MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 8162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008011	A	7	7	715224	715230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_008011	TCT	2	6	715251	715256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_008011	TA	3	6	715981	715986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_008011	A	6	6	715993	715998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_008011	A	6	6	721295	721300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_008011	CTC	2	6	721969	721974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4007	NC_008011	CTAT	3	12	722019	722030	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4008	NC_008011	TAT	2	6	723029	723034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_008011	A	7	7	723438	723444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_008011	CCTT	2	8	723474	723481	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4011	NC_008011	CT	3	6	723491	723496	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4012	NC_008011	TTAA	2	8	723551	723558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_008011	ACT	2	6	723596	723601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_008011	ATA	2	6	723612	723617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_008011	CAA	2	6	723648	723653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_008011	TTG	2	6	725274	725279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_008011	A	7	7	726935	726941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_008011	TTA	2	6	727000	727005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_008011	T	7	7	727036	727042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_008011	TCT	2	6	727066	727071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_008011	AT	3	6	727072	727077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_008011	TTA	3	9	727118	727126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_008011	ATAAA	2	10	727127	727136	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_008011	TA	3	6	727742	727747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_008011	A	6	6	727750	727755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_008011	A	6	6	727762	727767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_008011	TAT	8	24	727800	727823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_008011	ATG	2	6	727837	727842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_008011	AT	3	6	727877	727882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_008011	ATTAT	2	10	727890	727899	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_008011	ATT	2	6	727917	727922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_008011	TAT	2	6	729386	729391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_008011	CCA	2	6	731853	731858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4034	NC_008011	TAA	2	6	733365	733370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_008011	A	6	6	733369	733374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_008011	TTA	2	6	733381	733386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_008011	AAT	2	6	733461	733466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_008011	TTAA	2	8	733471	733478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_008011	TCAA	2	8	734038	734045	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4040	NC_008011	TA	7	14	734051	734064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_008011	TA	3	6	734111	734116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_008011	TAT	2	6	734242	734247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_008011	ATA	2	6	734253	734258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_008011	ATA	2	6	734325	734330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_008011	ATA	2	6	734333	734338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_008011	GATA	2	8	734346	734353	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_008011	TAT	2	6	734363	734368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_008011	CTT	3	9	734398	734406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_008011	TA	3	6	734409	734414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_008011	A	6	6	734424	734429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_008011	TTA	2	6	734447	734452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_008011	CT	3	6	734491	734496	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4053	NC_008011	ACTT	2	8	734502	734509	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4054	NC_008011	ATT	2	6	734525	734530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_008011	ATTA	2	8	734542	734549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_008011	A	6	6	734578	734583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_008011	T	6	6	734595	734600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_008011	TAA	2	6	734602	734607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_008011	ATA	2	6	734621	734626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_008011	AAT	2	6	734629	734634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_008011	ATA	2	6	734638	734643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_008011	TAT	2	6	734663	734668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_008011	TTAG	2	8	734693	734700	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_008011	TTA	2	6	734737	734742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_008011	ATT	2	6	734784	734789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_008011	TAT	2	6	734794	734799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_008011	TTTA	2	8	734834	734841	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_008011	TCT	2	6	737272	737277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_008011	T	7	7	737290	737296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_008011	TTA	2	6	739390	739395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_008011	TAAT	2	8	739401	739408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_008011	TTC	2	6	739451	739456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_008011	A	6	6	739493	739498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_008011	ATAAG	2	10	739516	739525	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_008011	AAT	2	6	739540	739545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_008011	A	6	6	739567	739572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_008011	ATTA	2	8	739587	739594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_008011	TAA	3	9	739600	739608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_008011	A	6	6	739612	739617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_008011	TGT	2	6	739621	739626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_008011	ATA	2	6	739636	739641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_008011	TA	3	6	739640	739645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_008011	TAG	2	6	739648	739653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_008011	TA	3	6	741527	741532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_008011	TTA	2	6	741536	741541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_008011	TAA	2	6	741575	741580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_008011	A	7	7	741583	741589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_008011	CAA	2	6	741619	741624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_008011	CT	3	6	741628	741633	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4090	NC_008011	CAA	2	6	741699	741704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_008011	TGT	2	6	741745	741750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_008011	CATTG	2	10	741764	741773	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4093	NC_008011	CA	3	6	741775	741780	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4094	NC_008011	TA	4	8	741826	741833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_008011	TGCT	2	8	741859	741866	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4096	NC_008011	AATAA	2	10	741867	741876	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_008011	TAG	2	6	741905	741910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_008011	TAT	2	6	741913	741918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_008011	TAA	2	6	741970	741975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_008011	ATA	2	6	741979	741984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_008011	ATT	2	6	742018	742023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_008011	AAT	2	6	742026	742031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_008011	ATATTA	2	12	742032	742043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_008011	CAT	2	6	742050	742055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_008011	CTAT	2	8	742059	742066	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4106	NC_008011	ATT	2	6	742076	742081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_008011	TA	3	6	742082	742087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_008011	TA	3	6	742090	742095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_008011	ATA	2	6	742102	742107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_008011	AAT	2	6	742108	742113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_008011	AAG	2	6	742123	742128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_008011	TA	4	8	742137	742144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_008011	TTA	2	6	742165	742170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_008011	TCTA	2	8	742175	742182	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4115	NC_008011	ACTC	2	8	743548	743555	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4116	NC_008011	CTTA	2	8	743562	743569	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4117	NC_008011	ATT	2	6	743602	743607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_008011	T	6	6	744363	744368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_008011	ATA	2	6	744390	744395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_008011	TAAT	2	8	744427	744434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_008011	AT	3	6	744433	744438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_008011	ATAA	2	8	744448	744455	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_008011	TAA	2	6	744489	744494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_008011	TAA	3	9	744514	744522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_008011	A	6	6	744558	744563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_008011	A	6	6	744581	744586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_008011	ACA	2	6	744605	744610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_008011	ACT	2	6	744612	744617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_008011	CT	3	6	744620	744625	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4130	NC_008011	TATTTT	2	12	744635	744646	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_008011	ATT	2	6	744650	744655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_008011	T	6	6	744664	744669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_008011	TA	3	6	746287	746292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_008011	AT	3	6	747435	747440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_008011	GAA	2	6	747441	747446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_008011	TCT	2	6	748347	748352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4137	NC_008011	AAG	2	6	748362	748367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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