MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus salivarius UCC118 plasmid pMP118

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007930	ATTTG	2	10	2822	2831	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007930	TAAAT	2	10	4182	4191	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007930	AATAT	2	10	5055	5064	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007930	CTATA	2	10	6879	6888	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_007930	CTAAG	2	10	14075	14084	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_007930	ATTCT	2	10	29731	29740	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_007930	GTTCT	2	10	31726	31735	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_007930	AAAGT	2	10	32299	32308	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007930	TTTGG	2	10	32858	32867	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007930	AAAGA	2	10	34185	34194	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007930	AAAGT	2	10	34204	34213	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007930	ATAAA	2	10	38344	38353	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007930	ATTTA	2	10	48856	48865	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007930	GATAA	2	10	48900	48909	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007930	TTTAG	2	10	49264	49273	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007930	AACAA	2	10	49304	49313	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_007930	AAGAT	2	10	52406	52415	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007930	GCAAT	2	10	58144	58153	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_007930	CTTCT	2	10	58205	58214	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_007930	TTGAC	2	10	61140	61149	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_007930	TAAAA	2	10	62722	62731	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007930	AAATA	2	10	62775	62784	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007930	ATAAA	2	10	68834	68843	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007930	AAATT	2	10	69395	69404	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007930	ATAAA	2	10	72999	73008	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007930	AATTC	2	10	75947	75956	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_007930	AATGA	2	10	83387	83396	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007930	ATTTT	2	10	92564	92573	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007930	ATGTC	2	10	124167	124176	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_007930	AAATG	2	10	125483	125492	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007930	AAAAG	2	10	127113	127122	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007930	TATTT	2	10	128992	129001	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007930	TAAAA	2	10	135374	135383	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007930	AAATA	2	10	136556	136565	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007930	TAAAA	2	10	138065	138074	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007930	TTTTC	2	10	139562	139571	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_007930	ATTTT	2	10	141563	141572	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007930	TCTTT	2	10	148395	148404	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_007930	AATTT	2	10	148810	148819	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007930	GTTGA	2	10	148940	148949	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007930	ATTTT	2	10	149485	149494	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007930	TAAAT	2	10	149592	149601	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007930	TGTTT	2	10	149859	149868	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007930	TATAA	2	10	151150	151159	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007930	TTTTA	2	10	159783	159792	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007930	TTATA	2	10	159943	159952	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007930	ATTAA	2	10	160410	160419	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007930	TTTTA	2	10	161594	161603	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007930	TTAAA	2	10	164813	164822	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007930	ATTTT	2	10	164981	164990	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007930	ATAAA	2	10	169020	169029	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007930	ATTAA	2	10	176252	176261	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007930	TCATT	2	10	176422	176431	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_007930	CACGA	2	10	178512	178521	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_007930	ATTTT	2	10	187901	187910	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007930	ATTTA	2	10	187959	187968	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007930	TTTTA	2	10	189245	189254	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007930	ATTTT	2	10	194286	194295	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007930	TAAAA	2	10	194504	194513	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007930	AACAA	2	10	194980	194989	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_007930	ATTTT	2	10	198679	198688	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007930	AAGTA	2	10	207066	207075	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007930	GTATA	2	10	221056	221065	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007930	TAATT	2	10	224261	224270	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007930	TCATT	2	10	226362	226371	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_007930	AAAGT	2	10	226443	226452	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007930	ATAAA	2	10	236200	236209	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007930	AAAGA	2	10	237069	237078	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007930	AAAAT	2	10	239730	239739	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007930	TTTTA	2	10	242005	242014	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.