MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 8162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008011	TAC	2	6	74879	74884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_008011	TAT	2	6	74885	74890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_008011	TTAT	2	8	75783	75790	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_008011	TAA	2	6	75837	75842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_008011	GTA	2	6	75860	75865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_008011	TAG	2	6	75870	75875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_008011	CTA	2	6	75882	75887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_008011	T	6	6	75897	75902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_008011	TAA	2	6	75904	75909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_008011	TAA	3	9	77610	77618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_008011	TATGA	2	10	77623	77632	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
512	NC_008011	AG	3	6	77633	77638	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
513	NC_008011	AGTT	2	8	77658	77665	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
514	NC_008011	A	6	6	77671	77676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_008011	ATT	3	9	80104	80112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_008011	AAAT	2	8	80115	80122	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_008011	TA	3	6	80157	80162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_008011	TAA	2	6	80184	80189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_008011	ATA	2	6	80204	80209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_008011	TTA	2	6	80215	80220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_008011	AT	3	6	80223	80228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_008011	TTA	2	6	80290	80295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_008011	ATT	2	6	80302	80307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_008011	T	7	7	80315	80321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_008011	ATA	2	6	80322	80327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_008011	AGA	2	6	80343	80348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_008011	TAT	2	6	80360	80365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_008011	TAA	2	6	80367	80372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_008011	ATA	2	6	80382	80387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_008011	T	6	6	80400	80405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_008011	ATA	2	6	80950	80955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_008011	TAT	2	6	80976	80981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_008011	TC	3	6	80994	80999	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
534	NC_008011	A	6	6	81036	81041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_008011	AT	3	6	81064	81069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_008011	TTA	2	6	81074	81079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_008011	T	8	8	81083	81090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_008011	CTT	2	6	81092	81097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_008011	ATCTT	2	10	81101	81110	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
540	NC_008011	T	7	7	81138	81144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_008011	TAAT	2	8	81197	81204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_008011	TATT	2	8	81224	81231	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_008011	TAAT	2	8	81233	81240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_008011	ATA	2	6	81249	81254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_008011	AAT	2	6	81255	81260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_008011	ATA	2	6	81286	81291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_008011	TA	4	8	81301	81308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_008011	TTA	2	6	81321	81326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_008011	ATAATT	2	12	81327	81338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_008011	T	6	6	81354	81359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_008011	TTA	2	6	81393	81398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_008011	A	6	6	81403	81408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_008011	TA	3	6	81425	81430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_008011	ATCTA	2	10	81431	81440	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
555	NC_008011	TAATT	2	10	81444	81453	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_008011	AAT	2	6	81466	81471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_008011	A	6	6	81485	81490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_008011	GAT	2	6	81506	81511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_008011	AT	4	8	81566	81573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_008011	TTG	2	6	81581	81586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_008011	TA	3	6	81587	81592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_008011	T	6	6	81595	81600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_008011	GAAA	2	8	81601	81608	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
564	NC_008011	TTAC	2	8	81619	81626	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
565	NC_008011	AAT	2	6	81630	81635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_008011	AAT	2	6	82489	82494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_008011	TA	3	6	82545	82550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_008011	CAAT	2	8	82888	82895	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
569	NC_008011	AAT	2	6	82931	82936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_008011	TAT	3	9	82939	82947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_008011	TTA	2	6	83000	83005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_008011	TACA	2	8	83013	83020	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
573	NC_008011	ATT	2	6	83034	83039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_008011	TAA	2	6	83040	83045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_008011	T	6	6	83047	83052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_008011	ATT	2	6	83053	83058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_008011	TTATT	2	10	83091	83100	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_008011	AGTT	2	8	83109	83116	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
579	NC_008011	TAC	2	6	83135	83140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_008011	ATT	2	6	83169	83174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_008011	A	6	6	83177	83182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_008011	TTA	2	6	83209	83214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_008011	TA	4	8	83217	83224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_008011	TTA	2	6	83230	83235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_008011	TA	3	6	83234	83239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_008011	TTATT	2	10	83248	83257	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_008011	GTAT	2	8	83318	83325	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
588	NC_008011	TA	3	6	83334	83339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_008011	A	6	6	83360	83365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_008011	AGC	2	6	84099	84104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_008011	TCA	2	6	84122	84127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_008011	T	6	6	84131	84136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_008011	T	6	6	84169	84174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_008011	AAT	2	6	84186	84191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_008011	T	6	6	84208	84213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_008011	TATT	2	8	84215	84222	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_008011	ACTTT	2	10	84233	84242	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
598	NC_008011	ATTT	2	8	84244	84251	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_008011	CTA	2	6	84268	84273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_008011	TAA	2	6	84298	84303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_008011	T	6	6	84305	84310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_008011	ATT	2	6	84323	84328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_008011	T	6	6	84327	84332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_008011	TATT	2	8	84341	84348	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_008011	TAT	2	6	84387	84392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_008011	A	6	6	84423	84428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_008011	AT	4	8	84446	84453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_008011	TGT	2	6	84484	84489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_008011	TTA	2	6	84520	84525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_008011	ATT	2	6	84539	84544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_008011	TTC	2	6	84568	84573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_008011	TA	3	6	84605	84610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_008011	A	6	6	85230	85235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_008011	GTA	2	6	85237	85242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_008011	TAG	2	6	85279	85284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_008011	ATT	3	9	85285	85293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_008011	T	6	6	85292	85297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_008011	A	6	6	85301	85306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_008011	ATA	2	6	85317	85322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_008011	T	8	8	85345	85352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_008011	ATA	2	6	85354	85359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_008011	AGT	2	6	85415	85420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_008011	ATT	2	6	85449	85454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_008011	TATT	2	8	85530	85537	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_008011	TAT	7	21	85554	85574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_008011	ATT	2	6	85605	85610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_008011	T	6	6	85609	85614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_008011	TGT	2	6	85661	85666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_008011	AAT	2	6	85675	85680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_008011	TTA	2	6	85698	85703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_008011	TA	3	6	85717	85722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_008011	AGTA	2	8	85734	85741	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
633	NC_008011	ATACT	2	10	85754	85763	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
634	NC_008011	TAA	2	6	85777	85782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_008011	CTAAA	2	10	85785	85794	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
636	NC_008011	TA	3	6	85796	85801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_008011	GTTA	2	8	85802	85809	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
638	NC_008011	AGA	2	6	85819	85824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
639	NC_008011	TTA	3	9	86249	86257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_008011	TAAC	2	8	86263	86270	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
641	NC_008011	TAA	2	6	86276	86281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_008011	A	6	6	86290	86295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
643	NC_008011	G	6	6	86296	86301	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
644	NC_008011	TC	3	6	86309	86314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
645	NC_008011	T	7	7	86320	86326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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