MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus salivarius UCC118 chromosome

Total Repeats: 1012

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007929	GTAG	2	8	2964	2971	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007929	AAAG	2	8	3069	3076	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007929	AAGT	2	8	12799	12806	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007929	CAAT	2	8	12814	12821	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007929	GTTA	2	8	12999	13006	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007929	AACA	2	8	13351	13358	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_007929	GTAC	2	8	13602	13609	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_007929	AGTG	2	8	15703	15710	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007929	TAGA	2	8	16256	16263	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007929	ATTT	2	8	16297	16304	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007929	TAAA	2	8	16310	16317	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007929	ATAA	2	8	16378	16385	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007929	TAAA	2	8	16850	16857	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007929	ATGA	2	8	19108	19115	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007929	AATT	2	8	19283	19290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007929	AAAG	2	8	24595	24602	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007929	AACT	2	8	25287	25294	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_007929	TGAC	2	8	26390	26397	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_007929	AAAT	2	8	28493	28500	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007929	TTAA	2	8	31484	31491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007929	AATT	2	8	31800	31807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007929	ATTA	2	8	34010	34017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007929	AAGC	2	8	36221	36228	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_007929	GTTA	2	8	36305	36312	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007929	CATC	2	8	36637	36644	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_007929	CCAT	2	8	37020	37027	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_007929	CTTG	2	8	37280	37287	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_007929	TTAT	2	8	37860	37867	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007929	TGAA	2	8	47072	47079	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007929	AATT	2	8	48159	48166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007929	ATTA	2	8	49187	49194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007929	AGAT	2	8	50600	50607	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007929	AATT	2	8	50807	50814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007929	TTGC	2	8	51576	51583	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_007929	GCAA	2	8	51584	51591	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_007929	GTCA	2	8	57318	57325	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_007929	TAGA	2	8	57479	57486	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007929	GATT	2	8	57502	57509	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007929	ATTT	2	8	58610	58617	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007929	GAAG	2	8	58807	58814	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007929	AAAC	2	8	58913	58920	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_007929	GAAG	2	8	59412	59419	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007929	GATA	2	8	59609	59616	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007929	ATCT	2	8	59856	59863	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_007929	TGGT	2	8	60215	60222	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007929	CTAA	2	8	60444	60451	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_007929	CGTA	2	8	60544	60551	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_007929	TCAT	2	8	64334	64341	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_007929	ATTA	2	8	64358	64365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007929	TAAT	2	8	65860	65867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007929	ATAA	2	8	70094	70101	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007929	TTAA	2	8	72536	72543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007929	CGAA	2	8	74575	74582	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_007929	GTGA	2	8	74936	74943	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007929	AGCC	2	8	75988	75995	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_007929	ATTT	2	8	76174	76181	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007929	GTAA	2	8	76369	76376	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007929	AGAA	2	8	76503	76510	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007929	TAGG	2	8	78416	78423	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007929	GTAA	3	12	79093	79104	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007929	ATCG	2	8	79177	79184	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_007929	GAAA	2	8	79222	79229	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007929	TTAA	2	8	82223	82230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007929	GAAG	2	8	82385	82392	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007929	AGGT	2	8	87704	87711	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007929	GATG	2	8	93343	93350	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007929	AGAT	2	8	95703	95710	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007929	AAAG	2	8	96230	96237	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007929	TTAT	2	8	96466	96473	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007929	TGTT	2	8	96552	96559	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007929	TAAT	2	8	96669	96676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007929	GCTT	2	8	96692	96699	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_007929	TAAA	2	8	97172	97179	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007929	AAAG	2	8	99551	99558	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007929	TTAT	2	8	105747	105754	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007929	CAGA	2	8	109055	109062	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_007929	TAAA	2	8	110804	110811	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007929	GGAA	2	8	114053	114060	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007929	CTAT	2	8	120941	120948	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_007929	CAAG	2	8	121755	121762	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_007929	GTTG	2	8	121823	121830	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007929	AAAG	2	8	122921	122928	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007929	TAAA	2	8	125151	125158	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007929	TTTA	2	8	125861	125868	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007929	TAAT	2	8	134414	134421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007929	AAAG	2	8	134970	134977	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007929	TAAA	2	8	142899	142906	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007929	ATTT	2	8	142986	142993	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007929	ATTA	2	8	144811	144818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007929	TAAT	2	8	146276	146283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007929	AGAT	2	8	155840	155847	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007929	ATTA	2	8	158637	158644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007929	TTAA	2	8	158931	158938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007929	TGAG	2	8	158979	158986	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007929	TTAG	2	8	159178	159185	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007929	AAAG	2	8	159278	159285	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007929	AGTT	2	8	159994	160001	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007929	TAGA	2	8	162758	162765	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007929	TTAC	2	8	162784	162791	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_007929	AAAT	2	8	162802	162809	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007929	TGAA	2	8	163638	163645	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007929	AAAT	2	8	165502	165509	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007929	AGAA	2	8	167214	167221	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007929	TTTA	2	8	167278	167285	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007929	AGGA	2	8	167731	167738	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007929	TAAT	2	8	168678	168685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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108	NC_007929	ACAA	2	8	169084	169091	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_007929	ATTA	2	8	169129	169136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007929	AAAC	2	8	169645	169652	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_007929	ACTC	2	8	169940	169947	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_007929	AATC	2	8	170168	170175	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_007929	ATTA	3	12	170260	170271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007929	GGTA	2	8	170464	170471	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007929	AATT	2	8	171150	171157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007929	AGAC	2	8	171750	171757	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_007929	TGTA	2	8	171966	171973	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007929	TTAA	2	8	172055	172062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007929	CCAG	2	8	172360	172367	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_007929	GCAA	2	8	172417	172424	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_007929	CAAT	2	8	172807	172814	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_007929	AGTT	2	8	173076	173083	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007929	CAGC	2	8	173351	173358	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_007929	TTGA	2	8	173378	173385	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007929	AACA	2	8	175425	175432	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_007929	CAAG	2	8	175477	175484	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_007929	AACA	2	8	175923	175930	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_007929	CAAG	2	8	175975	175982	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_007929	TAAT	2	8	176436	176443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007929	TTTA	2	8	183150	183157	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007929	ATTA	2	8	183194	183201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007929	GAAG	2	8	183212	183219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007929	AGGT	2	8	184049	184056	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007929	CTAT	2	8	187423	187430	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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136	NC_007929	GAAA	2	8	187550	187557	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007929	ATTT	3	12	193361	193372	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_007929	ATTG	2	8	195052	195059	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007929	TTTA	2	8	196921	196928	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007929	TAAA	2	8	196977	196984	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007929	CATA	2	8	200184	200191	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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147	NC_007929	GATA	2	8	214141	214148	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007929	TGGT	2	8	215765	215772	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007929	CGTT	2	8	215797	215804	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_007929	CGAA	2	8	217355	217362	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_007929	ATTT	2	8	217401	217408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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