MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 8162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008011	TTA	2	6	202760	202765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_008011	TAT	2	6	202772	202777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_008011	TA	3	6	203980	203985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_008011	TAG	2	6	203987	203992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_008011	ACG	2	6	204015	204020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_008011	T	6	6	204042	204047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_008011	TTG	2	6	204051	204056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_008011	TTA	2	6	204084	204089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_008011	CAG	2	6	204661	204666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_008011	TGT	2	6	204675	204680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_008011	GTG	2	6	204686	204691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_008011	TTGT	2	8	204698	204705	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_008011	AT	3	6	204717	204722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_008011	GA	3	6	204727	204732	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_008011	TAA	2	6	205862	205867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_008011	ATTT	2	8	205876	205883	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_008011	TTG	2	6	205905	205910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_008011	ATT	2	6	205911	205916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_008011	ACT	2	6	205948	205953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_008011	AGT	2	6	206502	206507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_008011	TAC	2	6	206521	206526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_008011	T	7	7	206542	206548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_008011	AAAATA	2	12	206550	206561	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_008011	GTG	2	6	206574	206579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_008011	AGCA	2	8	206686	206693	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1526	NC_008011	T	6	6	206694	206699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_008011	TTA	2	6	206705	206710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_008011	CAT	2	6	206718	206723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_008011	TAAT	2	8	206803	206810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_008011	TAA	2	6	207455	207460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_008011	T	6	6	207473	207478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_008011	TAT	2	6	207486	207491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_008011	TA	3	6	210805	210810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_008011	T	6	6	210839	210844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_008011	TAAA	2	8	210858	210865	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_008011	A	7	7	210863	210869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_008011	GTGA	2	8	210870	210877	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_008011	TTG	2	6	210906	210911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_008011	ATT	2	6	210928	210933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_008011	T	6	6	210932	210937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_008011	ATA	2	6	210940	210945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_008011	T	6	6	211020	211025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_008011	T	8	8	211028	211035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_008011	T	6	6	211038	211043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_008011	A	6	6	211058	211063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_008011	TGA	2	6	211078	211083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_008011	ATAA	2	8	211089	211096	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_008011	ATGTT	2	10	211152	211161	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_008011	ATT	2	6	211174	211179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_008011	A	6	6	211226	211231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_008011	T	6	6	211285	211290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_008011	TCAT	2	8	211309	211316	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1553	NC_008011	TAC	2	6	211341	211346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_008011	T	6	6	211361	211366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_008011	ATA	2	6	211370	211375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_008011	CT	3	6	211390	211395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1557	NC_008011	TTA	2	6	211400	211405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_008011	T	6	6	211420	211425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_008011	TAAATT	2	12	211435	211446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_008011	TGA	2	6	211452	211457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_008011	T	6	6	211515	211520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_008011	ATT	2	6	211523	211528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_008011	AGT	2	6	211531	211536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_008011	AGTTAT	2	12	211543	211554	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_008011	T	6	6	211554	211559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_008011	TTA	2	6	211583	211588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_008011	ATA	2	6	213261	213266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_008011	ATCA	2	8	213272	213279	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1569	NC_008011	ATTT	2	8	213286	213293	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_008011	ATT	3	9	213300	213308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_008011	TAT	2	6	213309	213314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_008011	TTA	3	9	213315	213323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_008011	TA	3	6	213327	213332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_008011	GTA	2	6	213345	213350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_008011	ATA	2	6	213351	213356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_008011	AAG	2	6	216112	216117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_008011	ATG	2	6	216179	216184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_008011	TAT	2	6	216197	216202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_008011	GTA	2	6	216245	216250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_008011	TAAA	2	8	216284	216291	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_008011	A	7	7	216289	216295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_008011	GA	3	6	216296	216301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_008011	T	6	6	216317	216322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_008011	TAC	2	6	216336	216341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_008011	AGT	2	6	216346	216351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_008011	GTAT	2	8	216358	216365	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_008011	TAG	2	6	216373	216378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_008011	ATAG	2	8	216379	216386	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_008011	T	6	6	216410	216415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_008011	AG	3	6	216442	216447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_008011	TAT	2	6	216502	216507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_008011	A	7	7	216526	216532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_008011	AT	3	6	216537	216542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_008011	ACTA	2	8	216546	216553	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1595	NC_008011	AAAG	2	8	216578	216585	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_008011	A	7	7	217909	217915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_008011	ACA	2	6	217969	217974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_008011	TAA	2	6	217989	217994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_008011	TTAT	2	8	218030	218037	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_008011	TAT	3	9	218052	