MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus salivarius UCC118 plasmid pMP118

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007930	TTGATC	2	12	2548	2559	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_007930	TTAACA	2	12	8676	8687	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_007930	TATACA	2	12	11446	11457	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_007930	TAAATA	2	12	17102	17113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007930	TGTAAA	2	12	17301	17312	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007930	AATTAT	2	12	30637	30648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007930	TACTAT	2	12	34434	34445	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_007930	ATTAAA	2	12	38320	38331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007930	AATAGT	2	12	57300	57311	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007930	GCACCA	2	12	60368	60379	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007930	ACAATA	2	12	61257	61268	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_007930	AGCCTA	2	12	63701	63712	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007930	ATTATA	2	12	64219	64230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007930	GTAACC	2	12	74529	74540	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007930	TGAACT	2	12	99672	99683	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_007930	TGTTGG	2	12	124916	124927	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007930	ATCAAA	2	12	126136	126147	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_007930	ACATCA	2	12	127923	127934	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_007930	GATTAA	2	12	128964	128975	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007930	ATTAAA	2	12	132796	132807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007930	TTTTTG	2	12	134806	134817	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007930	GTTTGC	2	12	136056	136067	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_007930	ATCTTT	2	12	138209	138220	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_007930	GTTTCA	2	12	138235	138246	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_007930	AAATCA	2	12	140135	140146	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_007930	ACTTTG	2	12	147692	147703	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_007930	ATTGAT	2	12	149871	149882	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007930	AAAATT	2	12	151710	151721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007930	TTGATG	2	12	157821	157832	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007930	CATTTA	2	12	160065	160076	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_007930	TTTAGC	2	12	188001	188012	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_007930	GTTACT	2	12	194873	194884	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_007930	ATAGTT	2	12	197424	197435	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007930	ATCTTC	2	12	199247	199258	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007930	TATTCT	2	12	207686	207697	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_007930	AGAATA	2	12	215158	215169	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007930	TTCCTA	2	12	215872	215883	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007930	TTCTCT	2	12	219938	219949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.