MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 8162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008011	TA	3	6	125420	125425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_008011	AT	3	6	125445	125450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_008011	TAT	2	6	125468	125473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_008011	T	9	9	125488	125496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_008011	A	6	6	127506	127511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_008011	TTA	3	9	127545	127553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_008011	TATT	2	8	127606	127613	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_008011	TAA	2	6	127625	127630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_008011	TGT	3	9	127656	127664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_008011	ATA	2	6	127670	127675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_008011	CAT	2	6	127679	127684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_008011	AAC	2	6	130856	130861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_008011	ATT	2	6	130891	130896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_008011	TAC	2	6	130904	130909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_008011	AAT	2	6	130910	130915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_008011	AAT	2	6	130988	130993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_008011	A	6	6	130999	131004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_008011	TAA	2	6	131052	131057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_008011	T	6	6	131113	131118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_008011	GAG	2	6	131160	131165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_008011	TA	3	6	133094	133099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_008011	A	6	6	133108	133113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_008011	GTT	2	6	133125	133130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_008011	ATTT	2	8	133173	133180	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_008011	TCTA	2	8	133188	133195	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1026	NC_008011	A	6	6	133195	133200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_008011	A	6	6	133202	133207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_008011	TAA	2	6	134188	134193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_008011	AT	3	6	134196	134201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_008011	A	6	6	134228	134233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_008011	TAAA	3	12	134256	134267	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_008011	CTA	2	6	134268	134273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_008011	ATT	2	6	134274	134279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_008011	A	6	6	134301	134306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_008011	T	6	6	134316	134321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_008011	TA	3	6	134343	134348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_008011	AAG	2	6	136986	136991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_008011	TTAAA	2	10	137021	137030	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_008011	CAA	2	6	137034	137039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_008011	ATA	2	6	137054	137059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_008011	AGT	2	6	137064	137069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_008011	GAT	2	6	137074	137079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_008011	ATT	2	6	137086	137091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_008011	TTA	2	6	137117	137122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_008011	TAG	2	6	137141	137146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_008011	AT	7	14	137169	137182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_008011	AGG	2	6	137192	137197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_008011	AGT	2	6	137211	137216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_008011	ATCTTA	2	12	137218	137229	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1050	NC_008011	TA	3	6	137243	137248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_008011	TAT	2	6	138259	138264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_008011	TAA	2	6	138268	138273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_008011	TTA	2	6	138275	138280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_008011	TA	3	6	138299	138304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_008011	ATT	2	6	138311	138316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_008011	TTA	2	6	138326	138331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_008011	TA	3	6	138330	138335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_008011	AGT	2	6	138336	138341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_008011	AGT	2	6	138363	138368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_008011	GTAT	2	8	138374	138381	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_008011	AGGT	2	8	138382	138389	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_008011	AGTAAA	2	12	138409	138420	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_008011	A	6	6	138418	138423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_008011	T	6	6	138425	138430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_008011	TA	3	6	138447	138452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_008011	ATAA	2	8	138492	138499	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_008011	TAA	2	6	138542	138547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_008011	GTG	2	6	138557	138562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_008011	GGA	2	6	138569	138574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_008011	T	7	7	138640	138646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_008011	ATGA	2	8	138655	138662	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_008011	AAG	2	6	138672	138677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_008011	TTG	2	6	138693	138698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_008011	TA	3	6	138710	138715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_008011	T	6	6	140776	140781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_008011	TTA	2	6	140804	140809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_008011	ATA	2	6	141760	141765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_008011	TA	3	6	141794	141799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_008011	A	8	8	142826	142833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_008011	ATA	2	6	142856	142861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_008011	GATA	2	8	142866	142873	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_008011	TA	3	6	142872	142877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_008011	T	9	9	142900	142908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_008011	T	6	6	142920	142925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_008011	T	6	6	144330	144335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_008011	ATA	3	9	144358	144366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_008011	AGAA	2	8	144367	144374	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_008011	TAT	2	6	144378	144383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_008011	TA	3	6	144385	144390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_008011	TAT	2	6	145724	145729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_008011	AGT	2	6	145731	145736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_008011	AAAGAA	2	12	145753	145764	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_008011	TTATA	2	10	145774	145783	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_008011	AAAG	2	8	145802	145809	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_008011	T	6	6	145853	145858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_008011	ACCAT	2	10	145860	145869	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1097	NC_008011	AGA	2	6	145875	145880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_008011	ATA	2	6	145905	145910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_008011	CAT	2	6	146540	146545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_008011	A	7	7	147633	147639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_008011	TAA	2	6	147654	147659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_008011	GTTA	2	8	147681	147688	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_008011	T	6	6	149926	149931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_008011	AG	3	6	149971	149976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_008011	ATA	2	6	149984	149989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_008011	TAA	2	6	150891	150896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_008011	A	6	6	151586	151591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_008011	TAT	2	6	151633	151638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_008011	A	6	6	151714	151719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_008011	TAA	2	6	151756	151761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_008011	A	6	6	151760	151765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_008011	AGTT	2	8	151774	151781	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_008011	TAT	2	6	151803	151808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_008011	TA	3	6	151837	151842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_008011	T	6	6	151845	151850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_008011	AT	3	6	151920	151925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_008011	AACA	2	8	151926	151933	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1118	NC_008011	TAAT	2	8	151947	151954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_008011	ATAA	2	8	151988	151995	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_008011	A	7	7	151994	152000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_008011	TAA	2	6	152011	152016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_008011	GTTA	2	8	152017	152024	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_008011	TATT	2	8	152056	152063	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_008011	GAA	2	6	152070	152075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_008011	AT	3	6	152089	152094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_008011	GTA	2	6	152125	152130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_008011	ATT	2	6	152178	152183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_008011	TAAG	2	8	152214	152221	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_008011	CTAA	2	8	152993	153000	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1130	NC_008011	AT	3	6	153023	153028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_008011	TAA	2	6	153029	153034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_008011	AT	3	6	153040	153045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_008011	TAT	2	6	153067	153072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_008011	AT	3	6	153093	153098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_008011	TAA	2	6	153711	153716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_008011	AGGTA	2	10	153717	153726	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_008011	CTT	2	6	153728	153733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1139	NC_008011	TTAT	2	8	153744	153751	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1431	NC_008011	T	7	7	181891	181897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1442	NC_008011	TAT	2	6	183968	183973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1443	NC_008011	T	6	6	183973	183978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1445	NC_008011	ATA	2	6	185159	185164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1449	NC_008011	A	6	6	185268	185273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1450	NC_008011	T	6	6	185286	185291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1451	NC_008011	ATT	2	6	185329	185334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1454	NC_008011	A	7	7	185852	185858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1455	NC_008011	T	7	7	185881	185887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1500	NC_008011	T	6	6	201731	201736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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