MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 plasmid 2

Total Repeats: 92

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008013	A	6	6	73	78	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008013	A	7	7	255	261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008013	A	6	6	1017	1022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008013	T	6	6	1040	1045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008013	A	6	6	1119	1124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008013	A	7	7	1302	1308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008013	A	6	6	1351	1356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008013	A	7	7	1601	1607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008013	A	6	6	1882	1887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008013	A	8	8	1977	1984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008013	A	6	6	2081	2086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008013	A	6	6	2225	2230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008013	T	6	6	2716	2721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008013	T	7	7	3866	3872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008013	T	6	6	3917	3922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008013	A	6	6	3961	3966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008013	A	6	6	3983	3988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008013	A	6	6	4005	4010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008013	A	6	6	4027	4032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008013	A	6	6	4047	4052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008013	T	6	6	4091	4096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008013	T	6	6	4110	4115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008013	A	6	6	4196	4201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008013	A	6	6	4315	4320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008013	T	8	8	4429	4436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008013	T	6	6	7888	7893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008013	T	6	6	7948	7953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008013	T	9	9	7979	7987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008013	A	6	6	8246	8251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008013	A	7	7	9403	9409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008013	T	7	7	9443	9449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008013	A	8	8	9452	9459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008013	A	6	6	9564	9569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008013	A	6	6	9580	9585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008013	T	7	7	9637	9643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008013	T	6	6	9930	9935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008013	A	7	7	10000	10006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008013	A	7	7	10034	10040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008013	A	6	6	10085	10090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008013	T	7	7	10314	10320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008013	T	6	6	10410	10415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008013	T	7	7	12684	12690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008013	T	6	6	19292	19297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008013	T	6	6	24751	24756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008013	A	6	6	24892	24897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008013	T	7	7	26861	26867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008013	A	7	7	27138	27144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008013	G	6	6	27205	27210	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008013	A	6	6	27531	27536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008013	A	8	8	28821	28828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008013	A	9	9	28935	28943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008013	T	6	6	29010	29015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008013	A	6	6	29144	29149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008013	A	6	6	29176	29181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008013	A	6	6	29217	29222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008013	A	6	6	29250	29255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008013	T	6	6	29256	29261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008013	T	6	6	29687	29692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008013	A	6	6	29718	29723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008013	A	6	6	30267	30272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008013	T	7	7	30526	30532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008013	T	6	6	30683	30688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008013	A	7	7	30826	30832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008013	T	8	8	30937	30944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008013	T	6	6	31029	31034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008013	A	6	6	31665	31670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008013	A	6	6	31844	31849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008013	T	6	6	31857	31862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008013	T	6	6	31963	31968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008013	T	7	7	32093	32099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008013	T	7	7	32118	32124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008013	A	13	13	32255	32267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008013	A	8	8	33105	33112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008013	T	6	6	33193	33198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008013	A	6	6	33362	33367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008013	T	6	6	33451	33456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008013	T	6	6	33522	33527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008013	T	9	9	33620	33628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008013	T	6	6	36711	36716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008013	A	7	7	36752	36758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008013	T	7	7	36799	36805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008013	A	6	6	38188	38193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008013	A	8	8	38249	38256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008013	T	6	6	38288	38293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008013	A	6	6	38297	38302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008013	A	6	6	38367	38372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008013	A	6	6	38453	38458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008013	A	6	6	38629	38634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008013	A	6	6	38650	38655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008013	A	6	6	39438	39443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008013	A	6	6	39642	39647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008013	A	7	7	39783	39789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.