218060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_008011	AGA	2	6	218127	218132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_008011	TA	3	6	218190	218195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_008011	TTA	2	6	218209	218214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_008011	AATAA	2	10	218245	218254	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_008011	AGA	2	6	218259	218264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_008011	AAGT	2	8	218290	218297	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_008011	TTA	2	6	218310	218315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_008011	T	7	7	218349	218355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_008011	T	7	7	218405	218411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_008011	T	6	6	218423	218428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_008011	T	6	6	218433	218438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_008011	GTT	2	6	218443	218448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_008011	TTA	2	6	218466	218471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_008011	AGTT	2	8	218473	218480	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_008011	ATTA	2	8	218481	218488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_008011	TAT	2	6	218490	218495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_008011	T	12	12	218498	218509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_008011	ATT	2	6	218583	218588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_008011	TCA	2	6	218600	218605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_008011	TAT	2	6	218611	218616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_008011	ATT	2	6	218633	218638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_008011	CT	3	6	218645	218650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1623	NC_008011	TTAT	2	8	218672	218679	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_008011	CAT	2	6	220881	220886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_008011	T	9	9	220950	220958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_008011	GAG	2	6	220959	220964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_008011	AGC	2	6	221043	221048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_008011	ATG	2	6	221109	221114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_008011	GGA	2	6	221200	221205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_008011	GGT	2	6	222902	222907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_008011	GA	3	6	222929	222934	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_008011	CT	3	6	222952	222957	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1633	NC_008011	CAT	2	6	223435	223440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_008011	AAG	2	6	223510	223515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_008011	A	6	6	223598	223603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_008011	TCCC	2	8	223604	223611	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1637	NC_008011	C	6	6	223609	223614	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1638	NC_008011	GAA	2	6	223678	223683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1916	NC_008011	AAAGAA	2	12	292206	292217	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1917	NC_008011	T	6	6	292224	292229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1918	NC_008011	CAA	3	9	292246	292254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1919	NC_008011	CTG	2	6	292313	292318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1920	NC_008011	CTTT	2	8	292338	292345	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1921	NC_008011	ATAA	2	8	295098	295105	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1922	NC_008011	TAA	2	6	295117	295122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1924	NC_008011	GGA	2	6	295145	295150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1925	NC_008011	TAA	2	6	295151	295156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1927	NC_008011	TGCAAG	2	12	295265	295276	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1928	NC_008011	AAG	2	6	295307	295312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1932	NC_008011	A	6	6	295454	295459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1933	NC_008011	CAT	2	6	295460	295465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1938	NC_008011	TA	3	6	296103	296108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1939	NC_008011	ATA	2	6	296124	296129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1942	NC_008011	TA	3	6	297949	297954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1943	NC_008011	TAT	2	6	298975	298980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1944	NC_008011	TAAA	2	8	298993	299000	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1945	NC_008011	AAG	2	6	299007	299012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1946	NC_008011	AT	3	6	299020	299025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1947	NC_008011	TAAAAA	2	12	299032	299043	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1948	NC_008011	ATT	2	6	299085	299090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1949	NC_008011	A	6	6	299654	299659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1950	NC_008011	A	6	6	299662	299667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1951	NC_008011	A	8	8	299741	299748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1952	NC_008011	A	10	10	299762	299771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1953	NC_008011	A	8	8	299910	299917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1954	NC_008011	CTT	2	6	299926	299931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1956	NC_008011	TAA	2	6	299974	299979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1957	NC_008011	A	6	6	299978	299983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1958	NC_008011	TAA	2	6	299984	299989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1961	NC_008011	CTAG	2	8	300068	300075	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1962	NC_008011	TA	4	8	300112	300119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1963	NC_008011	AT	3	6	300133	300138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1964	NC_008011	T	6	6	300138	300143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1965	NC_008011	ATG	3	9	306650	306658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1968	NC_008011	TGT	2	6	306700	306705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1969	NC_008011	TAA	3	9	306712	306720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1972	NC_008011	AATACA	2	12	307823	307834	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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1975	NC_008011	TA	3	6	307872	307877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1976	NC_008011	T	6	6	307885	307890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1977	NC_008011	TAA	2	6	307898	307903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1978	NC_008011	A	6	6	307910	307915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1979	NC_008011	AAC	2	6	307929	307934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1980	NC_008011	TTAT	2	8	307979	307986	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1981	NC_008011	AAC	2	6	308824	308829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1985	NC_008011	AAAG	2	8	311172	311179	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1986	NC_008011	AT	3	6	313038	313043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1987	NC_008011	TTTA	2	8	313098	313105	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1988	NC_008011	A	6	6	313156	313161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1994	NC_008011	TATAAT	2	12	314351	314362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1995	NC_008011	A	6	6	314386	314391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1997	NC_008011	T	7	7	314457	314463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1998	NC_008011	A	13	13	314466	314478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1999	NC_008011	AAT	2	6	314498	314503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2000	NC_008011	TTA	2	6	314540	314545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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