MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus salivarius UCC118 chromosome

Total Repeats: 7734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007929	TAA	2	6	1381	1386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007929	CAA	2	6	1404	1409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007929	T	6	6	1439	1444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007929	CTA	2	6	1472	1477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007929	TAC	2	6	1479	1484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007929	TA	3	6	1489	1494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007929	AAT	2	6	1495	1500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007929	AT	3	6	1499	1504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007929	AT	4	8	1507	1514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007929	AGG	2	6	1516	1521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007929	TTA	2	6	2694	2699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007929	TA	3	6	2742	2747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007929	A	6	6	2747	2752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007929	TACTA	2	10	2759	2768	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_007929	ATC	2	6	2788	2793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007929	ACA	2	6	2799	2804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007929	GTC	2	6	2881	2886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_007929	A	6	6	2922	2927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007929	GTAG	2	8	2964	2971	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007929	A	6	6	3010	3015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007929	A	8	8	3040	3047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007929	AAAG	2	8	3069	3076	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007929	AGG	2	6	6432	6437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007929	T	8	8	9030	9037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007929	TTTTA	2	10	9046	9055	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007929	ATT	2	6	9065	9070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007929	AGG	2	6	9200	9205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007929	A	6	6	9526	9531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007929	AGG	2	6	9535	9540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007929	GAG	2	6	10107	10112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007929	TA	3	6	10388	10393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007929	T	6	6	10406	10411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007929	CTT	2	6	11290	11295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_007929	TAA	2	6	11323	11328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007929	AAT	2	6	11343	11348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007929	GAA	2	6	11356	11361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007929	TA	3	6	12442	12447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007929	T	7	7	12477	12483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007929	ATT	2	6	12560	12565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007929	AT	3	6	12612	12617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007929	AAT	2	6	12638	12643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007929	ATG	2	6	12708	12713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007929	T	7	7	12789	12795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007929	AAGT	2	8	12799	12806	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007929	CAAT	2	8	12814	12821	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_007929	TAG	2	6	12848	12853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007929	TCT	2	6	12894	12899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_007929	ACC	2	6	12934	12939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_007929	CTA	2	6	12982	12987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007929	GTTA	2	8	12999	13006	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007929	TTC	2	6	13015	13020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007929	CAA	2	6	13113	13118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007929	CAA	2	6	13131	13136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007929	GGA	2	6	13149	13154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007929	CTC	2	6	13186	13191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_007929	TAA	2	6	13232	13237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007929	CAT	2	6	13252	13257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_007929	CAA	2	6	13261	13266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_007929	CTG	2	6	13276	13281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007929	AAT	2	6	13335	13340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007929	AACA	2	8	13351	13358	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_007929	AAC	2	6	13381	13386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_007929	ACA	2	6	13436	13441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_007929	AAG	2	6	13450	13455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007929	ATT	2	6	13473	13478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007929	TAA	2	6	13490	13495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007929	T	6	6	13506	13511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007929	A	7	7	13523	13529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007929	ACT	2	6	13565	13570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_007929	ATT	2	6	13591	13596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007929	GTAC	2	8	13602	13609	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_007929	AT	3	6	13610	13615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007929	TAATAT	2	12	13623	13634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007929	GA	3	6	15635	15640	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007929	TTG	2	6	15657	15662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007929	A	6	6	15670	15675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007929	AGTG	2	8	15703	15710	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007929	CAT	3	9	15891	15899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_007929	ATT	2	6	15971	15976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007929	TAT	2	6	16045	16050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007929	TTA	2	6	16075	16080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007929	ACA	2	6	16098	16103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007929	TTA	2	6	16229	16234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007929	ACTTT	2	10	16237	16246	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_007929	ATT	2	6	16249	16254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007929	TAGA	2	8	16256	16263	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007929	GA	3	6	16270	16275	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007929	A	6	6	16289	16294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007929	ATTT	2	8	16297	16304	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007929	TAAA	2	8	16310	16317	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007929	A	6	6	16347	16352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007929	T	7	7	16368	16374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007929	ATAA	2	8	16378	16385	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007929	TAA	2	6	16398	16403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007929	ATT	3	9	16443	16451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007929	AGG	2	6	16452	16457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007929	ATT	2	6	16458	16463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007929	TAAA	2	8	16850	16857	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007929	TGGAAT	2	12	16868	16879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007929	CT	3	6	18800	18805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_007929	A	6	6	18833	18838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007929	TAA	2	6	18851	18856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007929	AAT	2	6	18881	18886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007929	A	6	6	18889	18894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007929	T	6	6	18962	18967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007929	TTA	2	6	19027	19032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007929	ACT	2	6	19068	19073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007929	TAA	2	6	19086	19091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007929	C	6	6	19092	19097	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
110	NC_007929	ATGA	2	8	19108	19115	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007929	T	6	6	19193	19198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007929	T	6	6	19203	19208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007929	AATT	2	8	19283	19290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007929	TTA	2	6	19304	19309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007929	GA	3	6	19652	19657	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007929	T	6	6	19669	19674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007929	TA	3	6	19680	19685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007929	T	6	6	19714	19719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007929	ATA	2	6	19734	19739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007929	A	6	6	23290	23295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007929	CAA	2	6	23304	23309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_007929	AGT	2	6	24549	24554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007929	CCTTT	2	10	24555	24564	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_007929	TAG	2	6	24588	24593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007929	AAAG	2	8	24595	24602	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007929	AAT	2	6	24606	24611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007929	TAA	3	9	24646	24654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007929	GA	3	6	24667	24672	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007929	AACT	2	8	25287	25294	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_007929	ATA	2	6	25302	25307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007929	T	6	6	25321	25326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007929	AG	4	8	25332	25339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007929	T	6	6	25346	25351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007929	A	6	6	26235	26240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007929	TAA	2	6	26242	26247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007929	TGA	2	6	26289	26294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007929	T	7	7	26305	26311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007929	TAT	2	6	26320	26325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007929	ATTAAA	2	12	26373	26384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007929	TGAC	2	8	26390	26397	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_007929	AT	3	6	26413	26418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007929	ACA	2	6	26432	26437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_007929	T	6	6	28412	28417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007929	ACA	2	6	28462	28467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_007929	AAAT	2	8	28493	28500	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007929	GTT	2	6	28509	28514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007929	AAAAAT	2	12	29609	29620	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007929	TAA	2	6	31478	31483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007929	TTAA	2	8	31484	31491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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