	127864	127871	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_008014	TAGGT	2	10	127904	127913	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_008014	TA	3	6	128797	128802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_008014	T	7	7	128816	128822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_008014	TA	3	6	128826	128831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_008014	A	7	7	128831	128837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_008014	T	7	7	128838	128844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_008014	AT	3	6	128845	128850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_008014	TAT	2	6	128854	128859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_008014	TAA	2	6	128874	128879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_008014	T	6	6	128888	128893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_008014	T	7	7	128895	128901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_008014	ATA	2	6	128913	128918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_008014	A	8	8	128954	128961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_008014	ATAGT	2	10	128991	129000	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_008014	ATT	2	6	129006	129011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_008014	T	6	6	129010	129015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_008014	ATG	2	6	129022	129027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_008014	TTGA	2	8	129041	129048	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_008014	AAT	2	6	129049	129054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_008014	TTGTG	2	10	129068	129077	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_008014	AG	3	6	130396	130401	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_008014	TCC	2	6	130403	130408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1063	NC_008014	AT	3	6	130423	130428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_008014	CTG	2	6	130445	130450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_008014	TTAT	2	8	130463	130470	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_008014	A	8	8	131569	131576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_008014	TGGGG	2	10	132186	132195	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_008014	T	6	6	132271	132276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_008014	TAC	2	6	132292	132297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_008014	ATATT	2	10	132298	132307	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_008014	ATT	3	9	133037	133045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_008014	T	6	6	133052	133057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_008014	TTA	2	6	133090	133095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_008014	ATTT	2	8	133126	133133	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_008014	T	6	6	133131	133136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_008014	AGT	2	6	133223	133228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_008014	GGA	2	6	133238	133243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_008014	GTT	2	6	133244	133249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_008014	GTTATT	2	12	133254	133265	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_008014	GTA	2	6	133286	133291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_008014	T	6	6	133298	133303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_008014	AAG	2	6	133804	133809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_008014	TAT	2	6	133821	133826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_008014	AT	4	8	133845	133852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_008014	T	6	6	133886	133891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_008014	TAA	2	6	133904	133909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_008014	T	8	8	133920	133927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_008014	AGT	2	6	133928	133933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_008014	AT	3	6	133934	133939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_008014	TAA	2	6	133978	133983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_008014	TAG	2	6	133989	133994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_008014	TTG	2	6	134005	134010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_008014	T	13	13	135017	135029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_008014	CTA	2	6	135037	135042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_008014	TAA	2	6	135053	135058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_008014	A	6	6	135070	135075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_008014	TAT	2	6	135079	135084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_008014	TA	3	6	136045	136050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_008014	TAT	2	6	136071	136076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_008014	GTA	2	6	136100	136105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_008014	CAA	2	6	136148	136153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_008014	GTTA	2	8	136169	136176	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_008014	AGTA	2	8	136213	136220	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_008014	TAA	2	6	136254	136259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_008014	TTATA	2	10	136299	136308	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_008014	T	6	6	136330	136335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_008014	TAATG	2	10	136339	136348	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_008014	TAA	2	6	136355	136360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_008014	ATA	2	6	137776	137781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_008014	AAC	2	6	137782	137787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_008014	AGT	2	6	137789	137794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_008014	TA	3	6	137798	137803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_008014	T	6	6	137804	137809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_008014	AT	3	6	137992	137997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_008014	AT	3	6	138031	138036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_008014	TAT	3	9	138034	138042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_008014	GAA	2	6	138048	138053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_008014	T	8	8	138063	138070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_008014	TAT	2	6	138077	138082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_008014	TTAA	2	8	138098	138105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_008014	T	6	6	138134	138139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_008014	T	7	7	138166	138172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_008014	A	6	6	138204	138209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_008014	T	6	6	138235	138240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_008014	T	7	7	138267	138273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_008014	A	6	6	138305	138310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_008014	T	6	6	138336	138341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_008014	T	7	7	138451	138457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_008014	TTTA	2	8	138466	138473	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_008014	ATT	2	6	138511	138516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_008014	GTA	2	6	138526	138531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_008014	ATAA	2	8	138565	138572	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_008014	TAT	2	6	139747	139752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_008014	TTA	2	6	139757	139762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_008014	TATAT	2	10	139782	139791	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_008014	ATATA	2	10	139828	139837	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_008014	T	7	7	139885	139891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_008014	TATAA	2	10	139903	139912	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_008014	TA	3	6	139930	139935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1140	NC_008014	ATT	2	6	139950	139955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1417	NC_008014	TAA	2	6	192645	192650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1418	NC_008014	TA	3	6	192657	192662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1419	NC_008014	TA	3	6	192672	192677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1420	NC_008014	AT	3	6	192686	192691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_008014	T	7	7	192704	192710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1422	NC_008014	A	6	6	192716	192721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_008014	AAT	2	6	192789	192794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1424	NC_008014	T	6	6	192846	192851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1425	NC_008014	A	6	6	192878	192883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1426	NC_008014	TA	3	6	192896	192901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1427	NC_008014	TTG	2	6	192924	192929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1428	NC_008014	AG	3	6	192944	192949	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1429	NC_008014	CGG	2	6	193016	193021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1430	NC_008014	AGAC	2	8	193027	193034	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1431	NC_008014	AG	3	6	193084	193089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1432	NC_008014	CAA	2	6	193114	193119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1433	NC_008014	ATG	2	6	193124	193129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1434	NC_008014	T	6	6	193131	193136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1435	NC_008014	AG	3	6	193173	193178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1436	NC_008014	GCA	2	6	193214	193219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1437	NC_008014	TAT	2	6	193282	193287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1438	NC_008014	TTTTCG	2	12	193345	193356	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1439	NC_008014	ATA	2	6	193398	193403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1440	NC_008014	TCT	2	6	193521	193526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1441	NC_008014	T	7	7	193556	193562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1442	NC_008014	TAT	2	6	193587	193592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1443	NC_008014	AG	4	8	193594	193601	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1444	NC_008014	TAT	3	9	193630	193638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1445	NC_008014	TAAT	2	8	193643	193650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1446	NC_008014	ATTA	2	8	193672	193679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1447	NC_008014	A	6	6	193742	193747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1448	NC_008014	ATT	2	6	193755	193760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1449	NC_008014	T	7	7	193786	193792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1450	NC_008014	AGA	2	6	193801	193806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1451	NC_008014	AGA	2	6	194506	194511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1452	NC_008014	ATA	2	6	194517	194522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1453	NC_008014	TAAC	2	8	194523	194530	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

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