MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 8162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_008011	AGT	2	6	1057653	1057658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_008011	TATT	2	8	1058306	1058313	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_008011	AAT	2	6	1058318	1058323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_008011	TTAATA	2	12	1058335	1058346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_008011	T	6	6	1059580	1059585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_008011	AAT	2	6	1059613	1059618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_008011	T	6	6	1059643	1059648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_008011	GTA	2	6	1059649	1059654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_008011	TAT	2	6	1059690	1059695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_008011	ATT	2	6	1059696	1059701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_008011	CAA	2	6	1059715	1059720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_008011	TTC	2	6	1060832	1060837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_008011	T	6	6	1060844	1060849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_008011	TA	3	6	1060859	1060864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_008011	GAA	2	6	1060875	1060880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_008011	AT	3	6	1060883	1060888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_008011	A	8	8	1060903	1060910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_008011	TTA	2	6	1060916	1060921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_008011	T	8	8	1060925	1060932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_008011	TAT	2	6	1060940	1060945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_008011	T	6	6	1060952	1060957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_008011	T	7	7	1060974	1060980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_008011	AT	3	6	1060985	1060990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6028	NC_008011	GTAA	2	8	1061093	1061100	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6030	NC_008011	TCTT	2	8	1061115	1061122	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6031	NC_008011	TA	3	6	1061134	1061139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_008011	GTTTT	2	10	1061182	1061191	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_008011	AT	3	6	1061217	1061222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6036	NC_008011	A	6	6	1061265	1061270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_008011	AT	3	6	1061274	1061279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_008011	T	16	16	1061301	1061316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6041	NC_008011	ACA	2	6	1061488	1061493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_008011	CTG	2	6	1061501	1061506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6048	NC_008011	TTA	2	6	1061637	1061642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6051	NC_008011	TAC	2	6	1061699	1061704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_008011	ATA	2	6	1061706	1061711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_008011	TTA	2	6	1061720	1061725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_008011	T	6	6	1061726	1061731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_008011	AAT	2	6	1061733	1061738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6057	NC_008011	TAA	2	6	1061762	1061767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6061	NC_008011	AT	3	6	1061845	1061850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_008011	TAAA	2	8	1061870	1061877	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_008011	TAT	2	6	1061905	1061910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6065	NC_008011	TTA	2	6	1061938	1061943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6068	NC_008011	AT	3	6	1061977	1061982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_008011	TAA	3	9	1061991	1061999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6072	NC_008011	AAGA	2	8	1062058	1062065	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_008011	ATTA	2	8	1062087	1062094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6082	NC_008011	TGT	2	6	1062408	1062413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6084	NC_008011	GA	3	6	1062450	1062455	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6088	NC_008011	TAA	2	6	1062575	1062580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_008011	TTG	2	6	1062581	1062586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6094	NC_008011	TATT	2	8	1066501	1066508	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_008011	AT	3	6	1066517	1066522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_008011	AAC	3	9	1066617	1066625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6099	NC_008011	ATTC	2	8	1066696	1066703	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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6101	NC_008011	CTTT	2	8	1066787	1066794	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6102	NC_008011	T	8	8	1066792	1066799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_008011	AT	3	6	1068573	1068578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_008011	TA	6	12	1069005	1069016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_008011	TTAG	2	8	1069017	1069024	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6108	NC_008011	TAA	2	6	1069953	1069958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6112	NC_008011	A	6	6	1070030	1070035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_008011	TAGTT	2	10	1070058	1070067	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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6116	NC_008011	ATA	2	6	1070188	1070193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6118	NC_008011	A	8	8	1072903	1072910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_008011	TTTAT	2	10	1072932	1072941	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_008011	TTAT	2	8	1072955	1072962	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_008011	TTAG	2	8	1072969	1072976	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6130	NC_008011	TTG	2	6	1076821	1076826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_008011	T	6	6	1076849	1076854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6132	NC_008011	AAAT	2	8	1076856	1076863	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6133	NC_008011	TTTGG	2	10	1076975	1076984	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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