MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus salivarius UCC118 plasmid pMP118

Total Repeats: 1597

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_007930	TAT	2	6	218747	218752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_007930	ATT	2	6	218764	218769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_007930	ATG	2	6	218827	218832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_007930	T	6	6	218850	218855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_007930	ATGA	2	8	218921	218928	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_007930	AAAG	2	8	219440	219447	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_007930	TTTA	2	8	219489	219496	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_007930	TTCTCT	2	12	219938	219949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_007930	CAA	2	6	220006	220011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_007930	T	7	7	220013	220019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_007930	CTTC	2	8	220890	220897	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1512	NC_007930	T	7	7	220941	220947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_007930	AATT	2	8	220952	220959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_007930	TTTA	2	8	220981	220988	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_007930	ATT	2	6	221014	221019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_007930	TTG	2	6	221031	221036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_007930	T	8	8	221042	221049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_007930	GTATA	2	10	221056	221065	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_007930	T	6	6	223601	223606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_007930	AAG	2	6	223609	223614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_007930	TCT	2	6	223618	223623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_007930	TAATT	2	10	224261	224270	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_007930	T	6	6	224269	224274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_007930	AT	3	6	224290	224295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_007930	AGA	2	6	224300	224305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_007930	ATT	2	6	224320	224325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_007930	ATC	2	6	224332	224337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_007930	AAT	2	6	224381	224386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_007930	T	6	6	224408	224413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_007930	TAGT	2	8	225914	225921	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_007930	ACTA	2	8	225938	225945	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1532	NC_007930	CT	3	6	226073	226078	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1533	NC_007930	TCATT	2	10	226362	226371	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1534	NC_007930	AAAGT	2	10	226443	226452	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_007930	ACT	2	6	226464	226469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_007930	T	7	7	226469	226475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_007930	TTA	2	6	226494	226499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_007930	ACT	2	6	226500	226505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_007930	T	8	8	226530	226537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_007930	A	6	6	228490	228495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_007930	T	6	6	228596	228601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_007930	CCT	2	6	230632	230637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1543	NC_007930	TAT	2	6	231335	231340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_007930	ACA	2	6	231369	231374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_007930	TCA	2	6	231382	231387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_007930	TA	3	6	231395	231400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_007930	A	6	6	231400	231405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_007930	AAT	2	6	231489	231494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_007930	TAT	2	6	231567	231572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_007930	TC	3	6	231595	231600	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1551	NC_007930	ATT	2	6	231622	231627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_007930	CCA	2	6	231632	231637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1553	NC_007930	TA	4	8	231638	231645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_007930	ATTT	2	8	231716	231723	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_007930	ATC	2	6	234486	234491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_007930	TAA	2	6	236054	236059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_007930	C	6	6	236102	236107	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1558	NC_007930	T	6	6	236114	236119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_007930	A	6	6	236132	236137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_007930	T	6	6	236149	236154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_007930	TAA	2	6	236181	236186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_007930	ATAAA	2	10	236200	236209	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_007930	ATT	2	6	237014	237019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_007930	CTT	2	6	237026	237031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_007930	T	10	10	237030	237039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_007930	TTA	2	6	237043	237048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_007930	TA	3	6	237047	237052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_007930	AAAGA	2	10	237069	237078	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_007930	AAC	2	6	239497	239502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_007930	TAT	2	6	239548	239553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_007930	TTA	2	6	239564	239569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_007930	TAT	2	6	239575	239580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_007930	GTA	2	6	239659	239664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_007930	ACC	2	6	239696	239701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1575	NC_007930	CAA	2	6	239712	239717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_007930	A	6	6	239716	239721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_007930	AAAAT	2	10	239730	239739	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_007930	A	6	6	241165	241170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_007930	TAT	2	6	241658	241663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_007930	AT	3	6	241662	241667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_007930	AAAT	2	8	241700	241707	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_007930	AT	4	8	241730	241737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_007930	A	6	6	241743	241748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_007930	CTT	2	6	241912	241917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_007930	T	7	7	241916	241922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_007930	TTC	2	6	241939	241944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_007930	TTTTA	2	10	242005	242014	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_007930	TTG	2	6	242074	242079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_007930	A	7	7	242080	242086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_007930	TTC	2	6	242125	242130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_007930	TAA	2	6	242136	242141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_007930	TA	3	6	242152	242157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_007930	TTA	2	6	242180	242185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_007930	T	6	6	242291	242296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_007930	ATTC	2	8	242320	242327	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1596	NC_007930	ATT	2	6	242340	242345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_007930	TAA	2	6	242361	242366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.