MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 plasmid 3

Total Repeats: 1453

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008014	AT	3	6	76147	76152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_008014	TA	3	6	76156	76161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_008014	A	9	9	76166	76174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_008014	ATTA	2	8	76192	76199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_008014	GAA	2	6	76241	76246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_008014	A	7	7	76275	76281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_008014	TAT	2	6	76298	76303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_008014	TTG	2	6	76313	76318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_008014	T	6	6	76344	76349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_008014	GTT	2	6	76361	76366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_008014	AAT	2	6	76391	76396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_008014	TAT	2	6	76401	76406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_008014	CTAT	2	8	76416	76423	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
514	NC_008014	ATG	3	9	76550	76558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_008014	CTT	2	6	76594	76599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_008014	CTG	2	6	76605	76610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_008014	AAG	2	6	76669	76674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_008014	A	7	7	76688	76694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_008014	TTTA	2	8	76767	76774	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_008014	A	6	6	76806	76811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_008014	A	6	6	76847	76852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_008014	TAA	2	6	76853	76858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_008014	A	6	6	76862	76867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_008014	TAC	2	6	76985	76990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_008014	TCT	2	6	77080	77085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_008014	AAAG	2	8	77091	77098	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
527	NC_008014	TTCT	2	8	77115	77122	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
528	NC_008014	A	7	7	77147	77153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_008014	AGA	2	6	77169	77174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_008014	TTA	2	6	77182	77187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_008014	TAA	2	6	77192	77197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_008014	TAA	2	6	77230	77235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_008014	TGA	2	6	77254	77259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_008014	TTAT	2	8	77294	77301	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_008014	ACAT	2	8	77325	77332	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
536	NC_008014	TCC	2	6	77362	77367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_008014	TGT	2	6	77369	77374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_008014	TAA	2	6	77379	77384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_008014	TAA	2	6	77423	77428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_008014	ACA	2	6	77457	77462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_008014	TA	3	6	77466	77471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_008014	ATAA	2	8	77473	77480	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_008014	TAA	3	9	77478	77486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_008014	A	8	8	77520	77527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_008014	TAA	2	6	77556	77561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_008014	TAA	2	6	77592	77597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_008014	GAA	2	6	77607	77612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_008014	TTA	2	6	77637	77642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_008014	TAA	2	6	77665	77670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_008014	ATCATT	2	12	77693	77704	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
551	NC_008014	GTA	2	6	77731	77736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_008014	GTA	2	6	77754	77759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_008014	ATA	2	6	77775	77780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_008014	TATT	2	8	80723	80730	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_008014	T	6	6	80729	80734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_008014	TTA	2	6	80737	80742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_008014	GTT	2	6	80757	80762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_008014	TAT	2	6	80791	80796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_008014	GAAT	2	8	80812	80819	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
560	NC_008014	A	6	6	80861	80866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_008014	TATT	2	8	80871	80878	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_008014	TTA	2	6	80897	80902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_008014	TAAA	2	8	80907	80914	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_008014	AT	3	6	80920	80925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_008014	T	6	6	80925	80930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_008014	TTAAA	2	10	80938	80947	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_008014	TA	3	6	80950	80955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_008014	TA	3	6	80969	80974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_008014	TAA	2	6	80992	80997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_008014	AT	3	6	81000	81005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_008014	TATT	2	8	81017	81024	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_008014	TAAA	3	12	81026	81037	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_008014	TTA	3	9	81046	81054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_008014	TAA	2	6	81069	81074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_008014	AATT	2	8	81075	81082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_008014	TAT	2	6	81085	81090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_008014	ATG	2	6	81131	81136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_008014	T	6	6	81137	81142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_008014	TAT	2	6	81160	81165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_008014	A	6	6	81168	81173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_008014	ATG	2	6	81187	81192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_008014	TA	3	6	81202	81207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_008014	ATA	3	9	81205	81213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_008014	ATT	2	6	81224	81229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_008014	TAT	2	6	81283	81288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_008014	TAT	2	6	81300	81305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_008014	A	7	7	81332	81338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_008014	TAA	2	6	81341	81346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_008014	CTT	2	6	81374	81379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_008014	TAA	2	6	81385	81390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_008014	CTT	2	6	81410	81415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_008014	TCT	2	6	81482	81487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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595	NC_008014	TA	3	6	81634	81639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_008014	ACT	2	6	81646	81651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_008014	TAA	2	6	83726	83731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_008014	A	7	7	83730	83736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_008014	T	6	6	83740	83745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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601	NC_008014	TAAT	2	8	83760	83767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_008014	GA	4	8	83781	83788	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
603	NC_008014	T	6	6	83794	83799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_008014	TAAAA	2	10	83830	83839	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_008014	TTA	2	6	83850	83855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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607	NC_008014	AGATA	2	10	83936	83945	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
608	NC_008014	TTTA	2	8	83948	83955	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_008014	A	6	6	83981	83986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_008014	T	7	7	84013	84019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_008014	AAT	2	6	84030	84035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_008014	GTT	2	6	84075	84080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_008014	CAT	2	6	84138	84143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_008014	TTG	2	6	84174	84179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_008014	A	6	6	84231	84236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_008014	AATA	2	8	84248	84255	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_008014	T	6	6	84264	84269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_008014	TACT	2	8	84271	84278	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
619	NC_008014	AATAA	2	10	84299	84308	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_008014	ATTA	2	8	86379	86386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_008014	TA	3	6	86416	86421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_008014	ATT	2	6	86424	86429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_008014	ATT	2	6	86450	86455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_008014	AT	3	6	86467	86472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_008014	TTTA	2	8	86479	86486	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_008014	AT	3	6	86495	86500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_008014	TA	3	6	86532	86537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_008014	TAT	2	6	88642	88647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_008014	AT	3	6	88655	88660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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632	NC_008014	A	6	6	88784	88789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_008014	A	6	6	88814	88819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_008014	ATTATA	2	12	88824	88835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_008014	ATT	3	9	88900	88908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_008014	TA	3	6	88922	88927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_008014	ATA	2	6	88955	88960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_008014	GTTT	2	8	88961	88968	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
639	NC_008014	TA	3	6	88979	88984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_008014	TA	3	6	88990	88995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_008014	ATGTT	2	10	89003	89012	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
642	NC_008014	TACT	2	8	89026	89033	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
643	NC_008014	A	6	6	89039	89044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
644	NC_008014	AT	3	6	89056	89061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
645	NC_008014	A	6	6	89068	89073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
646	NC_008014	ATA	2	6	89085	89090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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